በኦሊጎፔፕቲድ እና በፖሊፔፕታይድ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ኦሊጎፔፕቲዶች ጥቂት የአሚኖ አሲድ ቅሪቶችን ሲይዙ ፖሊፔፕቲዶች ግን ብዙ የአሚኖ አሲድ ቅሪቶችን ይይዛሉ።
ኦሊጎፔፕቲድስ እና ፖሊፔፕቲድስ የሚሉት ቃላት በፕሮቲኖች ምድብ ስር ናቸው። Peptides የአሚኖ አሲዶች አጭር ሰንሰለቶች ናቸው። አሚኖ አሲዶች በፔፕታይድ ቦንድ በኩል እርስ በርስ ይተሳሰራሉ. ስለዚህ, በእነዚህ peptides ውስጥ በሚገኙ አሚኖ አሲዶች ብዛት መሰረት እነዚህን peptides ልንከፋፍላቸው እንችላለን. ለምሳሌ፡- ዲፔፕቲዶች፣ ትሪፕፕቲዶች፣ ቴትራፔፕቲዶች፣ ኦሊጎፔፕቲዶች እና ፖሊፔፕቲዶች።
ኦሊጎፔፕቲድ ምንድን ነው?
አንድ oligopeptide በአንድ ሞለኪውል ውስጥ አነስተኛ ቁጥር ያላቸው አሚኖ አሲዶችን የያዘ የአሚኖ አሲዶች ሰንሰለት ነው።ብዙውን ጊዜ እነዚህን ሞለኪውሎች እንደ አጠቃላይ ቃል "peptides" ብለን እንጠራቸዋለን. በእነዚህ የፔፕታይድ ሞለኪውሎች ውስጥ የሚገኙት የአሚኖ አሲድ ቅሪቶች ከሁለት እስከ ሃያ አሚኖ አሲዶች ሊደርሱ ይችላሉ። Oligopeptides እንደ dipeptides ፣ tripeptides ፣ ወዘተ ያሉ አንዳንድ ትናንሽ የፔፕታይድ ቅርጾችን ሊያካትት ይችላል።
ስእል 01፡ የTripeptide መዋቅር
እነዚህ ኦሊጎፔፕቲዶች የሚመረቱት ራይቦሶማል ባልሆኑ peptides synthases ወይም NRPS ነው። ግን አንዳንድ ልዩ ሁኔታዎች አሉ. ለምሳሌ, ሳይክላሚድ እና ማይክሮቪሪዲን በ ribosomic ጎዳናዎች የተዋሃዱ ናቸው. የ oligopeptides የማግለል ሂደት ኦሊጎፔፕቲድ ማበልጸግ, ማጽዳት እና መለየት ያካትታል. ለመለየት ሂደት, ጄል ክሮሞግራፊ, HPLC, HPLC-mass spectroscopy, ion-exchange chromatography, ወዘተ መጠቀም እንችላለን.
Polypeptide ምንድን ነው
አንድ ፖሊፔፕታይድ የአሚኖ አሲድ ቀሪዎች ሰንሰለት ሲሆን በውስጡም ብዙ አሚኖ አሲዶችን ይይዛል። አንድ ፕሮቲን አንድ ወይም ከዚያ በላይ የ polypeptide ሰንሰለቶችን ይዟል. በእነዚህ የ polypeptide ሰንሰለቶች ውስጥ፣ አሚኖ አሲዶች በፔፕታይድ ቦንዶች በኩል እርስ በርስ የተያያዙ ናቸው፣ እነዚህም የኮቫለንት ኬሚካላዊ ቦንዶች ናቸው። እያንዳንዱ የ polypeptide ሰንሰለት ሁለት ተርሚናሎችን ይይዛል-N-terminal እና C-terminal. ኤን-ተርሚናል አሚኖ-ተርሚናል ነው፣ እሱም በነጻ አሚኖ ቡድን ያበቃል፣ ሲ-ተርሚናል ደግሞ በነጻ የካርቦክሳይል ቡድን የሚያበቃው ካርቦክሲል-ተርሚናል ነው። በፔፕታይድ ውስጥ የሚገኙት የአሚኖ አሲዶች ቅደም ተከተል የሚወሰነው በኤምአርኤን ውስጥ በሚገኙ ኮዶች አማካኝነት ፖሊፔፕታይድ ወይም ፕሮቲን በማምረት ላይ በሚሳተፉት የአብነት ክር በመተርጎም ነው።
በፕሮቲን ውስጥ ባሉ የ polypeptides ብዛት እና አደረጃጀት መሰረት አራት ዋና ዋና የፕሮቲን አወቃቀሮች አሉ፡
- ዋና መዋቅር - የፕሮቲን ቀዳሚ መዋቅር አንድ ነጠላ የፖሊፔፕታይድ ሰንሰለት ይዟል፣ በአንድ ሰንሰለት ውስጥ ባሉ አንዳንድ አሚኖ አሲዶች መካከል ዳይሰልፋይድ ድልድይ ያለው ሲሆን ይህም የታጠፈ መዋቅር ይፈጥራል።
- ሁለተኛ ደረጃ መዋቅር - የፕሮቲን ሁለተኛ ደረጃ መዋቅር ሁለት ዋና ዋና ቅርጾች አሉት፡-የአልፋ ሄሊክስ መዋቅር እና የቤታ ሉህ መዋቅር።
ስእል 02፡ የአልፋ ሄሊክስ መዋቅር
- የሶስተኛ ደረጃ መዋቅር - ይህ በከፍተኛ ደረጃ የታጠፈ የአውታረ መረብ መዋቅር ነው። ይህ መዋቅር የፕሮቲን ተግባርን ስለሚወስን በጣም አስፈላጊ ነው።
- Quaternary structure - ይህ በጣም የተወሳሰበ የሁለት ወይም ሶስት ፖሊፔፕታይድ ሰንሰለቶች እርስ በርስ የተያያዙ መዋቅር ነው።
በOligopeptide እና Polypeptide መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Oligopeptides እና polypeptides ሁለት የተለያዩ የፕሮቲን ምድቦች ናቸው። በፕሮቲን ሞለኪውሎች ውስጥ በሚገኙ የአሚኖ አሲድ ቅሪቶች ላይ በመመስረት አንዳቸው ከሌላው ይለያያሉ.ስለዚህ በ oligopeptide እና በ polypeptide መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ኦሊጎፔፕቲዶች ጥቂት የአሚኖ አሲድ ቅሪቶችን ሲይዙ ፖሊፔፕቲዶች ግን ብዙ ቁጥር ያላቸው የአሚኖ አሲድ ቅሪቶችን ይይዛሉ።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በኦሊጎፔፕቲድ እና በፖሊፔፕታይድ መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
ማጠቃለያ – Oligopeptide vs. Polypeptide
Oligopeptides እና polypeptides ሁለት የተለያዩ የፕሮቲን ምድቦች ናቸው። በእነዚህ የፕሮቲን ሞለኪውሎች ውስጥ በሚገኙ የአሚኖ አሲድ ቅሪቶች ላይ በመመርኮዝ እርስ በርሳቸው ይለያያሉ. ይኸውም በኦሊጎፔፕቲድ እና በፖሊፔፕታይድ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ኦሊጎፔፕቲዶች ጥቂት የአሚኖ አሲድ ቅሪቶችን ሲይዙ ፖሊፔፕቲዶች ግን ብዙ ቁጥር ያላቸው የአሚኖ አሲድ ቅሪቶችን ይይዛሉ።
