የቁልፍ ልዩነት - ማይክሮአረይ vs አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
ትራንስክሪፕት ኤምአርኤን፣ አር ኤን ኤ፣ ቲ አር ኤን፣ የተበላሸ አር ኤን ኤ እና፣ ያልተቀየረ አር ኤን ን ጨምሮ በአንድ ሕዋስ ውስጥ ያለውን የአር ኤን ኤ አጠቃላይ ይዘት ይወክላል። የሕዋስ ግንዛቤን ለመረዳት ትራንስክሪፕት ፕሮፋይል ማድረግ አስፈላጊ ሂደት ነው። ለጽሑፍ ግልባጭ መገለጫ ብዙ የላቁ ዘዴዎች አሉ። ማይክሮአረይ እና አር ኤን ኤ ሴኬቲንግ ሁለት አይነት ቴክኖሎጂዎች ናቸው ግልባጭን ለመተንተን። በማይክሮአረይ እና በአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ማይክሮ አራራይ ቀድሞ በተነደፉ የተሰየሙ መመርመሪያዎች ከዒላማ ሲዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ጋር በማዳቀል አቅም ላይ የተመሰረተ ሲሆን አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ደግሞ እንደ ኤንጂኤስ ባሉ የላቁ የቅደም ተከተል ቴክኒኮች በሲዲኤንኤ ዘርፎች ቀጥተኛ ቅደም ተከተል ላይ የተመሰረተ ነው።ማይክሮ አራራይ የሚከናወነው ስለ ቅደም ተከተሎች ቀድሞ ባለው እውቀት ነው እና አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የሚከናወነው ስለ ቅደም ተከተሎች ቀድሞ እውቀት ሳይኖረው ነው።
ማይክሮአረይ ምንድነው?
ማይክሮአራይ ጠንካራ፣ አስተማማኝ እና ከፍተኛ የግብአት ዘዴ ነው ለሳይንቲስቶች ግልባጭ መረጃ። ለትራንስክሪፕት ትንተና በጣም ታዋቂው አቀራረብ ነው. በዝቅተኛ ወጪ ዘዴ ነው፣ እሱም በድብልቅ መመርመሪያዎች ላይ የተመሰረተ።
ቴክኒኩ የሚጀምረው ኤምአርኤን ከናሙና በማውጣት እና የሲዲኤንኤ ቤተመፃሕፍት ከጠቅላላ አር ኤን ኤ በመገንባት ነው። ከዚያም በጠንካራ ወለል ላይ (ስፖት ማትሪክስ) ላይ በፍሎረሰንት ከተሰየሙ አስቀድሞ ከተነደፉ መመርመሪያዎች ጋር ይደባለቃል። ተጨማሪ ቅደም ተከተሎች በማይክሮአራራይ ውስጥ ከተሰየሙት መመርመሪያዎች ጋር ይደባለቃሉ። ከዚያም ማይክሮ አራራይ ታጥቦ ይጣራል, እና ምስሉ በቁጥር ይገለጻል. አንጻራዊ መግለጫ መገለጫዎችን ለማግኘት የተሰበሰበው ውሂብ መተንተን አለበት።
የማይክሮ አራራይ ፍተሻዎች ጥንካሬ በናሙና ውስጥ ካሉት ግልባጮች ብዛት ጋር ተመጣጣኝ ነው ተብሎ ይታሰባል።ይሁን እንጂ የቴክኒኩ ትክክለኛነት በተዘጋጁት መመርመሪያዎች ላይ, ስለ ቅደም ተከተላቸው ቀደምት ዕውቀት እና ለድብልቅነት የመመርመሪያዎች ተያያዥነት ይወሰናል. ስለዚህ የማይክሮአራራይ ቴክኖሎጂ ውስንነቶች አሉት። የማይክሮአረይ ቴክኒክ በአነስተኛ የተትረፈረፈ ትራንስክሪፕት ሊከናወን አይችልም። አይዞፎርሞችን መለየት እና የዘረመል ልዩነቶችን መለየት አልቻለም። ይህ ዘዴ መመርመሪያዎችን በማዳቀል ላይ የሚመረኮዝ በመሆኑ አንዳንድ ከመዳቀል ጋር የተያያዙ እንደ መስቀል-ማዳቀል፣ ልዩ ያልሆነ ማዳቀል ወዘተ የመሳሰሉት በማይክሮ አራራይ ቴክኒክ ይከሰታሉ።
ሥዕል 01፡ ማይክሮአራይ
አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ምንድን ነው?
