በክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና በተኩስ ቅደም ተከተል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት በባህሪያቸው ላይ ነው። ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል ዘዴ የክሮሞሶም ካርታዎችን እና ክሎኒንግን ከመከታታቱ በፊት ያካትታል ፣ ክሎን በሽጉጥ ቅደም ተከተል በቅደም ተከተል ሁለቱንም የክሮሞሶም ካርታ እና የክሎኒንግ ደረጃዎችን ያስወግዳል።
ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና ክሎን በሽጉጥ ቅደም ተከተል የዘመናዊ ጂኖም ቅደም ተከተል ሁለት ዘዴዎች ናቸው። ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል ይበልጥ አስተማማኝ የሆነ የቅደም ተከተል ዘዴ ነው። ሆኖም ግን, በሾት ሽጉጥ ቅደም ተከተል የክሎሎን ዘዴ ፈጣን እና ርካሽ ነው. ጽሑፉ የሚያተኩረው በክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና በተኩስ ቅደም ተከተል መካከል ባለው ስውር ልዩነት ላይ ነው።
Clone በ Clone Sequencing ምንድን ነው?
Clone በ clone sequencing የጂኖም ቅደም ተከተል ዘዴ ነው። ዲኤንኤ ከመከፋፈሉ በፊት የእያንዳንዱን ክሮሞሶም ካርታ ማዘጋጀት ያስፈልገዋል። ካርታ ከተሰራ በኋላ ዲ ኤን ኤው ወደ 150 ኪሎባዝ ርዝመት ያለው ቁርጥራጮች መከፋፈል አለበት። እነዚህ ቁርጥራጮች ለቅደም ተከተል ዝግጁ ናቸው። ቀጣዩ ደረጃ የዲኤንኤ ቁርጥራጮችን ወደ ባክቴሪያል አርቲፊሻል ክሮሞሶም (BACs) ከዚያም ወደ ባክቴሪያ ህዋሶች ማስገባት ነው። ቁርጥራጮቹ አሁን በባክቴሪያ ሴሎች ውስጥ ስለሚገኙ ባክቴሪያዎቹ በተከፋፈሉ ቁጥር የገቡት የዲ ኤን ኤ ቁርጥራጮች ተከፋፍለው ብዙ ተመሳሳይ ቅጂዎችን ይፈጥራሉ። ከዚያም የግለሰቡ የባክቴሪያ ክሎነ ዲ ኤን ኤ ወደ 500 የመሠረት ጥንድ ረጅም ቁርጥራጮች ይከፈላል ። ያነሱ እና ተደራራቢ ቁርጥራጮች ናቸው። በመቀጠል, ቅደም ተከተላቸው የሚከናወነው እነዚህን ቁርጥራጮች በሚታወቀው የዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተል ወደ ቬክተር ውስጥ በማስገባት ነው. ከሚታወቀው የቬክተር ቅደም ተከተል ጀምሮ፣ ቅደም ተከተል እስከማይታወቅ ቅደም ተከተል ድረስ ይቀጥላል።
ቅደም ተከተሎችን ከጨረሱ በኋላ የተደራረቡ ቅደም ተከተሎችን ቦታዎችን መለየት ያስፈልጋል።ከዚያ በኋላ፣ ቁርጥራጮቹን መቀላቀል የሚከናወነው በመጀመሪያ በ BACs ውስጥ የቀረቡትን ትላልቅ ቁርጥራጮች ይመሰርታል። በመቀጠል ትላልቅ ቁርጥራጮችን ወደ ክሮሞሶም መሰብሰብ በጂኖም ካርታው መሰረት ይከናወናል።
ሥዕል 01፡ Clone በClone Sequencing
የ clone በክሎን ቅደም ተከተል ያለው ጉልህ ጥቅም አስቀድሞ የተዘጋጀው የጂኖም ካርታ ትላልቅ ቁርጥራጮችን አስተማማኝ በሆነ መንገድ እንዲገጣጠም ማገዝ ነው። ነገር ግን የዚህ የቅደም ተከተል ዘዴ ጉዳቱ የጂኖም ካርታዎችን ለመፍጠር እና ክሎኖችን ለመሥራት ጊዜ የሚወስድ መሆኑ ነው። ነገር ግን ይህ በ'Human Genome Project' ጊዜ ተመራጭ ዘዴ ነበር።
Clone በ Shotgun Sequencing ምንድን ነው?
