በ FISH እና CGH መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ዓሳ በፍሎረሰንት ምልክት የተደረገባቸውን መመርመሪያዎችን በመጠቀም በክሮሞሶም ላይ የተወሰነ የዲኤንኤ ቅደም ተከተል የሚያውቅ ሞለኪውላዊ ቴክኒክ ሲሆን CGH በጂኖም ዲ ኤን ኤ ውስጥ ለውጦችን የሚያውቅ ሞለኪውላዊ ሳይቶጄኔቲክ ቴክኒክ ነው።
የሳይቶጄኔቲክ ትንተና የክሮሞሶም እክሎችን እንደ አኔፕሎይድስ፣ ስረዛ፣ ማባዛትና ማስተካከያ ወዘተ ሲለይ በህክምና ውስጥ ትልቅ ሚና ይጫወታል። ሲንድሮም, ሉኪሚያ, ወዘተ ከላይ የተጠቀሱትን ጉድለቶች እና በሽታዎች ለመለየት የተለያዩ ሞለኪውላር ሳይቲጄኔቲክ ዘዴዎች አሉ.ከነሱ መካከል፣ FISH (ፍሎረሰንት in situ hybridization) እና CGH (comparative genomic hybridization) ሁለት ኃይለኛ የማዳቀል ዘዴዎች ናቸው። ሆኖም ሁለቱም ዘዴዎች ጥቅማጥቅሞች እና ጉዳቶች አሏቸው።
ዓሣ ምንድነው?
FISH በአንድ ክፍል ወይም በቲሹ ክፍል ላይ በጠቅላላው ቲሹ ወይም ህዋሶች ላይ የሚሰራ ኑክሊክ አሲድ የማዳቀል ዘዴ ነው። በምርመራ ላይ የተመሰረተ ዘዴ ነው. ቴክኒኩ የሚመረኮዘው በዋትሰን ክሪክ ማሟያ ቤዝ ማጣመር ንድፈ ሃሳብ ላይ ሲሆን በዚህም ምክንያት ዲኤንኤ - ዲኤንኤ ዲቃላ ወይም ዲ ኤን ኤ - አር ኤን ኤ ዲቃላዎችን ያስከትላል፣ በዚህም ሚውቴሽን ጂኖችን መለየት ወይም የፍላጎት ጂን መለየት ይችላል። በተጨማሪም ይህ ዘዴ ነጠላ የዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን፣ ባለ ሁለት መስመር የዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን፣ ነጠላ-ፈትል አር ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን ወይም ሰው ሰራሽ ኦሊጎኑክሊዮታይድን ኒክ ትርጉምን በመጠቀም ከጂን ቅደም ተከተሎች ፍላጎት ጋር የሚጣጣሙ መመርመሪያዎችን ይጠቀማል። በተጨማሪም ፣ የዚህ ዘዴ በጣም አስፈላጊው ባህሪ የፍተሻዎችን በፍሎረሰንት ማቅለሚያዎች ላይ ምልክት ማድረግ ነው። ስለዚህ መመርመሪያዎቹ ከክሮሞሶም ተጨማሪ ክፍሎች ጋር ይተሳሰራሉ እና በቀላሉ ለማወቅ ያደርጉታል።
በተጨማሪም፣ FISH በጣም ሚስጥራዊነት ያለው እና የተለየ ዘዴ ነው። ስለሆነም በሄማቶሎጂካል አደገኛ በሽታዎች እና በጠንካራ እጢዎች ላይ በምርምርም ሆነ በመመርመር የተለመደ ዘዴ ነው. ነገር ግን, FISH ዝቅተኛ ጥራት ያሳያል. እንዲሁም የምርመራ ቅደም ተከተሎችን ለመንደፍ ስለ ዒላማው መዛባት አስቀድሞ ማወቅን ይጠይቃል።
ስእል 01፡ FISH
የፊሽ ብዙ አፕሊኬሽኖች አሉ በተለይም በተላላፊ በሽታዎች ሞለኪውላዊ ምርመራ በሽታ አምጪ ተህዋሲያን መኖርን ለመለየት እና በሽታ አምጪ ተህዋሲያን በሞለኪውላር ምርመራ ለማረጋገጥ። ከዚህም በላይ ዓሳ በልማት ባዮሎጂ፣ ካሪዮታይፒንግ እና ፋይሎጄኔቲክ ትንታኔ እና የክሮሞሶም ፊዚካል ካርታዎች ውስጥ በብዛት ጥቅም ላይ የሚውል ቴክኒክ ነው።
CGH ምንድን ነው?
