በተነጣጠሩ እና ባልታለሙ ፕሮቲዮሚኮች መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት የታለመው ፕሮቲዮሚክስ የአንድን የተወሰነ ፕሮቲን ብዛት ለመለካት ያለመ ሲሆን ያልተፈለገ ፕሮቲዮሚክስ ደግሞ አንድን ፕሮቲን ኢላማ አያደርግም።
ፕሮቲዮሚክስ የፕሮቲኖች፣ አወቃቀሮቻቸው እና ተግባሮቻቸው መጠነ ሰፊ ጥናት ነው። በተወሰኑ ሁኔታዎች ውስጥ በሴል, ቲሹ ወይም አንድ አካል ውስጥ ሙሉውን የፕሮቲን ማሟያ ያጠናል. እንደ ኢላማ ፕሮቲዮሚክስ እና ያልታለሙ ፕሮቲዮሚክስ ሁለት አይነት ፕሮቲዮሚክስ አሉ።
የተነጣጠረ ፕሮቲዮሚክስ ምንድን ነው?
ስሙ እንደሚያመለክተው ኢላማ የተደረገ ፕሮቲዮሚክስ ለአንድ የተወሰነ ፕሮቲን ወይም ፔፕታይድ በተወሳሰበ የፕሮቲን ድብልቅ ውስጥ ለመተንተን ኢላማ ያደርጋል።ከዚያ አስቀድሞ የተመረጠውን የተወሰነ ፕሮቲን መኖር እና መጠን ይመረምራል። ይህ ዘዴ ለአንድ ናሙና ብቻ ወይም በበርካታ ናሙናዎች ውስጥ ይቻላል. ይህ ዘዴ ለተወሰኑ የፕሮቲኖች ቡድን እንኳን ተስማሚ ነው. ይበልጥ ትክክለኛ፣ መጠናዊ እና ሚስጥራዊነት ያለው መረጃን ያስከትላል። ከዚህም በላይ የጅምላ ስፔክትሮሜትሪ ከተነጣጠረ ፕሮቲዮቲክስ ጋር ተጣምሮ ይበልጥ ትክክለኛ የሆኑ አስተማማኝ መለኪያዎችን ያመጣል. ይህ ዘዴ ለትንታኔው ባለሶስት እጥፍ ባለአራት ማዕበል massspectrometer (QQQ) ይጠቀማል።
ሥዕል 01፡ ፕሮቲዮሚክስ
የታረጀ ፕሮቲዮሚክስ ተስማሚ ዘዴ ነው የመዝጋት ዒላማው በትክክል መውደቁን ማረጋገጥ ከፈለጉ ወይም በደም ሴረም፣ ሴሬብራል ፈሳሽ ወይም በሴል lysate ወዘተ ውስጥ ያለውን የተወሰነ ፕሮቲን/peptide መጠን ለመለካት ከፈለጉ። አንድ የተወሰነ ፕሮቲን በናሙናዎች ወይም በጊዜ ኮርስ ሙከራ ወቅት በተለየ ሁኔታ መገለጹን ለማረጋገጥ ከፈለጉ ይጠቀሙበት።
ያልታለመ ፕሮቲዮሚክስ ምንድነው?
ያልተነጣጠሩ ፕሮቲዮሚክሶች፣ስሙ እንደተገለፀው ለአንድ የተወሰነ ፕሮቲን ወይም peptide ለትንታኔ አላነጣጠረም። የግኝት ፕሮቲዮሚክስ ሌላ ስም ነው ላልተነጣጠሩ ፕሮቲዮሚክስ። እንደ እውነቱ ከሆነ, የበለጠ 'ዓለም አቀፍ' ትንታኔ ነው. በአጠቃላይ፣ ያልታለመ ፕሮቲዮሚክስን ማከናወን “በዚህ ናሙና ውስጥ ምን ፕሮቲን ወይም ፕሮቲኖች አሉ ወይም ብዙ ናሙናዎች?” የሚለውን ጥያቄ መመለስ ነው። ይህ ዘዴ እንደ ዒላማ ፕሮቲዮቲክስ ስሜታዊ አይደለም. ነገር ግን አዳዲስ ፕሮቲኖችን ጨምሮ ብዙ ፕሮቲኖችን መለየት እና መለካት ይችላል። ያልታለሙ ፕሮቲዮቲክስ ሁለቱንም መጠናዊ እና የጥራት መለኪያዎችን ማምረት ይችላል።
በተነጣጠሩ እና ባልታለሙ ፕሮቲዮሚክስ መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- ሁለቱም የታለሙ እና ያልታለሙ ፕሮቲዮቲክስ ፕሮቲኖችን በናሙና ይለካሉ።
- በፕሮቲን ትንታኔ ውስጥ አስፈላጊ ናቸው።
- እነዚህ ዘዴዎች የጅምላ ስፔክትሮሜትሪ ይጠቀማሉ።
በተነጣጠሩ እና ባልታለሙ ፕሮቲዮሚክስ መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
በመጀመሪያ የታለመ ፕሮቲዮሚክስ የአንድ የተወሰነ ፕሮቲን ወይም ፔፕታይድ መገኘት እና መጠን ውስብስብ በሆነ የፕሮቲን ድብልቅ ውስጥ መወሰን ነው። በአንጻሩ፣ ያልታለመ ፕሮቲዮሚክስ በአንድ ናሙና ወይም ናሙና ውስጥ የሚገኙትን ፕሮቲኖች መጠናዊ እና የጥራት ጥናት የተወሰነ ፕሮቲን ላይ ሳያነጣጠሩ ነው። በዚህ ናሙና ውስጥ ያሉትን የፕሮቲን ዓይነቶች ለማወቅ የታለመ ፕሮቲዮቲክስ አስቀድሞ በተመረጡ ወይም በታለመላቸው ፕሮቲኖች ይከናወናል። በተጨማሪም፣ ኢላማ የተደረገ ፕሮቲዮሚክስ ካልታለሙ ፕሮቲዮሚክስ የበለጠ ስሜታዊ ነው።
ማጠቃለያ - የታለመ vs ያልተነጣጠሩ ፕሮቲዮሚክስ
ለማጠቃለል ያህል የታለሙ እና ያልታለሙ ፕሮቲዮሚክስ ሁለት አይነት የፕሮቲን ጥናቶች ናቸው። ስማቸው እንደሚያመለክተው፣ የታለሙ ፕሮቲዮሎጂስቶች የተወሰነ ፕሮቲን ላይ ያነጣጠሩ ሲሆኑ፣ ያልታለሙ ፕሮቲዮሎጂስቶች ግን አንድን ፕሮቲን አይጠቁም።ይህ በተነጣጠሩ እና ባልታለሙ ፕሮቲዮሚክስ መካከል ያለው ልዩነት ነው።