በሃሎሮሆዶፕሲን እና ባክቴሮሆዶፕሲን መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ሃሎሮሆዶፕሲን በብርሃን የሚመራ ክሎራይድ ፓምፕ በአርኪያ ውስጥ የሚገኝ ሲሆን ባክቴሮሆዶፕሲን ደግሞ በአርኬያ ውስጥ የሚገኝ በብርሃን የሚመራ የፕሮቶን ፓምፕ ነው።
Halorhodopsin እና bacteriorhodopsin የሄፕታሄሊካል ሽፋን ፕሮቲኖች ናቸው። በተጨማሪም አርኬያ ሮዶፕሲን በመባል ይታወቃሉ. በአጠቃላይ እነዚህ ሁለቱም በሃሎባክቲሪየም ሳሊናረም ሴል ሽፋን ውስጥ በሚገኝ ሐምራዊ ሽፋን ውስጥ ይገኛሉ. ሃሎርሆዶፕሲን በብርሃን የሚመራ ክሎራይድ ፓምፕ ሲሆን ions ከሴሉላር ክፍል ወደ ሳይቶፕላስሚክ ጎን እንዲፈስ ያስችላል። በሌላ በኩል ባክቴሮሆዶፕሲን በብርሃን የሚመራ ፕሮቶን ፓምፕ ሲሆን ይህም ionዎችን ከሳይቶፕላስሚክ ጎን ወደ ውጫዊ ክፍል እንዲፈስ ያስችለዋል.ስለዚህ halorhodopsin እና bacteriorhodopsin በአርኪያ ውስጥ በተለይም በ halobacteria ውስጥ የሚገኙ ሁለት በብርሃን የሚነዱ ion bumps ናቸው።
Halorhodopsin ምንድን ነው?
Halorhodopsin ከአርሴኦን ሃሎባክቲሪየም ሳሊናረም የተገኘ የረቲና ፕሮቲን ሲሆን የአረንጓዴ ብርሃን ሃይልን (ከ500 እስከ 650 nm) በመጠቀም ክሎራይድ ionዎችን ወደ ሴል ሽፋን እምቅ አቅም በማጓጓዝ። የፖታስየም ክሎራይድ የፖታስየም ክሎራይድ መጠን በ ions ፓምፖች እንደ halorhodopsin በሴል እድገት ወቅት የኦስሞቲክ ሚዛንን ለመጠበቅ አስፈላጊ ነው. ከዚህም በላይ በብርሃን የሚመራ አኒዮን ፓምፕ ከፍተኛ መጠን ያለው የሜታቦሊክ ኃይልን ይቆጥባል። ሃሎርሆዶፕሲን ወደ ሰባት-ትራንስሜምብራን ሄሊክስ ቶፖሎጂ ከአጫጭር እርስ በርስ የሚገናኙ ቀለበቶች አሉት። ሄልስ (ከሀ እስከ ጂ የተሰየሙት) ቅስት በሚመስል መዋቅር ውስጥ የተደረደሩ እና በሼፍ ቤዝ በኩል ወደ የተጠበቀው ላይሲን አሚኖ አሲድ (ላይስ-242) በሄሊክስ G ላይ ያለውን የሬቲናል ሞለኪውል አጥብቀው ከበቡ። ከቅሪቶች ጋር ለክሎራይድ ማስተላለፍ አስፈላጊ ነው.የአኒዮን ሊሆን የሚችል መንገድ ነው።
ሥዕል 01፡Halorhodopsin
በሃሎሮሆዶፕሲን የፎቶን መምጠጥ የካታሊቲክ ዑደት ያስጀምራል፣ ይህም አንዮን ወደ ሴል እንዲጓጓዝ ያደርጋል። ዑደቱ በስድስት እርከኖች የ isomerisation (I)፣ ion transport (T) እና ተደራሽነት ለውጥ (ስዊች ኤስ) ሊገለጽ ይችላል። በተጨማሪም የ halorhodopsin አወቃቀሩን እና ተግባርን ለመተንተን በጣም አስፈላጊው ዘዴ በሳይት-ተኮር ሙታጄኔሲስ እና ተመሳሳይ በሆነ ከመጠን በላይ መገለጽ የተሻሻለ ፕሮቲን የማምረት እድል ነው።
Bacteriorhodopsin ምንድን ነው?