አር ኤን ኤ የተኩስ ቅደም ተከተል (አር ኤን ኤ ሴክ) በቅርብ ጊዜ የተሻሻለ ሙሉ የጽሑፍ ቅደም ተከተል ቴክኒክ ነው። ፈጣን እና ከፍተኛ የመገለባበጥ የመገለጫ ዘዴ ነው። የጂኖችን አገላለጽ በቀጥታ ይለካዋል እና የትራንስክሪፕት ጥልቅ ምርመራን ያስከትላል።አር ኤን ኤ ሴክ አስቀድሞ በተነደፉ መመርመሪያዎች ወይም ስለ ቅደም ተከተሎች ቀደም ባለው እውቀት ላይ የተመካ አይደለም። ስለዚህ የአር ኤን ኤ ሴክ ዘዴ ከፍተኛ ስሜታዊነት እና አዳዲስ ጂኖችን እና የዘረመል ልዩነቶችን የመለየት ችሎታ አለው።
አር ኤን ኤ የመከተል ዘዴ በበርካታ ደረጃዎች ይከናወናል። የሕዋስ አጠቃላይ አር ኤን ኤ ተለይቶ እና የተበታተነ መሆን አለበት። ከዚያም፣ በግልባጭ ትራንስክሪፕትሴዝ በመጠቀም፣ የሲዲኤንኤ ቤተ-መጽሐፍት መዘጋጀት አለበት። እያንዳንዱ የሲዲኤንኤ ገመድ ከአስማሚዎች ጋር መያያዝ አለበት። ከዚያም የተጣበቁ ቁርጥራጮች መጨመር እና ማጽዳት አለባቸው. በመጨረሻም የኤንጂኤስ ዘዴን በመጠቀም የሲዲኤንኤ ቅደም ተከተል መከናወን አለበት።
ምስል 02፡ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
በማይክሮአረይ እና አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
ማይክሮአረይ vs አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል |
|
| ማይክሮአራይ ጠንካራ፣ አስተማማኝ፣ ከፍተኛ የመተላለፊያ ዘዴ ነው። | አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ትክክለኛ እና ከፍተኛ-የተሰራ ዘዴ ነው። |
| ወጪ | |
| ይህ ዝቅተኛ ዋጋ ያለው ዘዴ ነው። | ይህ በጣም ውድ ዘዴ ነው። |
| የብዙ ናሙናዎች ትንተና | |
| ይህ ብዙ ቁጥር ያላቸውን ናሙናዎች በአንድ ጊዜ ለመተንተን ያመቻቻል። | ይህ ብዙ ቁጥር ያላቸውን ናሙናዎች ለመተንተን ያመቻቻል። |
| የመረጃ ትንተና | |
| የመረጃ ትንተና ውስብስብ ነው። | በዚህ ዘዴ ተጨማሪ መረጃ ይፈጠራል። ስለዚህ ሂደቱ የበለጠ የተወሳሰበ ነው። |
| የቅደም ተከተሎች እውቀት | |
| ይህ ዘዴ በድብልቅ መመርመሪያዎች ላይ የተመሰረተ ነው፣ስለዚህ ስለ ቅደም ተከተሎች ቅድመ እውቀት ያስፈልጋል። | ይህ ዘዴ በቀደመው ተከታታይ እውቀት ላይ የተመካ አይደለም። |
| የመዋቅር ልዩነቶች እና ልብወለድ ጂኖች | |
| ይህ ዘዴ መዋቅራዊ ልዩነቶችን እና አዲስ ጂኖችን መለየት አይችልም። | ይህ ዘዴ እንደ ጂን ፊውዚንግ፣ አማራጭ ስፔሊንግ እና አዲስ ጂኖች ያሉ መዋቅራዊ ልዩነቶችን መለየት ይችላል። |
