በCGH እና ድርድር CGH መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት CGH ባሕላዊ ሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ነው የሙከራ ናሙና ዝቅተኛ ጥራት ያለው በዲ ኤን ኤ ውስጥ ያለውን የቅጂ ቁጥር ልዩነትን ለመተንተን፣ ድርድር CGH ደግሞ ሙሉ በሙሉ በራስ ሰር የሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ነው ከፍተኛ ጥራት ያለው የሙከራ ናሙና በዲ ኤን ኤ ውስጥ የቅጂ ቁጥር ልዩነትን በመተንተን ላይ።
CGH እና ድርድር CGH የግለሰቦችን የቅጂ ቁጥር ልዩነቶችን ለመለየት ሁለት ቴክኒኮች ናቸው። የቅጂ ቁጥር ልዩነት የሚደጋገሙትን የጂኖም ክፍሎችን ይመለከታል። የቅጂ ቁጥር በግለሰቦች መካከል ይለያያል። የቅጂ ቁጥር ልዩነት በአጠቃላይ በሁለት ቡድን ይከፈላል፡ አጭር ድግግሞሾች እና ረጅም ድግግሞሾች።ለአጭር ቅጂ ቁጥር ልዩነት በጣም ከሚታወቁት ምሳሌዎች አንዱ የ CAG trinucleotide በአደንቲን ጂን ውስጥ መደጋገም ነው። ይህ huntingtin የሚባል የነርቭ በሽታ ያስከትላል. የረዥም ድግግሞሽ ቅጂ ቁጥር ልዩነት በጣም ጥሩው ምሳሌ የኢንሱሊን መቋቋምን የሚያስከትል የአልፋ አሚላሴ ጂን ነው። የቅጂ ቁጥር ልዩነት እንደ FISH፣ CGH እና ድርድር CGH ባሉ ቴክኒኮች ሊታወቅ ይችላል።
CGH ምንድን ነው?
CGH በዲ ኤን ኤ ውስጥ ያለውን የቅጂ ቁጥር ልዩነት ከማጣቀሻ ናሙና ጋር በማነፃፀር ለመተንተን ባህላዊ ሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ነው። ከአውቶሜትድ ቴክኒኮች ጋር ሲነፃፀር ዝቅተኛ ጥራት አለው. የዚህ ቴክኒክ አላማ ከተለያዩ ምንጮች የሚነሱ ሁለቱን የጂኖሚክ ዲኤንኤ ናሙናዎችን በፍጥነት እና በብቃት ማወዳደር ነው።
ምስል 01፡ CGH
አሰራሩ ዲኤንኤን ከሁለት ምንጮች መነጠልን ያካትታል፡ ሙከራ እና ማጣቀሻ። በመቀጠል የሚቀጥለው እርምጃ የዲኤንኤ ናሙናዎችን የመፈተሽ እና የተለያየ ቀለም ያላቸው ፍሎሮፎሮች ያሉት ራሱን የቻለ መለያ ምልክት ማድረግ ነው። በኋላ፣ ነጠላ-ገመድ ያለው የዲኤንኤ ናሙናዎችን ለማግኘት ሁለቱ የዲኤንኤ ናሙናዎች ተከልክለዋል። በመጨረሻም፣ ሁለቱ የውጤት ዲኤንኤ ናሙናዎች በ1፡1 ጥምርታ ከመደበኛው የክሮሞሶም የሜታፋዝ ስርጭት ጋር መቀላቀል ተደረገ። የክሮሞሶም ልዩነት በፍሎረሰንስ ማይክሮስኮፕ እና በኮምፒተር ሶፍትዌር በመጠቀም በሁለቱ ምንጮች መካከል ሊታወቅ ይችላል። በተጨማሪም፣ የCGH ቴክኒክ ሚዛኑን ያልጠበቁ የክሮሞሶም እክሎችን ብቻ ነው ማወቅ የሚችለው።
አርራይ CGH ምንድን ነው?