Bacteriorhodopsin እንደ ሃሎባክቲሪየም ሳሊናረም ባሉ አርኬያ ውስጥ በብርሃን የሚመራ ፕሮቶን ፓምፕ በመባል ይታወቃል። Bacteriorhodopsin በአርኪዮ ጥቅም ላይ የሚውል ፕሮቲን ነው, በተለይም በ halobacteria, Euryarchaeota ክፍል.የብርሃን ሃይልን የሚይዝ እና ይህን ሃይል በመጠቀም ፕሮቶንን ከሴሉ ውስጥ ገለባ ለማንቀሳቀስ እንደ ፕሮቶን ፓምፕ ሆኖ ያገለግላል። የተገኘው የፕሮቶን ቅልመት በመቀጠል ወደ ኬሚካላዊ ኃይል ይቀየራል።
ምስል 02፡ Bacteriorhodopsin
Bacteriorhodopsin 27 ኪሎ ዳ ውህድ ሽፋን ፕሮቲን ነው። የባለ ስድስት ጎን ጥልፍልፍ ተደጋጋሚ አካል በሦስት ተመሳሳይ የፕሮቲን ሰንሰለቶች ያቀፈ ነው፣ እያንዳንዳቸው ከሌሎቹ አንፃር በ120 ዲግሪ ይሽከረከራሉ። በተጨማሪም፣ እያንዳንዱ ሞኖመር ሰባት ትራንስሜምብራን አልፋ-ሄሊስ እና ባለ ሁለት-ፈትል ቤታ-ሉህ ፊት ለፊት ያለው ውጫዊ ሴሉላር አለው። በተጨማሪም በዚህ የረቲን ፕሮቲን የሚመነጨው የፕሮቲን ተነሳሽነት ኃይል ኤቲፒን ለማመንጨት በ ATP synthase ይጠቀማል. ስለዚህ, bacteriorhodopsin ን በመግለጽ, የአርኬያ ሴሎች የካርቦን ምንጭ በማይኖርበት ጊዜ ኤቲፒን ማቀናጀት ይችላሉ.
በHalorhodopsin እና Bacteriorhodopsin መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- Halorhodopsin እና bacteriorhodopsin የሄፕታሄሊካል ሽፋን ፕሮቲኖች ንዑስ ቤተሰብ ናቸው።
- ሁለቱም የሬቲን ፕሮቲኖች ናቸው።
- እነሱም አርኬያ ሮሆዶፕሲንስ በመባል ይታወቃሉ።
- በብርሃን የሚነዱ የ ion bumps ናቸው።
- ሁለቱም የሃሎባክቲሪየም ሳሊናረም ሴል ሽፋን ክፍል በሆነው ሐምራዊ ሽፋን ውስጥ ይገኛሉ።
- ለሃሎባክቴሪያ መትረፍ በጣም ጠቃሚ የሆኑ ልዩ ተግባራት አሏቸው።
በHalorhodopsin እና Bacteriorhodopsin መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
ሃሎሮሆዶፕሲን በብርሃን የሚነዳ ክሎራይድ ፓምፕ በአርኪያ ውስጥ የሚገኝ ሲሆን ባክቴሪሮሆዶፕሲን ደግሞ በአርኬያ ውስጥ የሚገኝ በብርሃን የሚመራ የፕሮቶን ፓምፕ ነው። ስለዚህ, ይህ በ halorhodopsin እና bacteriorhodopsin መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው. በተጨማሪም ሃሎሮሆዶፕሲን በብርሃን የሚመራ ክሎራይድ ፓምፕ ሲሆን ions ከሴሉላር ወደ ሳይቶፕላስሚክ ጎን እንዲፈስ ያስችላል።በሌላ በኩል ባክቴሮሆዶፕሲን በብርሃን የሚመራ የፕሮቶን ፓምፕ ሲሆን ions ከሳይቶፕላዝም ወደ ውጫዊ ክፍል እንዲፈስ ያስችላል።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በ halorhodopsin እና bacteriorhodopsin መካከል ያለውን ልዩነት በጎን ለጎን ለማነፃፀር በሰንጠረዥ መልክ ያቀርባል።
ማጠቃለያ – Halorhodopsin vs Bacteriorhodopsin
Halorhodopsin እና bacteriorhodopsin በአርኬያ ውስጥ የሚገኙት በብርሃን የሚነዱ ሁለት ion ጉብታዎች ናቸው፣በተለይም ሃሎባክቴሪያ። ሃሎርሆዶፕሲን በብርሃን የሚመራ ክሎራይድ ፓምፕ ሲሆን ባክቴሪዮዶፕሲን ደግሞ በብርሃን የሚመራ ፕሮቶን ፓምፕ ነው። Halorhodopsin ion ፍሰት ከሴሉላር ወደ ሳይቶፕላስሚክ ጎን ይፈቅዳል። በአንጻሩ ባክቴሮሆዶፕሲን ion ከሳይቶፕላዝማሚክ ወደ ውጪያዊው ክፍል እንዲፈስ ያስችላል። ስለዚህ፣ ይህ በ halorhodopsin እና bacteriorhodopsin መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
