የቁልፍ ልዩነት - የባክቴሪያ ትራንስፖሴሲስ እና ሪትሮቫይራል ውህዶች
ተጓጓዥው የዘረመል ቁሶች ከአንድ ክልል ወደ ቀጣዩ ክልል ውስጥ እና በጂኖም መካከል ለመሸጋገር በሁለት ዋና ዋና ስልቶች ተሻሽሏል። አንደኛው ዘዴ የዲ ኤን ኤ ሞለኪውል ከመፈጠሩ በፊት በአር ኤን ኤ ሞለኪውል በኩል መፈናቀል ሲሆን ሌላኛው መንገድ ደግሞ የዲኤንኤ መካከለኛዎችን ያካትታል። ትራንስፖሴሶች እና የቫይረስ ውህደቶች የዚህ አይነት ሊተላለፉ የሚችሉ የጄኔቲክ ቁሶች ምሳሌዎች ናቸው። የባክቴሪያ ትራንስፖሴሶች ከትራንስፖሶኖች መጨረሻ ጋር ይጣመራሉ እና በተለያዩ ዘዴዎች ወደ ሌላ የጂኖም ክፍል እንዲሄዱ ያመቻቻሉ።Retroviral integrases እንደ ኤችአይቪ ያሉ የሬትሮ ቫይረስ ዘረመል ቁስ አካል ወደሚያጠቃው ሴል ዘረመል (ዲ ኤን ኤ) እንዲዋሃድ የሚረዱ ኢንዛይሞች ናቸው። ይህ በባክቴሪያ ትራንስፖሴሲስ እና ሬትሮቫይራል ውህደት መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
የባክቴሪያ ሽግግር ምንድናቸው?
Transposase በተለያዩ ዘዴዎች ወደ ሌላ የጂኖም ክፍል የሚደረገውን እንቅስቃሴ ወደ ሌላ የጂኖም ክፍል የሚያመቻች ኢንዛይም ከትራንስፖሶኖች መጨረሻ ጋር የተያያዘ ኢንዛይም ተብሎ ሊገለጽ ይችላል። እንደነዚህ ያሉት ዘዴዎች 'መቁረጥ እና መለጠፍ ዘዴ' እና 'ተባዛዊ የመለወጥ ዘዴ' ያካትታሉ. ትራንስፖሴስ በመጀመሪያ የጀመረው ለTn3 ትራንስፖሶን ሽግግር በሚያስፈልገው ኢንዛይም ክሎኒንግ አማካኝነት ነው። በጂኖም መካከል ወይም ከአንድ ቦታ ወደ ሌላ ቦታ ለመፈናቀል ሁለት አስፈላጊ ስልቶች በጄኔቲክ አካላት ሊተላለፉ ይችላሉ. የዲ ኤን ኤ ቅጂ ከመዋሃዱ በፊት በአር ኤን ኤ መካከል ያለው መጓጓዣ አንዱ ስልት ሲሆን ሌላኛው ደግሞ ከዲኤንኤ መሃከለኛዎች ጋር ብቻ የተያያዘ ነው.በሁለቱም ንጥረ ነገሮች ውህደት ውስጥ የተካተቱት የድጋሚ ውህደት ምላሾች የተከናወኑት በንጥረ-ተኮር ኢንዛይሞች ምክንያት ነው። ስለዚህ፣ በዲኤንኤ ኤለመንቶች ውስጥ፣ እነዚህ ኢንዛይሞች ትራንስፖሴስ በመባል ይታወቃሉ፣ በአር ኤን ኤ ኤለመንቶች ውስጥ ደግሞ ውህደቶች በመባል ይታወቃሉ።
በሁለቱም የመሸጋገሪያ ስልቶች መካከል ያለውን ልዩነት ሲያወዳድር፣የማስገባቱ ሂደት በኬሚካላዊ መልኩ አንድ አይነት ሆኖ ይታያል። ነገር ግን የቅርብ ጊዜ ማስረጃዎች እንደሚያመለክቱት የመዋሃድ ዘዴ ውስጥ የተወሰኑ ተመሳሳይነቶች ንቁ ቦታን በሚፈጥሩ የአሚኖ አሲድ ቅደም ተከተሎች ክልሎች ውስጥ ይታያሉ; የ DDE motif. በአሁኑ ጊዜ አምስት የትራንስፖሳሴስ ቤተሰቦች እየተከፋፈሉ ነው ነገር ግን የቤተሰቦቹ ቁጥር ገና በአዲስ transposase ቁምፊዎች እየጨመረ ነው። ቤተሰቦቹ DDE ትራንስፖሳሴ፣ ታይሮሲን (ዋይ) ትራንስፖሳሴ፣ ሴሪን (ኤስ) ትራንስፖሳሴ፣ ሮሊንግ ክብ ትራንስፖሳሴ፣ ሪቨርስ ትራንስክሪፕትሴስ/ኢንዶኑክሊየስ (RT/En) ወዘተ ያካትታሉ።የዲዲኢ ትራንስፖሴስ የመጀመሪያውን ትራንስፖሶን በመቁረጥ እና በመለጠፍ ሂደት ውስጥ ያካትታል እና ሶስት የተጠበቁ አሚኖ አሲዶችን ይይዛል ። aspartate (D)፣ aspartate (D) እና glutamate (E) ናቸው። የታይሮሲን ትራንስፖሳሶች እንዲሁ የታይሮሲን ቀሪዎችን በመጠቀም የመቁረጥ እና የመለጠፍ ዘዴን ያካትታሉ ፣ ይህም በጣቢያው ላይ ብቻ የተወሰነ ነው።
