በሞቲፍ እና በጎራ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ጎራው ራሱን የቻለ የተረጋጋ ሲሆን ሞቲፍ በራሱ የማይረጋጋ መሆኑ ነው።
ፕሮቲኖች በሰውነታችን ውስጥ የሚገኙ ጠቃሚ ባዮሎጂካል ማክሮ ሞለኪውሎች ናቸው። በሌላ በኩል የጂን ጄኔቲክ ኮድ የፕሮቲን አሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል ይወስናል. ከዚህም በላይ ፕሮቲኖች የመጀመሪያ ደረጃ, ሁለተኛ ደረጃ እና ሶስተኛ ደረጃ መዋቅሮች አሏቸው. ዋናው መዋቅር የ polypeptide ሰንሰለት የአሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል ነው. የ polypeptide ሰንሰለቶች እርስ በርስ ሲጣበቁ, የፕሮቲን ሁለተኛ ደረጃ መዋቅር ይፈጥራል. የአልፋ ሄልስ፣ የቤታ ሉሆች እና ከፍተኛ ሁለተኛ ደረጃ መዋቅሮች የሁለተኛ ደረጃ መዋቅሮች ንብረት ናቸው።የሱፐር-ሁለተኛ ደረጃ ንጥረ ነገሮች የተወሰኑ ቡድኖች የፕሮቲን ዘይቤዎች በመባል ይታወቃሉ። የሶስተኛ ደረጃ ፕሮቲን የፕሮቲን ተግባርን የሚወስን ሶስት አቅጣጫዊ አወቃቀሩን ያመለክታል. ዶሜይን የፕሮቲን ሞለኪውል የታጠፈ ክፍል ነው፣ እሱም ግሎቡላር እና የተለየ ተግባር ያለው። እሱ የፕሮቲን መሰረታዊ ተግባራዊ እና ባለ ሶስት አቅጣጫዊ መዋቅር ነው።
ሞቲፍ ምንድነው?
Motif እንደ አልፋ ሄሊስ እና የቅድመ-ይሁንታ መዋቅሮች ያሉ የፕሮቲኖች ልዕለ ሁለተኛ ደረጃ አካላት የተወሰነ ስብስብ ነው። በተለያዩ ፕሮቲኖች ውስጥ የሚገኙ አንዳንድ ዓይነት ቅጦች ናቸው. Motifs የሁለተኛ ደረጃ መዋቅራዊ አካላትን የማጣጠፍ ዘይቤዎችን እና ግንኙነታቸውን ይገልፃሉ። እነዚህ የማጠፊያ ንድፎች በሶስተኛ ደረጃ መዋቅሮች ውስጥ በሚገኙ ተመሳሳይ ትስስሮች ይረጋጋሉ. ሆኖም፣ እንደ ሶስተኛ ደረጃ መዋቅሮች ውስብስብ አይደሉም።
ስእል 01፡ Motif
እነሱ ቀላል የሁለተኛ ደረጃ የፕሮቲን ውህዶች ናቸው። ሞቲፍ በራሱ የተረጋጋ አይደለም. በተጨማሪም, ዘይቤዎች የፕሮቲን አወቃቀርን ያብራራሉ ነገር ግን የፕሮቲን ተግባርን አይተነብዩም. የፕሮቲን ዘይቤዎች ምሳሌዎች ቤታ-አልፋ-ቤታ ሞቲፍ፣ የግሪክ ቁልፍ ጭብጥ፣ ቤታ በርሜል፣ ቤታ-ሜአንደር ሞቲፍ፣ ወዘተ ናቸው።
ጎራ ምንድን ነው?
ጎራ የፕሮቲን መሠረታዊ፣ ተግባራዊ እና ባለ ሶስት አቅጣጫዊ አሃድ ነው። የተለየ ተግባር ያከናውናል. አንድ ነጠላ ፕሮቲን ብዙ የተለያዩ ጎራዎች ሊኖሩት ይችላል። እያንዳንዱ ጎራ ራሱን የቻለ ክፍል ነው። ግሎቡላር መዋቅር ነው. ለአንድ የተወሰነ ተግባር ወይም መስተጋብር ተጠያቂ ነው. ጎራዎች ያልታወቀ ፕሮቲን ተግባር ለመገመት ሊያገለግሉ ይችላሉ። ፕሮቲን በሚተነተንበት ጊዜ ጎራዎች የፕሮቲን ተግባራዊ አሃዶች ስለሆኑ ግምት ውስጥ ማስገባት አስፈላጊ ነው።
ስእል 02፡ ሶስት የተለያዩ የፒሩቫት ኪናሴ ጎራዎች
ጎራዎች በጣም የተረጋጉ እና የታመቁ መዋቅሮች ናቸው። ከሌሎች ክልሎች በቀላሉ ሊለዩ ይችላሉ. በስእል 02 እንደሚታየው Pyruvate kinase ሶስት የሚለዩ ጎራዎች አሉት። እያንዳንዱ ጎራ ከሁለተኛ ደረጃ መዋቅራዊ ክፍሎች የተገነባ የሃይድሮፎቢክ ኮር ይዟል። በርካታ ጎራዎች በአንድ ላይ የፕሮቲን ሶስተኛ ደረጃን ይፈጥራሉ።
በMotif እና Domain መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- ሞቲፍ እና ጎራ በፕሮቲን ሞለኪውሎች ውስጥ የሚገኙ አሃዶች ናቸው።
- የፕሮቲን ቤተሰቦችን ሲከፋፍሉ ጠቃሚ ናቸው።
በMotif እና Domain መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Motif እንደ አልፋ ሄሊስ እና የቅድመ-ይሁንታ አወቃቀሮች ያሉ የፕሮቲኖች ልዕለ ሁለተኛ ደረጃ አካላት ስብስብ ሲሆን ጎራ የፕሮቲን ተግባራዊ አሃድ ነው።ከዚህም በተጨማሪ ሞቲፍ ሁለተኛ ደረጃ መዋቅር ሲሆን ጎራ ደግሞ ለፕሮቲን ሦስተኛ ደረጃ መዋቅር ተጠያቂ ነው። ከዚህም በላይ፣ ጎራ እንደ ሞቲፍ ሳይሆን ራሱን የቻለ ክፍል ነው። እንዲሁም፣ ዶሜይፍ ግን የፕሮቲንን ተግባር ያሳያል። እነዚህ በሞቲፍ እና በጎራ መካከል ያሉ ዋና ዋና ልዩነቶች ናቸው. ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በሞቲፍ እና በጎራ መካከል ያለውን ልዩነት በሰንጠረዥ መልኩ ያቀርባል።
ማጠቃለያ – Motif vs Domain
ሞቲፍ የፕሮቲን ሞለኪውል ሁለተኛ ደረጃ መዋቅሮች ዝግጅት ነው። እንደ ጎራ ሳይሆን አብዛኛውን ጊዜ በራሱ የተረጋጋ አይደለም። ዶሜይን ራሱን የቻለ የተረጋጋ የፕሮቲን መዋቅር ነው። ስለዚህ, አንድ ክፍል ወይም ሙሉ የፕሮቲን ሞለኪውል ሊሆን ይችላል. ባለ ሶስት አቅጣጫዊ የፕሮቲን መሰረታዊ ተግባራዊ አሃድ ነው። ከዚህም በላይ, ተግባር አለው, እና ራሱን የቻለ ክፍል ነው. Motif የጎራ አካል ሊሆን ይችላል። ነገር ግን ጎራ የአንድ ሞቲፍ አካል ሊሆን አይችልም። ይህ በሞቲፍ እና በጎራ መካከል ያለው ልዩነት ነው።