በEcoRI እና HindIII መገደብ ኢንዛይሞች መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ኢኮሪአይ ከኢ.ኮላይ የተነጠለ አይነት II መገደብ ኢንዛይም ሲሆን HindIII ደግሞ ከሄሞፊለስ ኢንፍሉዌንዛ የሚለይ የ II ክልከላ ኢንዛይም ነው።
የመገደብ ኢንዛይም ወይም ገደብ ኢንዛይም ኢንዛይም ነው ዲኤንኤን በዲኤንኤ ሞለኪውል ውስጥ በሚገኙ ልዩ እውቅና ቦታዎች (የገደብ ቦታዎች) ወደ ቁርጥራጮች የሚከፋፍል ኢንዛይም ነው። እነዚህ እገዳ ኢንዛይሞች በባክቴሪያ እና በአርኬያ ውስጥ ይገኛሉ. ቫይረሶችን ከመውረር የመከላከል ዘዴን ይሰጣሉ. እገዳ ኢንዛይሞች በአጠቃላይ በአምስት የተለያዩ ዓይነቶች ይከፈላሉ፡ ዓይነት I፣ ዓይነት II፣ ዓይነት III፣ IV እና V ዓይነት።EcoRI እና HindIII የ II ዓይነት ገደብ ኢንዛይሞች ቡድን አባል የሆኑ ሁለት ገደቦች ኢንዛይሞች ናቸው።
የEcoRI ገደብ ኢንዛይሞች ምንድን ናቸው?
EcoRI ከኢ.ኮሊ ዝርያዎች የተነጠለ የ II ክልከላ ኢንዛይም ነው። የዲኤንኤ ድርብ ሄሊሲስን በተወሰኑ ቦታዎች ላይ ወደ ቁርጥራጭ የሚከፋፍል ገደብ ያለው ኢንዛይም ነው። EcoRI እንዲሁ የእገዳ-ማሻሻያ ስርዓት አካል ነው። EcoRI በመጀመሪያ ከ RY13 የ E. coli ዝርያዎች የተነጠለ የመጀመሪያው ኢንዛይም ነበር. በሞለኪውላር ባዮሎጂ ውስጥ እንደ ገደብ ኢንዛይም ጥቅም ላይ ይውላል. EcoRI 4 ኑክሊዮታይድ ተጣባቂ ጫፎችን ከ AATT 5' ጫፍ በላይ ማንጠልጠያዎችን ይፈጥራል። EcoRI ዲኤንኤውን በተወሰነው የማወቂያ ቅደም ተከተል G↓AATTC ይቆርጣል። የCTTAA↓G ፓሊንድሮሚክ ማሟያ ቅደም ተከተል አለው። ከዚህም በላይ ይህ ገደብ ኢንዛይም የ II ፒ ዓይነት (palindromic specificity) ንዑስ ክፍል ነው። በዋና አወቃቀሩ ውስጥ፣ EcoRI ልክ እንደሌሎች መገደብ ኢንዛይሞች ሁሉ PD. D/EXK motif በውስጡ ንቁ ቦታ ይዟል።
ምስል 01፡ EcoRI
EcoRI ገደብ ኢንዛይም የ31 ኪሎ ዳ ሆሞዲመር ነው። የ α/β አርክቴክቸር አንድ ግሎቡላር ጎራ ይዟል። እያንዳንዱ ንዑስ ክፍል ከግሎቡላር ጎራ የሚወጣ እና ሲታሰር በዲ ኤን ኤ ዙሪያ የሚጠቀለል ሉፕ ይይዛል። ይህ ኢንዛይም በመደበኛነት በሚቆርጠው ቅደም ተከተል (cocrystalized) ሊሆን ይችላል። በተጨማሪም የ EcoRI ገደብ ኢንዛይም ክሎኒንግ፣ የዲኤንኤ ምርመራ እና የዲኤንኤ ውስጠ-ቪትሮ ሁኔታዎችን መሰረዝን ጨምሮ በተለያዩ የሞለኪውላር ጀነቲካዊ ቴክኒኮች ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል።
የሂንዱIII ገደብ ኢንዛይሞች ምንድን ናቸው?
