በአጋሮዝ እና ፖሊacrylamide gel electrophoresis መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት agarose gel electrophoresis በአግድም የሚፈሱ አጋሮዝ ጄሎችን በንፅፅር ትላልቅ የዲ ኤን ኤ ቁርጥራጮችን ለመለየት ፣ ፖሊacrylamide gel electrophoresis ደግሞ አጫጭር የኒውክሊክ አሲድ ቁርጥራጮችን ለመለየት በአቀባዊ የፈሰሰ ፖሊacrylamide gelsን ይጠቀማል።
Electrophoresis እንደ ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ እና ፕሮቲን ያሉ ባዮሞለኪውሎችን ለመለየት በጄል ማትሪክስ ላይ የሚተገበረውን የኤሌክትሪክ መስክ የሚጠቀም ቴክኒክ ነው። ይህ እንደ ዲ ኤን ኤ ፣ አር ኤን ኤ እና ፕሮቲኖች ያሉ ባዮሞለኪውሎችን በኤሌክትሮፊዮርስስ በኩል መለየት በክፍያ እና በመጠን ላይ የተመሠረተ ነው።ናሙናዎች በጄል ጉድጓዶች ውስጥ ተጭነዋል. በኋላ, የኤሌክትሪክ መስክ በጄል ላይ ይተገበራል. መስኩ አሉታዊ-የተሞሉ ሞለኪውሎች ወደ ፖዘቲቭ ኤሌክትሮድ እንዲሄዱ ያደርጋል። ጄል ማትሪክስ እንደ ሞለኪውላር ወንፊት ሆኖ ትናንሽ ሞለኪውሎች በሚያልፉበት ወይም በፍጥነት በሚጓዙበት ጊዜ ትላልቅ ሞለኪውሎች ቀስ ብለው ይንቀሳቀሳሉ. ይህ ሞለኪውሎችን በክፍያ እና በመጠን መለየት ያስችላል። ስለዚህ አጋሮዝ እና ፖሊacrylamide gel electrophoresis በዋነኛነት ሞለኪውሎችን እንደ መጠናቸው እና ቻርጅያቸው ለመለየት የሚረዱ ሁለት አይነት ጄል ኤሌክትሮ ፎረሲስ ቴክኒኮች ናቸው።
አጋሮሴ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ምንድን ነው?
Agarose gel electrophoresis አጋሮዝ ጄል በመጠቀም እንደ ዲ ኤን ኤ እና አር ኤን ኤን የመሳሰሉ ባዮሞለኪውሎችን የሚለይ ዘዴ ነው። ኑክሊክ አሲዶችን በዋነኛነት በመጠን ለመለየት የሚያገለግል ዘዴ ነው። በዚህ ቴክኒክ ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውለው አጋሮዝ ተብሎ የሚጠራው ዋናው ውህድ ፖሊሶክካርዴድ ነው። ከባህር አረም የመጣ ነው። Agarose በሚፈላ ቋት ውስጥ ሊሟሟት ይችላል ከዚያም በአግድም በተያዘ ትሪ ውስጥ ሊፈስ ይችላል.በትሪው ውስጥ, ሲቀዘቅዝ ጠፍጣፋ ሲፈጠር ይጠናከራል. አጋሮዝ ጄል በማበጠሪያው ይፈስሳል ፣ እንደ ዲ ኤን ኤ ወይም አር ኤን ያሉ ኑክሊክ አሲዶች የሚጫኑባቸው ጉድጓዶች አንዴ ጄል ከተጠናከረ በኋላ።
ሥዕል 01፡ አጋሮሴ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ
ጄል በኋላ በተገቢው ቋት ውስጥ ይጠመቃል፣ እና አንድ ጅረት በጄል ላይ ይተገበራል። ዲ ኤን ኤ ከሞለኪዩሉ ተከታታይ ስብጥር ነጻ የሆነ ወጥ የሆነ አሉታዊ ክፍያ አለው። ስለዚህ የዲኤንኤ ሞለኪውሎች ከካቶድ (-) ወደ አኖድ (+) ይፈልሳሉ። የፍልሰት መጠን በቀጥታ በሞለኪዩል መጠን ላይ የተመሰረተ ነው. ትልቁ ማክሮ ሞለኪውሎች በጄል ውስጥ ለመጓዝ በጣም አስቸጋሪ ጊዜ አላቸው. በሌላ በኩል ትናንሾቹ ማክሮ ሞለኪውሎች በጄል ውስጥ በፍጥነት እና በቀላሉ ይንሸራተታሉ።
Polyacrylamide Gel Electrophoresis ምንድነው?
Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) ባዮሞለኪውሎችን ለመለየት ፖሊacrylamide gels የሚጠቀም ዘዴ ነው። ባዮሎጂካል ማክሮ ሞለኪውሎችን በተለምዶ ፕሮቲኖችን እና ኑክሊክ አሲዶችን በኤሌክትሮፎረቲክ እንቅስቃሴያቸው ለመለየት በሰፊው ጥቅም ላይ የሚውል ዘዴ ነው። የ acrylonitrile እርጥበት አሲሪላሚድ ሞለኪውሎች በኒትሪል ሃይድራታስ እንዲፈጠሩ ያደርጋል. አሲሪላሚድ በውሃ ውስጥ ይሟሟል, እና ነፃ ራዲካል አስጀማሪዎች ሲጨመሩ, acrylamide polymerizes, በዚህም ምክንያት ፖሊacrylamide ጄል እንዲፈጠር ያደርጋል. በተለምዶ የ acrylamide መጠን መጨመር በጄል ውስጥ ያለው ቀዳዳ መጠን ይቀንሳል። ፖሊacrylamide gels እንደ agarose gels በተቃራኒ በአቀባዊ ይፈስሳል።
ምስል 02፡ ፖሊacrylamide Gel Electrophoresis
በፖሊacrylamide gel electrophoresis ውስጥ፣ ሞለኪውሎቹ በትውልድ አገራቸው ሊሄዱ ይችላሉ፣ ይህም የሞለኪውሎች ከፍተኛ ደረጃ ያለው መዋቅር ይጠብቃሉ። ይህ ዘዴ ቤተኛ PAGE ይባላል። በአማራጭ፣ ከፍተኛ-ደረጃ ያለውን መዋቅር ለማስወገድ እና ሞለኪውሉን ወደ ያልተደራጀ ሞለኪውል ለመቀየር ኬሚካላዊ ዲናቱራንት መጨመርም ይቻላል። ይህ አይነት SDS-PAGE ይባላል።
በአጋሮሴ እና ፖሊacrylamide Gel Electrophoresis መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- አጋሮሴ እና ፖሊacrylamide gel electrophoresis ሁለት አይነት ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ቴክኒኮች ናቸው።
- በእርግጥ እነሱ ሞለኪውላር ባዮሎጂካል ቴክኒኮች ናቸው።
- ሁለቱም ቴክኒኮች እንደ ዲኤንኤ እና ፕሮቲኖች ያሉ ባዮሎጂካል ማክሮ ሞለኪውሎችን ለመለየት ያገለግላሉ።
- እነዚህ ቴክኒኮች የሚሰሩት በሰለጠኑ ቴክኒሻኖች ወይም ተመራማሪዎች ነው።
- በሁለቱም ቴክኒኮች የማክሮ ሞለኪውሎች መለያየት በክፍያ እና በመጠን ላይ የተመሰረተ ነው።
- ሁለቱም ቴክኒኮች እንደ ዲ ኤን ኤ እና አር ኤን ኤ ያሉ ኑክሊክ አሲዶችን ለመለየት ያስችላሉ።
በአጋሮሴ እና ፖሊacrylamide Gel Electrophoresis መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
አጋሮሴ ጄል ኤሌክትሮ ፎረሲስ በአግድም የሚፈሰው አጋሮዝ ጄል ባዮሞለኪውሎችን ለመለየት የሚረዳ ቴክኒክ ሲሆን ፖሊacrylamide gel electrophoresis ደግሞ በአቀባዊ የፈሰሰ ፖሊacrylamide gels ባዮሞለኪውሎችን ለመለየት የሚረዳ ዘዴ ነው። ይህ በአጋሮዝ እና በ polyacrylamide gel electrophoresis መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው. በተጨማሪም አጋሮዝ ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ዲኤንኤ እና አር ኤን ኤ ለመለየት ጥቅም ላይ ይውላል፣ ፖሊacrylamide gel electrophoresis ደግሞ እንደ ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ ወይም ፕሮቲኖች ያሉ ኑክሊክ አሲዶችን ለመለየት ይጠቅማል።
የሚከተለው ሠንጠረዥ በአጋሮዝ እና በፖሊacrylamide gel electrophoresis መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
ማጠቃለያ – Agarose vs Polyacrylamide Gel Electrophoresis
አጋሮሴ እና ፖሊacrylamide gel electrophoresis በሞለኪውላር ባዮሎጂ ላብራቶሪዎች ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውሉ ሁለት አይነት ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ቴክኒኮች ናቸው።Agarose gel electrophoresis ባዮሞለኪውሎችን ለመለየት አጋሮዝ ጄል ይጠቀማል። Agarose በአጠቃላይ ለሰው ልጆች መርዛማ አይደለም, ፖሊacrylamide ግን ለሰው ልጆች መርዛማ ነው. ከዚህም በላይ የ agarose gel electrophoresis ዝቅተኛ ጥራት ያሳያል, ፖሊacrylamide gel electrophoresis ደግሞ የበለጠ ጥራት ያሳያል. ፖሊacrylamide gel electrophoresis ባዮሞለኪውሎችን ለመለየት ፖሊacrylamide gel ይጠቀማል። ይህ በአጋሮዝ እና በ polyacrylamide gel electrophoresis መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል