በLTR እና LTR ያልሆኑ ትራንስፖሶኖች መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት LTR retrotransposons የረዥም ተርሚናል የሚደጋገሙ የረትሮ ትራንስፖሶኖች አይነት ሲሆኑ፣ LTR ያልሆኑ ትራንስፖሶኖች ደግሞ የረጅም ተርሚናል ድግግሞሽ የሌላቸው የዳግም ትራንስፖሶኖች አይነት ናቸው። በመዋቅራቸው።
Retrotransposons (ክፍል I transposable elements or transposons through RNA intermediates) ራሳቸውን ወደ ተለያዩ ጂኖሚክ ቦታዎች ገልብጠው ለመለጠፍ የሚያስችል የዘረመል አይነት ናቸው። ይህን የሚያደርጉት አር ኤን ኤ ወደ ዲ ኤን ኤ በመቀየር የአር ኤን ኤ ትራንስፖዚሽን መካከለኛን በመጠቀም በግልባጭ መገልበጥ በሚባል ሂደት ነው።እንደ LTR እና LTR ያልሆኑ retrotransposons እንደ ሁለት ዋና ዋና የ retrotransposons ዓይነቶች አሉ።
LTR Retrotransposons ምንድን ናቸው?
LTR retrotransposons በአወቃቀራቸው ውስጥ ረጅም ተርሚናል የሚደጋገሙ የኋሊት ትራንስፖሶኖች አይነት ናቸው። ተደጋጋሚ ዲ ኤን ኤ ረዣዥም ክሮች በእያንዳንዱ የ LTR retrotransposon ጫፍ ላይ ይገኛሉ። እነዚህ ረጅም ተርሚናል ድጋሚዎች (LTR) በመባል ይታወቃሉ። እያንዳንዱ LTR ጥቂት መቶ መሰረታዊ ጥንዶች ይረዝማል። LTR retrotransposons ብዙውን ጊዜ ከ 5 ኪሎባዝ በላይ ይረዝማሉ። ከዚህም በላይ በረጅም ተርሚናል ድግግሞሾች መካከል፣ ከሬትሮቫይረስ ጂኖች ጋግ እና ፖል ጋር ተመጣጣኝ ሊገለበጡ የሚችሉ ጂኖች አሉ። እነዚህ ጂኖች ይደራረባሉ ስለዚህም በመደበኛነት የተገኘውን ግልባጭ ወደ ተግባራዊ የጂን ምርቶች የሚያስኬድ ፕሮቲኤዝ (ፕሮቲን) ይመሰርታሉ።
ምስል 01፡ LTR Retrotransposons
የሬት ትራንስፖሶንስ ጋግ ጂን ከሌሎች የሬትሮ ትራንስፖሶንስ ግልባጮች ጋር በማጣመር ቫይረስ የሚመስሉ ቅንጣቶችን ይፈጥራል። ፖል ጂን እንደ ሪቨርስ ትራንስክሪፕትሴስ፣ ውህደት እና ራይቦኑክሊዝ ኤች ጎራዎች ያሉ ኢንዛይሞችን ያካተቱ ምርቶችን ይሠራል። የተገላቢጦሽ ትራንስክሪፕትስ ኢንዛይም የ retrotransposon DNA በግልባጭ ግልባጭ ያደርጋል። Integrase ኢንዛይም retrotransposon DNA ወደ eukaryotic ጂኖም ዲ ኤን ኤ ያዋህዳል። የRibonuclease H ጎራዎች በአር ኤን ኤ መሃከለኛዎች መካከል የፎስፎዲስተር ቦንዶችን ለመቁረጥ ይረዳሉ። LTR retrotransposons እንዲሁ በቀላሉ በግልባጭ ወደ ጽሑፍ ግልባጭ እንዲደረግላቸው ከ tRNA ማሰሪያ ጣቢያዎች ጋር ግልባጮችን ኮድ ያደርጋሉ። በተጨማሪም፣ retrotransposon የ eukaryotic ጂኖም መረጃ ስላለው የራሱን ቅጂዎች በ eukaryotic cell ውስጥ ወደ ሌሎች ጂኖሚክ ቦታዎች ማስገባት ይችላል።
LTR ያልሆኑ Retrotransposons ምንድን ናቸው?