HindIII ከሄሞፊለስ ኢንፍሉዌንዛ ዝርያዎች የሚለይ የ II አይነት ክልከላ ኢንዛይም ነው። የዲ ኤን ኤ ፓሊንድሮሚክ ቅደም ተከተል AACCTT በ cofactor Mg2+ በሃይድሮሊሲስ በኩል ይሰጣታል።በ AA'S (5'A↓ACCTT3' እና 3'TTCGA↓A5') መካከል ያለው የዚህ ልዩ ቅደም ተከተል መቆራረጡ ተለጣፊ ጫፎች በሚባለው የዲኤንኤ ሞለኪውል ላይ 5' በላይ ማንጠልጠያ ያስከትላል። ይህ ኢንዛይም እንደ ባክቴሪያ ባሉ ፕሮካርዮቲክ ፍጥረታት ውስጥ ይገኛል። ባክቴሪያዎች ይህን ኢንዛይም እንደ ባክቴሪዮፋጅስ ካሉ ቫይረሶች እንደ መከላከያ ዘዴ ይጠቀማሉ።
ምስል 02፡ HindIII
በመዋቅር፣ HindIII ሆሞዲመር ነው። እንደሌሎች የ II ገደብ ኢንዛይሞች አራት β ሉሆችን እና አንድ α ሄልስን ያካተተ የጋራ መዋቅራዊ ኮር ይዟል። የዚህ ኢንዛይም ሞለኪውላዊ ክብደት 34.9 ኪ.ዲ. በተጨማሪም HindIII በዘመናዊ ሞለኪውላር ባዮሎጂካል ሳይንስ ሙከራዎች እንደ ዲኤንኤ ቅደም ተከተል እና ካርታ ስራ በጣም ጠቃሚ ነው።
በEcoRI እና HindIII ገደብ ኢንዛይሞች መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- EcoRI እና HindIII የ II ክልከላ ኢንዛይም ቡድን ንብረት የሆኑ ሁለት ገደቦች ኢንዛይሞች ናቸው።
- EcoRI እና HindIII በ1970ዎቹ መጀመሪያ ላይ ተገኝተዋል።
- EcoRI እና HindIII ሁለቱም የPD.. D/EXK አሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል ሞቲፍ ይይዛሉ።
- ሁለቱም ገደብ ኢንዛይሞች የዲኤንኤ መቆራረጥን ያከናውናሉ።
- እነዚህ ገደቦች ኢንዛይሞች Mg2+ ለተለየ ተግባራቸው እንደ ተባባሪ ያስፈልጋቸዋል።
- ዲኤንኤን ከቆረጡ በኋላ የሚጣበቁ ጫፎችን ያመርታሉ።
- በዘመናዊ ሞለኪውላር ባዮሎጂካል ምርምር ውስጥ በጣም ጠቃሚ አካላት ናቸው።
በEcoRI እና HindIII ገደብ ኢንዛይሞች መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
EcoRI ዓይነት II ገደብ ኢንዛይም ሲሆን ከኤ.ኮሊ ዝርያዎች የተነጠለ ሲሆን HindIII ደግሞ ከሄሞፊለስ ኢንፍሉዌንዛ ዝርያ የተነጠለ የ II ክልከላ ኢንዛይም ነው። ስለዚህ, ይህ በ EcoRI እና HindIII መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው.በተጨማሪም፣ EcoRI ዲ ኤን ኤውን በተወሰነው የማወቂያ ቅደም ተከተል G↓AATTC ይቆርጣል፣ HindIII ደግሞ ዲኤንኤውን በልዩ መለያ ቅደም ተከተል A↓ACCTT ይቆርጣል።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በEcoRI እና HindIII መካከል ያለውን ልዩነት በጎን ለጎን ለማነፃፀር በሰንጠረዥ ያቀርባል።
ማጠቃለያ - EcoRI vs HindIII ገደብ ኢንዛይሞች
EcoRI እና HindIII የ II p ንዑስ ክፍል የሆኑ ሁለት ገደቦች ኢንዛይሞች ናቸው። እነሱ በጣም ልዩ የዲ ኤን ኤ መሰንጠቅን ያከናውናሉ. EcoRI ከኢ.ኮሊ ዝርያዎች የተነጠለ የ II ዓይነት ክልከላ ኢንዛይም ሲሆን HindIII ደግሞ ከሄሞፊለስ ኢንፍሉዌንዛ ዝርያዎች የሚለይ የ II ገደብ ኢንዛይም ነው። ስለዚህ፣ ይህ በEcoRI እና HindIII መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