Comparative genomic hybridization (CGH) ሌላው በዲኤንኤ ላይ የተመሰረተ ሞለኪውላር ሳይቶጄኔቲክ ቴክኒክ ሲሆን ይህም የጂኖም ዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን መለዋወጥ መለየት ይችላል።ዘዴው የክሮሞሶም እና የጂን ማሻሻያዎችን በጂኖሚክ ዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ላይ ያለውን ለውጥ ወይም ለውጥ ለመለየት የሚያስችል የላቀ ዘዴ ነው። በተጨማሪም CGH ከሙከራ ናሙና እና ከማጣቀሻ ናሙና የዲ ኤን ኤ መነጠል እና መከፋፈልን ይጠይቃል። ከዚያም, ናሙናዎቹ ሁለት የተለያዩ የፍሎረሰንት ማቅለሚያዎችን (አብዛኛውን ጊዜ ቀይ እና አረንጓዴ) በመጠቀም መሰየም አለባቸው. በኋላ, ሁለቱም ናሙናዎች የተቀላቀሉ እና ለተወዳዳሪ ድብልቅነት ይፈቀዳሉ. የመጨረሻው ደረጃ በዲ ኤን ኤ ውስጥ ለውጦችን ለምሳሌ እንደ ጂን ብዜት ፣ ጂን መጥፋት እና የመሳሰሉትን ናሙናዎች ትንተና ነው ። በተለይም በሙከራ ናሙና እና በመቆጣጠሪያ ናሙና መካከል ያለውን የዲኤንኤ ቅጂ ቁጥር ልዩነት ይለካል።
ምስል 02፡ CGH
ሌላ የCGH ስሪት አሁን አለ፤ ከተለመደው CGH የበለጠ የላቀ ዘዴ ነው. በድርድር ላይ የተመሰረተ CGH ወይም aCGH የሚባል ዘዴ ነው። aCGH በአንድ ሙከራ ውስጥ በብዙ ሺህ ቅደም ተከተሎች የጂን ወይም ተከታታይ ስረዛዎችን በትክክል መለየት ያስችላል።
በ FISH እና CGH መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- FISH እና CGH ሁለት ሞለኪውላዊ ቴክኒኮች ናቸው።
- ሁለቱም ዓሦች እና CGH በኒውክሊክ አሲድ ማዳቀል ላይ ይመረኮዛሉ።
- እንዲሁም ሁለቱም ቴክኒኮች የተወሰኑ የዲኤንኤ ኢላማዎችን ለማግኘት የተነደፉ መመርመሪያዎች ያስፈልጋቸዋል።
- ከወሊድ በፊት እና ድህረ ወሊድ የጄኔቲክ በሽታዎችን ለመመርመር እንጠቀምባቸዋለን።
- በተጨማሪም ሁለቱም FISH እና CGH የጂኖም ለውጦችን ለማጥናት በጣም ኃይለኛ መሳሪያዎች ናቸው።
- መመርመሪያዎችን ለመሰየም የፍሎረሰንት ማቅለሚያዎችን ይጠቀማሉ።
በ FISH እና CGH መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
FISH ልዩ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ለመለየት የፍሎረሰንት መመርመሪያዎችን የሚጠቀም በቦታው ውስጥ ያለ የማዳቀል ሂደት ሲሆን CGH ደግሞ የጂኖም ዲኤንኤ ተከታታይ ለውጦችን የሚያውቅ ሞለኪውላዊ ማዳቀል ቴክኒክ ነው። ስለዚህ፣ በ FISH እና CGH መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ይህ ነው።
ከዚህም በላይ፣ FISH የፍተሻ ቅደም ተከተሎችን ለመንደፍ ስለ ዒላማው መዛባት አስቀድሞ ማወቅን ይጠይቃል፣ CGH ቀድሞ እውቀትን አይፈልግም። እንዲሁም፣ በ FISH እና CGH መካከል ያለው ተጨማሪ ልዩነት FISH ውሱን ጥራት ሲያሳይ aCGH ከፍተኛ ጥራት ያሳያል።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በ FISH እና CGH መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
ማጠቃለያ - FISH vs CGH
FISH እና CGH የጂን የፍላጎት ቅደም ተከተሎችን ለመለየት የሚረዱ ሁለት ሞለኪውላዊ ሳይቶጄኔቲክ ቴክኒኮች ናቸው። FISH በፍሎረሰንት የተለጠፉ መመርመሪያዎችን በመጠቀም በክሮሞሶም ላይ የተወሰነ የዲኤንኤ ቅደም ተከተል እንዲገኝ ያመቻቻል CGH በጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ ውስጥ ለውጦችን ለመለየት ይረዳል። ስለዚህ፣ ይህ በ FISH እና CGH መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