አርራይ CGH በዲ ኤን ኤ ውስጥ ያለውን የቅጂ ቁጥር ልዩነት ከማጣቀሻ ናሙና ጋር በማነፃፀር ሙሉ በሙሉ በራስ ሰር የሚሰራ የሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ነው። ከፍተኛ ጥራት ያለው ሲሆን የባህላዊ CGH ውስንነቶችን ለመቀነስ ነው የተሰራው። Array CGH የ CGH መርሆችን ከማይክሮ አራሪዎች አጠቃቀም ጋር ያጣምራል።ይህ ዘዴ የሜታፋዝ ክሮሞሶም ስርጭትን ከመጠቀም ይልቅ በትንሽ ዲ ኤን ኤ የተደረደሩ ስላይዶችን እንደ ኢላማዎች ይጠቀማል። እነዚህ ማይክሮአራሪዎች የተሰሩት በጠንካራ መስታወት ድጋፍ ላይ ትንሽ መጠን ያለው ዲ ኤን ኤ (መመርመሪያዎች) በማስቀመጥ እና በማንቀሳቀስ ነው። የመመርመሪያዎቹ መጠን ከ oligonucleotide ወደ ባክቴሪያ ሰራሽ ክሮሞሶም ሊለያይ ይችላል።
ምስል 02፡ አደራደር CGH
መመርመሪያዎች ምንም ቢሆኑም፣ CGH መሰረታዊ የድርድር ዘዴ ከCGH ጋር ተመሳሳይ ነው። ማይክሮ አራራይን የያዙ መመርመሪያዎች ከተዘጋጁ በኋላ ሁለቱ የዲኤንኤ ናሙናዎች (ሙከራ እና ማጣቀሻ) የተለያየ ቀለም ባላቸው ፍሎሮፎሮች የተለጠፈ አንድ ላይ ይደባለቃሉ እና ወደ ማይክሮ አራራይ ይጨምራሉ። በናሙናዎቹ ውስጥ ያለው ዲ ኤን ኤ በ denaturation ምክንያት ነጠላ-ክር ስለሆነ ይህ ዲ ኤን ኤ በተደረደሩ ነጠላ-ክር መመርመሪያዎች ይቀላቀላል። የዲጂታል ኢሜጂንግ ሲስተም በመጠቀም በሁለቱ ምንጮች መካከል ያለውን የክሮሞሶም ልዩነት መለየት ይቻላል።
በCGH እና Array CGH መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- CGH እና ድርድር CGH የቅጂ ቁጥር ልዩነቶችን ለመለየት ሁለት ቴክኒኮች ናቸው።
- ሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴዎች ናቸው።
- ሁለቱም ዘዴዎች ሚዛናዊ ያልሆኑ የክሮሞሶም እክሎችን ይመረምራሉ።
- Fluorophores በሁለቱም ዘዴዎች ይሳተፋሉ።
- ሁለቱም ዘዴዎች በቅጂ ቁጥር ልዩነት ምክንያት የዘረመል በሽታዎችን ለመለየት ጥቅም ላይ ሊውሉ ይችላሉ።
- በንፅፅር ጂኖሚክ ትንታኔ በስፋት ጥቅም ላይ ይውላሉ።
በCGH እና ድርድር CGH መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
CGH ዝቅተኛ ጥራት ያለው የሙከራ ናሙና በዲ ኤን ኤ ውስጥ የቅጂ ቁጥር ልዩነትን ለመተንተን ባህላዊ ሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ሲሆን ድርድር CGH ደግሞ ሙሉ በሙሉ በራስ ሰር የሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ነው። ከፍተኛ ጥራት ያለው. ስለዚህ፣ ይህ በCGH እና ድርድር CGH መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።በተጨማሪም፣ በCGH ውስጥ፣ የዲኤንኤ ናሙናዎች በመፈተሽ እና በማጣቀስ በተለመደው የክሮሞሶም የሜታፋዝ ስርጭት ያዳቅላሉ፣ ነገር ግን በተደራጁ CGH፣ የፈተና እና የማጣቀሻ ዲ ኤን ኤ ናሙናዎች ማይክሮ አራራይ ከያዙ የማይንቀሳቀሱ የዲ ኤን ኤ መመርመሪያዎች ጋር ይደባለቃሉ።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በCGH እና ድርድር CGH መካከል ያለውን ልዩነት በጎን ለጎን ለማነጻጸር ይዘረዝራል።
ማጠቃለያ – CGH vs Array CGH
CGH እና array CGH ሚዛናዊ ያልሆኑ የክሮሞሶም እክሎችን ለመለየት ሁለት ሞለኪውላዊ ሳይቶጄኔቲክ ቴክኒኮች ናቸው። በንፅፅር ጂኖሚክ ትንታኔ ውስጥ በሰፊው ጥቅም ላይ ይውላሉ. CGH ዝቅተኛ ጥራት ያለው የሙከራ ናሙና በዲ ኤን ኤ ውስጥ የቅጂ ቁጥር ልዩነትን ለመተንተን ባህላዊ ሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ነው። በአንፃሩ፣ ድርድር CGH ከፍተኛ ጥራት ያለው የሙከራ ናሙና በዲ ኤን ኤ ውስጥ ያለውን የቅጅ ቁጥር ልዩነት ለመተንተን ሙሉ በሙሉ በራስ ሰር የሚሠራ ሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ዘዴ ነው። ስለዚህ፣ ይህ በCGH እና ድርድር CGH መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
