ቁልፍ ልዩነት - Gel Electrophoresis vs SDS ገጽ
Gel electrophoresis በኤሌክትሪክ መስክ ውስጥ ያሉ ማክሮ ሞለኪውሎችን የሚለይ ዘዴ ነው። በሞለኪውላር ባዮሎጂ ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ እና ፕሮቲኖችን ከውህድ እንደ ሞለኪውላዊ መጠናቸው መለየት የተለመደ ዘዴ ነው። ኤስዲኤስ ፔጅ ፕሮቲኖችን ከፕሮቲን ውህድ እንደ መጠናቸው ለመለየት የሚያገለግል ጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ አይነት ነው። ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ለዲኤንኤ፣ ለአር ኤን ኤ እና ፕሮቲን መለያየት የሚተገበረውን መደበኛ ቴክኒክ ለማመልከት የሚያገለግል ቃል ሲሆን SDS Page አንድ የጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ አይነት ነው። ይህ በጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ እና በኤስዲኤስ ገጽ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው.
Gel Electrophoresis ምንድን ነው?
Gel electrophoresis በላብራቶሪዎች ውስጥ እንደ ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ፣ ፕሮቲኖች፣ ወዘተ ያሉ ቻርጅ የተደረገባቸውን ሞለኪውሎች ከውህዶቻቸው ለመለየት የተለመደ ዘዴ ነው። ጄል በጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል. እንደ ሞለኪውላር ወንፊት ይሠራል. በጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ውስጥ ሁለት ዓይነት ጄልዎች ጥቅም ላይ ይውላሉ እነሱም agarose እና polyacrylamide. ጄል እና ጄል ዝግጅት ምርጫ ጄል electrophoreses ውስጥ አስፈላጊ ነገሮች ናቸው ምክንያቱም ጄል ያለውን ቀዳዳ መጠን በጥንቃቄ ጄል electrophoresis በኩል ሞለኪውሎች መካከል ጥሩ መለያየት አለበት ጀምሮ. Gel electrophoresis ከጄል ሁለት ጫፎች ጋር የተገናኘ የኤሌክትሪክ መስክ አለው. የጄል አንድ ጫፍ አዎንታዊ ክፍያ ሲያሳይ ሌላኛው ጫፍ ደግሞ በአሉታዊ መልኩ ተሞልቷል።
ዲ ኤን ኤ እና አር ኤን ኤ በአሉታዊ መልኩ የሚሞሉ ሞለኪውሎች ናቸው። ከጄል አሉታዊው ጫፍ ወደ ጄል ከተጫኑ እና በኤሌክትሪክ መስክ ላይ ከተተገበሩ በኋላ በጄል ቀዳዳዎች በኩል አዎንታዊ ኃይል ወዳለው የጄል ጫፍ ይፈልሳሉ።የፍልሰት ፍጥነት በክፍያው እና በሞለኪዩል መጠን ይወሰናል. ከትላልቅ ሞለኪውሎች ይልቅ ትናንሽ ሞለኪውሎች በቀላሉ በጄል ቀዳዳዎች ውስጥ ይፈልሳሉ። ስለዚህ ትናንሽ ሞለኪውሎች በጄል በኩል ረጅም ርቀት ይጓዛሉ እና ትላልቅ ሞለኪውሎች አጭር ርቀት ይጓዛሉ. በጄል ላይ የሞለኪውሎች ጉዞን ለመመልከት ልዩ ዓይነት ማቅለሚያዎች ጥቅም ላይ ይውላሉ. የኤሌትሪክ መስክ ለተወሰነ ጊዜ ይተገበራል እና ሞለኪውሎች እንዳይጠፉ ለመከላከል እና ሞለኪውሎቹ በተጓዙበት ቦታ እንዲቆዩ ይደረጋል. በጄል ውስጥ የተለያዩ ባንዶች ሊታዩ ይችላሉ. እነዚህ ባንዶች የተለያየ መጠን ያላቸውን ሞለኪውሎች ይወክላሉ. ስለዚህ ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ሞለኪውሎችን እንደ መጠናቸው ለመለየት ይጠቅማል።
Gel electrophoresis በሞለኪውላር ባዮሎጂ እንደ መሰናዶ ቴክኒክ እንደ PCR፣ RFLP፣ cloning፣ DNA sequencing፣ ደቡባዊ ብሎቲንግ፣ ጂኖም ካርታ ወዘተ በተለያዩ ቴክኒኮች ውስጥ ተካቷል።
ምስል 01፡ አጋሮሴ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ
SDS ገጽ ምንድን ነው?
