በተመሳሳይነት እና በማንነት መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ መመሳሰል (መመሳሰል) በንፅፅር በሁለት ተከታታዮች መካከል ያለው ተመሳሳይነት (መመሳሰል) ሲሆን ማንነት ግን በሁለት የተለያዩ ቅደም ተከተሎች መካከል በትክክል የሚዛመዱ የቁምፊዎች ብዛት ነው።
Bioinformatics በዋናነት ሞለኪውላር ባዮሎጂ እና ጄኔቲክስ፣ ኮምፒውተር ሳይንስ፣ ሂሳብ እና ስታስቲክስን የሚያጠቃልል ሁለገብ የሳይንስ ዘርፍ ነው። ተከታታይ አሰላለፍ በባዮኢንፎርማቲክስ ውስጥ ዋና ቃል ነው። የዲ ኤን ኤ ፣ አር ኤን ኤ ወይም ፕሮቲን ተመሳሳይነት ያላቸውን ክልሎች ለመለየት የተደረደሩበት ሂደት ነው ፣ ይህም በቅደም ተከተል መካከል ያለው ተግባራዊ ፣ መዋቅራዊ ወይም የዝግመተ ለውጥ ግንኙነት ውጤት ነው።በአሰላለፉ መጨረሻ ላይ በማትሪክስ ውስጥ እንደ ረድፎች ይቀርባሉ. ተመሳሳይ ቁምፊዎችን በተከታታይ ኮሎሞች ውስጥ ለማመጣጠን፣ የገቡ ክፍተቶች በቅሪዎቹ መካከል አሉ።
መመሳሰል ምንድነው?
በተከታታይ አሰላለፍ ውስጥ ያለው ተመሳሳይነት ሲወዳደር በሁለት ተከታታዮች መካከል ያለው ተመሳሳይነት ነው። ይህ እውነታ በቅደም ተከተል ማንነት ላይ የተመሰረተ ነው. ተመሳሳይነት ቅሪቶቹ ምን ያህል እንደተደረደሩ ያሳያል። ስለዚህ, ተመሳሳይ ቅደም ተከተሎች ተመሳሳይ ባህሪያት አላቸው. በባዮኢንፎርማቲክስ፣ መመሳሰል በሁለት ፕሮቲኖች መካከል ያለውን ተመሳሳይነት ለመገምገም የሚያስችል መሳሪያ ነው።
ስእል 01፡ ተመሳሳይነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ
የተከታታይ አሰላለፍ ሂደት ሁለት ዋና ደረጃዎች አሉ። የመጀመርያው እርምጃ ጥንድ ጥበባዊ አሰላለፍ ነው፣ ይህም እንደ BLAST፣ FastA እና LALIGN ያሉ ስልተ ቀመሮችን በመጠቀም በሁለት ተከታታዮች መካከል ያለውን ጥሩ አሰላለፍ (ክፍተቶችን ጨምሮ) ለማግኘት ይረዳል።የሚዛመደው ስልተ ቀመር አነስተኛውን የአርትዖት ስራዎች ብዛት ያገኛል; አንድን ቅደም ተከተል ከሌላው ቅደም ተከተል ጋር ለማጣመር in-dels እና ተተኪዎች። ጥንድ ጥበባዊ አሰላለፍ በኋላ፣ ከእያንዳንዱ ጥንድ ጥበበኛ ንጽጽር ሁለት የቁጥር መለኪያዎችን ማግኘት ያስፈልጋል። ማንነት እና መመሳሰል ናቸው።
ማንነት ምንድን ነው?
ማንነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ ላይ ያለው የቁምፊዎች ብዛት በትክክል በሁለት የተለያዩ ተከታታዮች መካከል የሚዛመድ ነው። ስለዚህም ማንነት ሲገመገም ክፍተቶች አይቆጠሩም። መለኪያው በሁለቱ ቅደም ተከተሎች መካከል ካለው አጭር ቅደም ተከተል ጋር የተያያዘ ነው ተብሎ ይታሰባል. እሱም ጉልህ በሆነ መልኩ ቅደም ተከተል ማንነት ተሻጋሪ በማይሆንበት ቦታ ላይ ተጽእኖ እንዳለው ያመለክታል. X=Y እና Y=Z ከሆነ X የግድ ከ Z ጋር እኩል አይደለም ማለት ነው።ይህ የሚቀነሰው ከማንነት ርቀት መለኪያ አንፃር ነው።
ስእል 02፡ ማንነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ
ለምሳሌ፣ X የAAGGCTT ተከታታይ አለው፣ Y የAAGGC እና Z የ AAGGCAT ተከታታይ አለው። በX እና Y መካከል ያለው ማንነት 100% {5 ተመሳሳይ ኑክሊዮታይድ / ደቂቃ[ርዝመት(X)፣ ርዝመት(Y)]} ነው። በY እና Z መካከል ያለው ማንነትም 100% ነው። ነገር ግን በX እና Z መካከል ያለው ማንነት 85% ብቻ ነው {(6 ተመሳሳይ ኑክሊዮታይዶች / 7)}።
በተመሳሳይነት እና ማንነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- ሁለቱም መመሳሰል እና ማንነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ የምንጠቀምባቸው ሁለት ቃላት ናቸው።
- እንዲሁም በሁለቱ ተከታታዮች መካከል ያለውን መመሳሰል ያመለክታሉ።
- ከተጨማሪ፣ እንደ መቶኛ እሴት እንገልጻቸዋለን።
በተመሳሳይነት እና ማንነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
በአሰላለፍ ላይ ያለው ተመሳሳይነት ሲነጻጸር በሁለት ተከታታዮች መካከል ያለውን ተመሳሳይነት ያሳያል።በተከታታይ አሰላለፍ ውስጥ ያለው ማንነት በሁለት የተለያዩ ተከታታዮች መካከል በትክክል የሚዛመዱትን የቁምፊዎች ብዛት ይነግራል።ስለዚህ፣ ይህ በመመሳሰል እና በማንነት መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ ነው።
ማጠቃለያ - ተመሳሳይነት እና ማንነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ
የተከታታይ አሰላለፍ በዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ ወይም ፕሮቲን ውስጥ በተግባራዊ፣ መዋቅራዊ ወይም በዝግመተ ለውጥ በተከታታዩ መካከል ተመሳሳይነት ያላቸውን ክልሎች ለመለየት ይረዳል። ስለዚህም ተመሳሳይነት እና ማንነት በቅደም ተከተል አሰላለፍ አውድ ውስጥ ሁለት ቁልፍ ቃላት ናቸው። በእነዚህ ሁለት ቃላቶች መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ተመሳሳይነት በንፅፅር የሁለት ቅደም ተከተሎች መመሳሰል ሲሆን ማንነት ግን በሁለት የተለያዩ ቅደም ተከተሎች መካከል በትክክል የሚዛመዱ የቁምፊዎች ብዛት ነው። ስለዚህ, ይህ በቅደም ተከተል በማመሳሰል እና በማንነት መካከል ያለው ልዩነት ማጠቃለያ ነው.