LTR ያልሆኑ retrotransposons በአወቃቀራቸው ውስጥ ረጅም ተርሚናል ድግግሞሾች የሌላቸው retrotransposons አይነት ናቸው።ልክ እንደ LTR retrotransposons፣ LTR ያልሆኑ retrotransposons እንዲሁ ለተቃራኒ ትራንስክሪፕትሴስ፣ ለአር ኤን ኤ ማሰሪያ ፕሮቲን፣ ኒውክሊየስ እና አንዳንድ ጊዜ ራይቦኑክሊዝ ኤች ጎራዎችን ይይዛሉ። ነገር ግን እነርሱ ረጅም ተርሚናል ይደግማል ይጎድላቸዋል; ይልቁንስ እርስ በእርሳቸው የተገለበጠ የመሠረት ቅደም ተከተል ሊኖራቸው የሚችል አጫጭር ድግግሞሾች አሏቸው። የአር ኤን ኤ ማሰሪያ ፕሮቲኖች ከአር ኤን ኤ ትራንስፖዚሽን መካከለኛ ጋር ይተሳሰራሉ፣ እና ኒውክሊየስ በኑክሊክ አሲድ ውስጥ ባሉ ኑክሊዮታይዶች መካከል ያለውን የፎስፎዲስተር ቦንድ ይሰብራሉ።
ምስል 02፡ LTR እና LTR ያልሆኑ Retrotransposons
ምንም እንኳን retrotransposons ቢሆኑም፣ እንደ LTR retrotransposons በተመሳሳይ መልኩ የአር ኤን ኤ መካከለኛ በመጠቀም የተገላቢጦሽ ግልባጭ ማድረግ አይችሉም። ምክንያቱም LTR ያልሆኑ retrotransposons tRNA የሚያገናኙ ቅደም ተከተሎችን ስለሌለው ነው። ስለዚህ፣ LTR ያልሆነ retrotransposon ወደ mRNA የተቀዳ እና ወደ ፕሮቲኖች የተተረጎመ እንደ ተቃራኒ ትራንስክሪፕት ሆኖ ያገለግላል።የተገላቢጦሽ ትራንስክሪፕትሴ የዲኤንኤ ቅጂ የሚሰራው LTR ያልሆነው retrotransposon's አር ኤን ኤ በአዲስ ጣቢያ ወደ ጂኖም ሊዋሃድ ይችላል። በተጨማሪም LTR ያልሆኑ retrotransposons በሁለት ዓይነት ይወድቃሉ፡ LINEs (ረጅም የተጠላለፉ የኑክሌር ንጥረ ነገሮች) እና SINEs (አጭር የተጠላለፉ የኑክሌር ንጥረ ነገሮች)።
በLTR እና LTR ያልሆኑ Retrotransposons መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- LTR እና LTR ያልሆኑ retrotransposons ሁለቱ ዋና ዋና የ retrotransposons ናቸው።
- ሁለቱም ዓይነቶች እንደ ሪቨርስ ትራንስክሪፕትሴ፣ አር ኤን ኤ ማሰሪያ ፕሮቲን፣ ኒዩክላይዝ እና ራይቦኑክሊዝ ኤች ጎራዎች ያሉ ኢንዛይሞችን ይይዛሉ።
- በሰው ልጅ ጂኖም ውስጥ ሊገኙ ይችላሉ።
- ሁለቱም ዓይነቶች የዝግመተ ለውጥ አስፈላጊ ናቸው።
በLTR እና LTR ያልሆኑ Retrotransposons መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
LTR retrotransposons በመዋቅራቸው ውስጥ ረጅም ተርሚናል ድግግሞሾች ሲኖራቸው LTR ያልሆኑ ትራንስፖሶኖች ደግሞ በመዋቅራቸው ውስጥ ረጅም ተርሚናል ድግግሞሾች የላቸውም።ስለዚህ ይህ በ LTR እና LTR ያልሆኑ retrotransposons መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። በተጨማሪም LTR retrotransposons እራሳቸውን የሚደግሙ አንድ ተከታታይ መሠረቶች ረጅም ቀጥተኛ ድግግሞሾች አሏቸው። በሌላ በኩል፣ LTR ያልሆኑ retrotransposons እርስ በርሳቸው አጠገብ የተገለበጠ ቅደም ተከተል ሊኖራቸው የሚችል አጫጭር ድግግሞሾች አሏቸው።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በLTR እና LTR ያልሆኑ retrotransposons መካከል ያለውን ልዩነት በጎን ለጎን ለማነፃፀር በሰንጠረዥ ያቀርባል።
ማጠቃለያ - LTR vs LTR ያልሆኑ Retrotransposons
LTR እና LTR ያልሆኑ retrotransposons ሁለቱ ዋና ዋና የዳግም ትራንስፖሶኖች ናቸው። LTR retrotransposons በአወቃቀራቸው ውስጥ ረጅም ተርሚናል ድግግሞሾች ሲኖራቸው LTR ያልሆኑ retrotransposons ደግሞ በአወቃቀራቸው ውስጥ ረጅም ተርሚናል ድግግሞሾች የላቸውም። ስለዚህ፣ ይህ በLTR እና LTR ያልሆኑ retrotransposons መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