ክሎን በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን በዘፈቀደ ወደ ብዙ ትናንሽ ቁርጥራጮች የሚከፋፍል እና ተደራራቢ ክልሎችን በመመልከት ቅደም ተከተሎችን የሚሰበስብ ነው።ትላልቅ አጥቢ እንስሳት ጂኖም ቅደም ተከተሎችን ለመዝጋት እና ለመሰብሰብ አስቸጋሪ ናቸው. መዋቅራዊ ውስብስብነታቸው እና መጠናቸው ነው. ምንም እንኳን ክሎኑ በክሎን ቅደም ተከተል ዘዴ አስተማማኝ ቢሆንም ውስብስብ ፍጥረታትን ጂኖም ቅደም ተከተል ለማስያዝ ረጅም ጊዜ ይወስዳል። ስለዚህ, ክሎን በሾት ሽጉጥ ቅደም ተከተል በፍጥነት ሊከናወን የሚችል አስተማማኝ ርካሽ ቅደም ተከተል ዘዴ ሆኗል. ስለሆነም የዘመናችን ሳይንቲስቶች ውስብስብ ጂኖምዎችን ለመቋቋም በዚህ ተከታታይ ዘዴ ይተማመናሉ።
ስእል 02፡ ክሎን በሾትጉን ቅደም ተከተል
በክሎን በተተኮሰ የሽጉጥ ቅደም ተከተል ዘዴ፣ ምንም አይነት የተለመዱ የጂኖም ካርታዎች እና የክሎኒንግ እርምጃዎች አይከናወኑም። መጀመሪያ ላይ ሙሉው ጂኖም ከ 20 ኪሎባዝ እስከ 300 ኪሎ ቤዝ በተለያየ መጠኖች የተከፋፈለ ነው. በመቀጠል ቅደም ተከተል ይከናወናል.ከዚያም የተራቀቀ የኮምፒዩተር ሶፍትዌሮችን በመጠቀም ተደራራቢ ክልሎችን በማየት ቁርጥራጮቹን ማሰባሰብ ያስፈልጋል።
Clone በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል የነባር የጂኖም ቅደም ተከተሎችን ትክክለኛነት ለማሻሻል ይረዳል። የዚህ ዘዴ ዋነኛው ጥቅም በክሎን ቅደም ተከተል ዘዴ ከክሎሎን በጣም ፈጣን እና ያነሰ ዋጋ ያለው ነው. ሆኖም, ይህ ሂደት የጄኔቲክ ካርታ አጠቃቀምን አያካትትም. ስለዚህ, በስብስቡ ወቅት ስህተቶች በብዛት ይከሰታሉ. ስለዚህ፣ ይህ በ clone በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል ዘዴ ትልቅ ኪሳራ ነው።
ከክሎን በClone Sequencing እና Shotgun Sequencing መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- ሁለቱም ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና የተኩስ ቅደም ተከተል ሁለት የጂኖም ቅደም ተከተል ዘዴዎች ናቸው።
- በሁለቱም የቅደም ተከተል ቴክኒኮች፣የተበላሹ ቁርጥራጮችን በመገጣጠም የተደራረቡ ክልሎችን በመለየት ይከናወናል።
- እንዲሁም ዲኤንኤ ወደ ትናንሽ ቁርጥራጮች መከፋፈል ለሁለቱም ክሎሎን እና የተኩስ ጠመንጃ ቅደም ተከተል አስፈላጊ ነው።
ከክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና በተኩስ ቅደም ተከተል መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል ቴክኒክ ሁለት ዋና ዋና ደረጃዎችን ያካትታል፡ የክሮሞሶም ካርታ እና ክሎኒንግ። በአንጻሩ፣ ክሎን በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል እነዚህን ሁለት ደረጃዎች አይከተልም። በዘፈቀደ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ወደ ብዙ ትናንሽ ቁርጥራጮች ይከፋፍላል እና ተደራራቢ ክልሎችን በመመልከት ቅደም ተከተሎችን ይሰበስባል። ስለዚህ፣ ይህ በ clone በ clone sequencing እና በጠመንጃ ቅደም ተከተል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። በዚህ ምክንያት፣ clone by clone sequencing ውድ እና ጊዜ የሚወስድ ሂደት ሲሆን ክሎን በተኩስ ቅደም ተከተል ፈጣን እና ርካሽ ነው።
ነገር ግን፣በስብሰባ ወቅት ስህተቶች በክሎን ቅደም ተከተል የመከሰት ዕድላቸው አነስተኛ ነው። ስለዚህ, ከፍተኛ አስተማማኝነት አለው. ሆኖም፣ ክሎን በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል በንፅፅር ብዙም አስተማማኝ ቴክኒክ ነው። ስለዚህ፣ ይህ እንዲሁ በክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና በተኩስ ቅደም ተከተል መካከል ያለው ጉልህ ልዩነት ነው።
ከታች ያለው መረጃ ግራፊክስ በክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና በተኩስ ቅደም ተከተል መካከል ያለውን ልዩነት በተመለከተ ተጨማሪ መረጃን ያቀርባል።
ማጠቃለያ - ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል vs Shotgun Sequencing
በክሎን በክሎን ቅደም ተከተል እና በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል መካከል ያለውን ልዩነት በማጠቃለል፣ ክሎኑ በክሎን ቅደም ተከተል እና የተኩስ ሽጉጥ ቅደም ተከተል ሁለት የጂኖም ቅደም ተከተል ዘዴዎች ናቸው። ሆኖም፣ ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል ቴክኒክ ሁለቱንም የጂኖም ካርታዎች እና የክሎኒንግ ሂደቶችን ያካትታል፣ ክሎን በሾት ሽጉጥ ቅደም ተከተል ግን አይሰራም። ስለዚህ፣ ይህ በ clone በ clone sequencing እና በጠመንጃ ቅደም ተከተል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። የጂኖም ካርታ በክሎን በክሎን ቅደም ተከተል ስለሚካሄድ, ቅደም ተከተሎችን በሚሰበሰብበት ጊዜ ስህተቶች የመከሰታቸው ዕድላቸው አነስተኛ ነው.ነገር ግን፣ ክሎን በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል በጣም ፈጣን እና ርካሽ ሂደት ነው። ሆኖም ግን በአንፃራዊነት አስተማማኝነቱ አነስተኛ ነው። ክሎን በክሎን ቅደም ተከተል በ 'Human Genome Project' ወቅት ተመራጭ ቅደም ተከተል ዘዴ ነበር። ነገር ግን፣ የዘመናችን ሞለኪውላር ባዮሎጂስት በጥይት ሽጉጥ ቅደም ተከተል በክሎን ላይ የበለጠ ይተማመናል።