| ትብነት | |
| ይህ የአይሶፎርሞች አገላለጽ ልዩነቶችን ማወቅ አይችልም፣ስለዚህ ይህ የተገደበ ትብነት አለው። | ይህ ከፍተኛ ትብነት አለው። |
| ውጤት | |
| ይህ ሊያስከትል የሚችለው አንጻራዊ አገላለጽ ደረጃዎችን ብቻ ነው። ይህ የጂን አገላለጽ ፍጹም መጠን አይሰጥም። | ፍጹም እና አንጻራዊ የገለጻ ደረጃዎችን ይሰጣል። |
| የመረጃ ዳግም ትንተና | |
| ይህ እንደገና ለመተንተን እንደገና መጀመር አለበት። | የቅደም ተከተል ውሂብ እንደገና ሊተነተን ይችላል። |
| የልዩ ሰው እና መሠረተ ልማት ፍላጎት | |
| የተወሰነ መሠረተ ልማት እና ሰራተኞች ለማይክሮ አደራደር አያስፈልግም። | የተወሰኑ መሠረተ ልማት እና ሰራተኞች በአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ያስፈልጋል። |
| ቴክኒካዊ ጉዳዮች | |
| ማይክሮ አደራደር ቴክኒክ እንደ ማዳቀል፣ ልዩ ያልሆነ ማዳቀል፣ የተናጠል መመርመሪያዎች የመለየት መጠን ውስን፣ ወዘተ ያሉ ቴክኒካዊ ጉዳዮች አሉት። | አር ኤን ኤ ሴክ ቴክኒክ እንደ ማዳቀል፣ ልዩ ያልሆነ ማዳቀል፣ የተናጠል መመርመሪያዎችን የመለየት ፍጥነት እና የመሳሰሉትን ቴክኒካል ጉዳዮችን ያስወግዳል። |
| አድልኦዎች | |
| ይህ አድሏዊ ዘዴ ነው ምክንያቱም በመዳቀል ላይ የተመሰረተ ነው። | ቢያስ ከማይክሮ አራራይ ጋር ሲነጻጸር ዝቅተኛ ነው። |
ማጠቃለያ - ማይክሮአረይ vs አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
ማይክሮ ሬይ እና አር ኤን ኤ መከተያ ዘዴዎች ለግልጽነት መገለጫዎች የተፈጠሩ ከፍተኛ የውጤት መድረኮች ናቸው። ሁለቱም ዘዴዎች ከጂን መግለጫዎች ጋር በጣም የተቆራኙ ውጤቶችን ያስገኛሉ. ነገር ግን፣ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ለጂን አገላለጽ ትንተና ከማይክሮ አራራይ ይልቅ ጥቅሞች አሉት። የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ከማይክሮ አራራይ ይልቅ ዝቅተኛ የተትረፈረፈ ግልባጮችን ለመለየት የበለጠ ስሱ ዘዴ ነው። የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል እንዲሁ በአይዞፎርሞች መካከል ያለውን ልዩነት እና የጂን ልዩነቶችን መለየት ያስችላል። ሆኖም ማይክሮ አራራይ የብዙዎቹ ተመራማሪዎች ምርጫ ነው ምክንያቱም አር ኤን ኤ ተከታታይነት ያለው አዲስ እና ውድ ቴክኒክ በመረጃ ማከማቻ ተግዳሮቶች እና ውስብስብ የመረጃ ትንተና።