ሶዲየም ዶዴሲል ሰልፌት ፖሊacrylamide gel electrophoresis (SDS Page) ፕሮቲኖችን ለመለየት የሚያገለግል ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ ዓይነት ነው። ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ፕሮቲኖችን ለመለየት ጥቅም ላይ በሚውልበት ጊዜ ፕሮቲኖች እንደ ዲ ኤን ኤ እና አር ኤን ኤ አሉታዊ ኃይል ስለማይሞሉ እና ወደ አወንታዊው መጨረሻ ወይም አሉታዊ መጨረሻ ስለማይሰደዱ ልዩ ህክምናዎች ያስፈልጋሉ። ስለዚህ ፕሮቲኖች ከጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ በፊት ተቆርጠዋል እና በአሉታዊ ክፍያ ተሸፍነዋል። ሶዲየም ዶዴሲል ሰልፌት (ኤስ.ዲ.ኤስ.) የተባለውን ሳሙና በመጠቀም ይከናወናል። ኤስዲኤስ እና ፖሊacrylamide gel ለድጋፍ ሰጪው የሚጠቀመው ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ SDS Page በመባል ይታወቃል። ይህ ዘዴ በብዛት በባዮኬሚስትሪ፣ በጄኔቲክስ፣ በፎረንሲክስ እና በሞለኪውላር ባዮሎጂ ጥቅም ላይ ይውላል።
በኤስዲኤስ ገጽ ወቅት ፕሮቲኖች ከኤስዲኤስ ጋር ይደባለቃሉ። ኤስ.ዲ.ኤስ ፕሮቲኖችን ወደ መስመራዊ ቅርጽ ይከፍታል እና ከሞለኪውላዊ ብዛታቸው ጋር ተመጣጣኝ በሆነ አሉታዊ ክፍያ ይለብሳቸዋል።በአሉታዊ ክፍያ ምክንያት የፕሮቲን ሞለኪውሎች ወደ ጄል አወንታዊ ቻርጅ ጫፍ ይፈልሳሉ እና እንደ ሞለኪውላዊ ብዛታቸው ይለያያሉ። በኤስዲኤስ ገጽ ውስጥ ፖሊacrylamide እንደ ጄል ጠንካራ ድጋፍ ሆኖ ያገለግላል። የፕሮቲኖች ትክክለኛ መለያየት በዋነኝነት የሚወሰነው በጄል ባህሪዎች ላይ ነው። ስለዚህ የ polyacrylamide ጄል ዝግጅት በጥንቃቄ መደረግ አለበት እና ትክክለኛ የ polyacrylamide መጠን ጥቅም ላይ መዋል አለበት። ፖሊacrylamide gels ከ agarose gels ከፍተኛ ጥራት ያሳያል። ስለዚህ የኤስዲኤስ ገጽ ለፕሮቲን መለያየት ከፍተኛ ጥራት ያለው ቴክኒክ ነው ተብሎ ይታሰባል።
ኤስዲኤስ ገጽ የዲንቴሽን ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ አይነት ነው። በፕሮቲን ትንተና ውስጥ ትልቅ ገደብ አለው. ኤስዲኤስ ከመለያየቱ በፊት ፕሮቲኖችን ስለሚገድብ የኢንዛይም እንቅስቃሴን፣ የፕሮቲን ትስስርን፣ የፕሮቲን አጋሮችን፣ ወዘተ ለመለየት አይፈቅድም።
ምስል 02፡ የኤስዲኤስ ገጽ
በ Gel Electrophoresis እና SDS Page መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Gel Electrophoresis vs SDS ገጽ |
|
| Gel electrophoresis በኤሌክትሪክ መስክ በመጠቀም ማክሮ ሞለኪውሎችን ለመለየት የሚደረግ ዘዴ ነው። | SDS ገጽ ፕሮቲኖችን በጅምላአቸው ላይ በመመስረት ለመለየት የሚያገለግል ከፍተኛ ጥራት ያለው ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ቴክኒክ ነው። |
| Gel Run | |
| በአግድም ወይም በአቀባዊ መልኩ ሊከናወን ይችላል። | SDS ገጽ ሁል ጊዜ በአቀባዊ ይሰራል። |
| የመለያየት መሰረት | |
| መለያየት የሚከሰተው በክፍያው እና በመጠን ነው። | የፕሮቲን መለያየት የሚከሰተው በጅምላ እና በክፍያ መሰረት ነው። |
| ጥራት | |
| Agarose gel electrophoresis ዝቅተኛ ጥራት እና ፖሊacrylamide gel electrophoresis ከፍተኛ ጥራት አለው | SDS ገጽ የተሻለ ጥራት አለው። |
| Denaturation | |
| Gel ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ጥርስን የማፍሰስ እና የማያደርጉ ቴክኒኮችን ያካትታል። | SDS ገጽ ከመለያየቱ በፊት ፕሮቲኖችን ያመነጫል። |
ማጠቃለያ - Gel Electrophoresis vs SDS ገጽ
Gel electrophoresis ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ እና ፕሮቲኖችን እንደ መጠናቸውና ቻርጅያቸው ለመለየት እና ለመተንተን የሚያገለግል የተለመደ ዘዴ ነው። ሁለት ዋና ዋና የጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ ዓይነቶች አሉ-አጋሮዝ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ እና ፖሊacrylamide gel electrophoresis። Agarose gels በዋናነት ለኑክሊክ አሲድ መለያየት ጥቅም ላይ ይውላል። ከፍተኛ ጥራት በሚያስፈልግበት ጊዜ, ፖሊacrylamide gels ጥቅም ላይ ይውላሉ.ኤስዲኤስ ገጽ ውስብስብ የሆኑ የፕሮቲን ውህዶችን ለመለየት በተለምዶ የሚያገለግል ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ ዓይነት ነው። እንደ ከፍተኛ-ጥራት ፕሮቲን መለያየት ዘዴ ይቆጠራል. ይህ በጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ እና በኤስዲኤስ ገጽ መካከል ያለው ልዩነት ነው።
