shRNA vs siRNA
በአር ኤን ኤ ጣልቃ ገብነት (አር ኤን ኤ) ሂደት ወቅት፣ የታለመው ዘረ-መል (ጅን) አገላለጽ በከፍተኛ ልዩነት እና በምርጫ ይወድቃል። አር ኤን ኤ ተፈጥሯዊ ሂደት ነው፣ እና እሱ የሚያጠቃልለው አነስተኛ ጣልቃ-ገብ አር ኤን ኤ (ሲአርኤን) እና አጭር የፀጉር ፒን አር ኤን ኤ (shRNA) እና ሁለት-ተግባራዊ shRNA ነው። በአሁኑ ጊዜ አር ኤንአይ ለግል የካንሰር ሕክምና እንደ መሣሪያ በሰፊው ጥቅም ላይ ውሏል። የአርኤንአይኤ አፕሊኬሽኖች በመሠረቱ በኬሚካላዊ በተቀነባበረ ድርብ-ክር ሲአርኤን እና በቬክተር ላይ የተመሰረተ shRNA ሞለኪውሎች ይከናወናሉ። እነዚህ ሁለት ሞለኪውሎች ተመሳሳይ ተግባራዊ ውጤቶች ቢኖራቸውም, በአወቃቀራቸው ይለያያሉ; ስለዚህ፣ የእነዚህ ሁለት ሞለኪውሎች ሞለኪውላዊ የአሠራር ዘዴዎች፣ የአር ኤን ኤ ዱካዎች እና ከዒላማ ውጪ ተፅዕኖዎችም ይለያያሉ።
shRNA
shRNA የትንሽ አር ኤን ኤ ሞለኪውል ቅደም ተከተል ሲሆን ይህም ጥብቅ የሆነ የፀጉር መቆንጠጥ በአር ኤን ኤ ወቅት የታለመውን የጂን አገላለጽ ዝም ለማሰኘት ሊያገለግል ይችላል። የ shRNA አገላለጽ የሚገኘው በቬክተር ነው፣ እሱም ቫይረስ ወይም ባክቴሪያ ወይም ፕላዝማይድ በመላክ ሊሆን ይችላል። እነሱ በሴሎች ኒውክሊየስ ውስጥ የተዋሃዱ እና ለቀጣይ ሂደቶች ወደ ሳይቶፕላዝም ይወሰዳሉ። እነዚህ ሞለኪውሎች የ miRNA ተመሳሳይ የብስለት መንገዶች አሏቸው። ስለዚህ የ miRNA ውህደት የ shRNA ውህደትን ለመረዳት መሰረት አድርጓል። አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ II ወይም III shRNA በአር ኤን ኤ polymerase II ወይም III አስተዋዋቂዎች በኩል መገልበጥ ይችላል። የ shRNAs አጠቃቀም ጥቅሙ በአንፃራዊነት ዝቅተኛ የመበላሸት እና የመቀያየር መጠን ስላላቸው ነው። ጉዳቱ የአገላለጽ ቬክተር ያስፈልገዋል፣ ይህም አንዳንድ የደህንነት ችግሮችን ሊያስከትል ይችላል።
siRNA
ሲአርኤንኤዎች ከ20-25 የመሠረት ጥንዶች ርዝመት ያላቸው ድርብ ገመድ ያላቸው አር ኤን ኤ ሞለኪውሎች ናቸው። እነዚህ በአር ኤን ኤ መንገድ ላይ ያለውን የተጨማሪ ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ያለውን ማንኛውንም ጂን ጸጥ በማድረግ ለጂን ማፈን ያገለግላሉ።በሲአርኤን (siRNA) ሽግግር የጂን መውደቅ ብዙውን ጊዜ በጊዚያዊ ተጽእኖ ምክንያት አልተሳካም; በተለይም በፍጥነት በሚከፋፈሉ ሴሎች ውስጥ እና ጭቆናው ለረጅም ጊዜ አይቆይም. ይህንን ችግር ለማሸነፍ ሲአርኤን አጭር የፀጉር አሠራር በማስተዋወቅ ተስተካክሏል. ይህ የተሻሻለው ሞለኪውል shRNA በመባል ይታወቃል። shRNA መደበኛ ተግባሩን ለመቀጠል በDicer ወደ siRNA መለወጥ አለበት።
በshRNA እና siRNA መካከል ያለው ልዩነት ምንድነው?
• ከሲአርኤን በተለየ መልኩ shRNA ተጨማሪ የፀጉር ማያያዣ መዋቅር አለው። shRNA የተሻሻለ የሲአርኤን ስሪት ነው።
• shRNA አገላለጽ ቬክተር ይፈልጋል፣ ሲአርኤን ግን አይፈልግም።
• shRNA ለረጅም ጊዜ ለማንኳኳት ሊያገለግል ይችላል ሲአርኤን ደግሞ ለአጭር ጊዜ ጂኖች መውደቅ ብቻ ነው።
• ከሲአርኤን ጂን ማፈን በተለየ የ shRNA ን ማፈን ለረጅም ጊዜ የሚቆይ ሲሆን በተገቢው የቫይረስ ቬክተር ከገባ ዘላቂ የጂን ጸጥታ ተጽእኖ ሊያመጣ ይችላል።
• ሹርንኤን ወደ ሲአርኤንኤ ሞለኪዩል ለመቀየር Dicer መደበኛ ተግባራቱን ለማከናወን ያስፈልጋል።