ምስል 01፡ የባክቴሪያ ሽግግር
የሴሪን ትራንስፖሴሶች መካከለኛ ክብ ዲኤንኤ የሚያካትቱ እና ልክ ከቤተሰብ በላይ የመቁረጥ እና የመለጠፍ ዘዴን ያካሂዳሉ። የሚሽከረከረው ክብ ትራንስፖሴስ አንድ ነጠላ ፈትል በቀጥታ በዲኤንኤ ብዜት ወደ ዒላማው ቦታ በሚገለበጥበት የመገልበጥ ዘዴ ውስጥ ያካትታል። ይህ የአብነት ፈትል እና የተቀዳው ፈትል አዲስ የተቀናጀ ፈትል እንዳላቸው ያረጋግጣል።የተገላቢጦሽ ትራንስክሪፕትሴስ/ኢንዶኑክሊየስ ትራንስፖሴሴስ የተለያዩ የመቀየር ዘዴዎች አሉት።
Retroviral Integrases ምንድናቸው?
በሪትሮቫይራል ኢንቴግሬስ አውድ ውስጥ እንደ ሬትሮቫይራል ኢንዛይም ይቆጠራል እንደ ሬትሮቫይረስ ያሉ የጂን ቁስ አካላት እንደ ኤችአይቪ ወደ ቫይረሱ ሴል ጄኔቲክ ቁስ (ዲ ኤን ኤ) ውስጥ እንዲቀላቀሉ ይረዳል። እነዚህ ሪትሮቫይራል ውህደቶች ብዙውን ጊዜ ከፋጌ ውህዶች ጋር ይደባለቃሉ። የphage integrases ምሳሌዎች λ phage integrase ናቸው። ነገር ግን እነዚህ ሙሉ ለሙሉ የተለያዩ ኢንዛይሞች ናቸው እና ግራ ሊጋቡ አይገባም. ሪትሮቫይራል ቅድመ-ውህደት ኮምፕሌክስ መፈጠርን በተመለከተ, ሪትሮቫይራል ውህደት ትልቅ ሚና ይጫወታል. ሬትሮቫይራል ውህደት ፕሮቲኖች በተለምዶ ሶስት (03) ቀኖናዊ ጎራዎችን ያቀፈ ነው። እነዚህ ጎራዎች በተለዋዋጭ ማገናኛዎች የተገናኙ ናቸው።
ሶስቱ ጎራዎች ኤን ተርሚናል ዚንክ-ማሰሪያ ጎራ ያካትታሉ ሶስት ሄሊካል ጥቅሎች የሚገናኙበት እና የሚረጋጉበት በZn2+ cation፣ RNase H fold ተሳትፎ በማስተባበር ነው። ካታሊቲክ ኮር ጎራ እና የ C ተርሚናል ዲ ኤን ኤ ማሰሪያ ጎራ፣ እሱም SH3 እጥፋት ነው።በምርመራ እና በባዮኬሚካላዊ እና መዋቅራዊ መረጃ, ሪትሮቫይራል ውህደት እንደ ዲመርስ (tetramer) የመሥራት ችሎታ እንዳለው ይጠቁማል. በመልቲሜራይዜሽን እና በቫይራል ዲ ኤን ኤ ትስስር አውድ ውስጥ፣ ሦስቱም የሪትሮቫይራል ጎራዎች ፕሮቲን ያዋህዳሉ። የሪትሮቫይራል ውህደት ዋና ተግባር የጄኔቲክ ቁሳቁሱን ወደ ዲ ኤን ኤ ውስጥ ማስገባት ነው። ይህ እርምጃ የኤችአይቪ ቫይረስ በቫይረስ መባዛት ውስጥ በጣም ወሳኝ እርምጃ ነው። በተሳካ ሁኔታ ከተዋሃደ በኋላ በሴል ክሮሞሶም ዲ ኤን ኤ ውስጥ በቀሪው የህይወት ዘመኑ ውስጥ ይኖራል።
ምስል 02፡ ሬትሮቫይራል ውህዶች
ስለዚህ፣ አንዴ ከተዋሃደ ለሕዋሱ ምንም መመለስ የለም። እነዚህ ሬትሮቫይራል ውህደቶች የ 3' የመጨረሻ ሂደትን እና የኮቫለንት ልገትን ጨምሮ ሁለት ዋና ዋና ግብረመልሶችን በማጣራት ላይ ያካትታሉ።በ 3 'ፍጻሜ ሂደት ውስጥ ከሁለቱም 3' የቫይረስ ዲ ኤን ኤ ጫፎች 2-3 ኑክሊዮታይዶች ይወገዳሉ የቫይራል ዲ ኤን ኤ 3' ጫፎች CA dinucleotides ለማሳየት በማሰብ እና በ covalent ligation ጊዜ የተቀነባበሩ 3' ጫፎች የቫይረስ ዲ ኤን ኤ ወደ አስተናጋጁ ክሮሞሶም ዲ ኤን ኤ ውስጥ ተጣብቋል።
በባክቴሪያ ትራንስፖሴሶች እና ሬትሮቫይራል ውህዶች መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
ሁለቱም የባክቴሪያ ትራንስፖሴሶች እና ሪትሮቫይራል ውህዶች ተመሳሳይ የአሚኖ አሲድ ቅደም ተከተሎች አሏቸው።
በባክቴሪያ ትራንስፖሴሶች እና ሬትሮቫይራል ውህዶች መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
የባክቴሪያ ትራንስፖሴሴስ vs ሪትሮቫይራል ውህዶች |
|
| Bacterial Transposase በተለያዩ መንገዶች ወደ ሌላ የጂኖም ክፍል የሚወስደውን እንቅስቃሴ ሲያመቻች ወደ ትራንስፖሶንስ መጨረሻ የታሰረ ኢንዛይም ነው። | Retroviral Integrases እንደ ሬትሮቫይራል ኢንዛይም ይቆጠራል እንደ ሬትሮቫይረስ ያሉ ዘረመል ቁሶች እንደ ኤች አይ ቪ ከተያዘው ሴል ዘረመል (ዲ ኤን ኤ) ጋር እንዲዋሃድ ይረዳል። |
| አስገዳጅ ክልሎች | |
| ለባክቴሪያ ትራንስፖርቶች ከፍተኛ ልዩ አስገዳጅ ክልሎች ያስፈልጋሉ። | የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ያነሰ ወይም ምንም አያስፈልግም። |
ማጠቃለያ - የባክቴሪያ ትራንስፖሴሶች ከሬትሮቫይራል ውህዶች
የባክቴሪያ ትራንስፖሴሶች እንደ ሬትሮቫይራል ኢንዛይም ተደርገው ይወሰዳሉ እንደ ሬትሮቫይረስ ያሉ የጂን ቁስ እንደ ኤችአይቪ ወደ ቫይረሱ ሴል ጄኔቲክ ቁስ (ዲ ኤን ኤ) ውስጥ እንዲዋሃድ ይረዳል። በጂኖም መካከል ወይም ከአንድ ቦታ ወደ ሌላ ቦታ ለመፈናቀል ሁለት አስፈላጊ ስልቶች በጄኔቲክ አካላት ሊተላለፉ ይችላሉ.በአሁኑ ጊዜ አምስት የትራንስፖሳሴስ ቤተሰቦች እየተከፋፈሉ ነው ነገር ግን የቤተሰቦቹ ቁጥር ገና በአዲስ transposase ቁምፊዎች እየጨመረ ነው። Retroviral Integrase፣ እንደ ሬትሮቫይራል ኢንዛይም ይቆጠራል፣ እንደ ሬትሮቫይረስ ያሉ የጂን ቁስ አካላት እንደ ኤችአይቪ በተያዘው ሕዋስ ውስጥ ወደ ዘረመል (ዲ ኤን ኤ) እንዲዋሃዱ ይረዳል። ሬትሮቫይራል ውህደት ፕሮቲኖች በተለምዶ ሶስት (03) ቀኖናዊ ጎራዎችን ያቀፈ ነው። የሪትሮቫይራል ውህደት ዋና ተግባር የጄኔቲክ ቁሳቁሱን ወደ ዲ ኤን ኤ ውስጥ ማስገባት ነው። ይህ እርምጃ የኤችአይቪ ቫይረስ በቫይረስ መባዛት ውስጥ በጣም ወሳኝ እርምጃ ነው። ስለዚህ, አንድ ጊዜ ከተዋሃደ ለሴሉ ምንም መመለስ የለም. ይህ በባክቴሪያ ትራንስፖሴሲስ እና ሬትሮቫይራል ውህደት መካከል ያለው ልዩነት ነው።
የባክቴሪያል ትራንስፖሴሴስ vs ሪትሮቫይራል ኢንቴግሬስ ፒዲኤፍ አውርድ
የዚህን ጽሁፍ ፒዲኤፍ ስሪት አውርደህ ከመስመር ውጭ አላማዎች በጥቅስ ማስታወሻ መጠቀም ትችላለህ። እባክዎ የፒዲኤፍ ሥሪቱን እዚህ ያውርዱ፡ በባክቴሪያ ትራንስፖሴሲስ እና ሬትሮቫይራል ውህዶች መካከል ያለው ልዩነት
