በMLVA እና MLST መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት MLVA ጥቃቅን ተህዋሲያንን ለመለየት በተከታታይ የተደጋገሙ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ፖሊሞርፊዝም ይጠቀማል፣ MLST ደግሞ ማይክሮቢያል ዝርያዎችን ለመለየት የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች የብዙ የቤት አያያዝ ጂኖች መኖሩ ነው።
ማይክሮባይል ትየባ በተለምዶ የኢንፌክሽን ምንጭ እና መንገዶችን ለማወቅ ይጠቅማል። ወረርሽኙን ያረጋግጣል ወይም ያስወግዳል። ማይክሮባይል መተየብ ከጤና አጠባበቅ ጋር የተገናኙ በሽታ አምጪ ተህዋሲያን አቋራጭ ስርጭትን ይከታተላል እና የቫይረስ ዝርያዎችን ይለያል። ከዚህም በላይ ረቂቅ ተሕዋስያን መተየብ በሽታ አምጪ ተሕዋስያን ዝርያዎችን የመቆጣጠሪያ እርምጃዎችን ውጤታማነት ይገመግማል. MLVA እና MLST ሁለት ሞለኪውላዊ ባዮሎጂካል ቴክኒኮች በጥቃቅን ተህዋስያን ትየባ ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላሉ።
MLVA ምንድን ነው?
Multiple loci VNTR ትንታኔ (MLVA) ሞለኪውላር ባዮሎጂካል ዘዴ ሲሆን ይህም ጥቃቅን ተህዋሲያንን ለመለየት በተደጋገሙ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ፖሊሞፈርዝም ይጠቀማል። ለተወሰኑ ጥቃቅን ተህዋሲያን የዘረመል ትንተና የሚያገለግል ዘዴ ነው።
በMLVA የመጀመሪያ ደረጃ እያንዳንዱ የታለመ የVNTR ቦታ በ PCR በጎን ክልል-ተኮር ፕሪመር ተጨምሯል። ከዚያም የተገኙት ቁርጥራጮች በካፒታል ቅደም ተከተል ላይ በኤሌክትሮፊዮሬሲስ የተከፋፈሉ ናቸው. የእያንዳንዱ ቦታ ጂኖቲፒ እና ከእያንዳንዱ ናሙና የተጠናቀረው ውጤት ዝርያቸው የሚታወቅ ረቂቅ ተሕዋስያንን ለመለየት ያስችላል። እንዲሁም ንዑስ ዝርያዎችን በ allele ትየባ መለየት እና ከMLVA የውሂብ ጎታዎች ጋር ማወዳደር ያስችላል።
ምስል 01፡ MLVA
ይህ የMLVA ዘዴ ከMLST ዘዴ የበለጠ ተመራጭ ነው። በተጨማሪም የ MLVA ዘዴ የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ደረጃ አያስፈልገውም. ስለዚህም የቅርብ ንዑስ ዝርያዎችን ወይም የክሎናል ዝርያዎችን ለመለየት ያስችላል።
MLST ምንድን ነው?
Multilocus sequence typing (MLST) ረቂቅ ተሕዋስያን ዝርያዎችን ለመለየት የበርካታ የቤት አያያዝ ጂኖች የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ፖሊሞርፊዝም የሚጠቀም ቴክኒክ ነው። MLST የበርካታ ቦታዎችን ለመተየብ የዘረመል ትንተና ዘዴ ነው።
ምስል 02፡ MLST
የተለያዩ ጥቃቅን ተህዋሲያን ዝርያዎችን ለመለየት እንደ ዋቢ ቴክኒክ የሚያገለግል የቅደም ተከተል ትየባ አይነት ነው። ይህ ዘዴ በቤት አያያዝ ጂኖች ቅደም ተከተል ላይ የተመሰረተ ነው.የቤት አያያዝ ጂኖች በመደበኛነት እንደ ባክቴሪያ ያሉ የማይክሮባላዊ ወኪሎችን አስፈላጊ ፕሮቲኖችን ያመለክታሉ። እነዚህ ቅደም ተከተሎች የቤት አያያዝ ጂኖች በጊዜ ሂደት የተረጋጋ ፖሊሞርፊዝምን የማቅረብ ልዩነት አላቸው። ስለዚህ, የቤት አያያዝ ጂኖች ቅደም ተከተሎች ልዩነቶች እርስ በርሳቸው ለመለየት በቂ ናቸው. በተጨማሪም፣ የመጀመሪያው የMLST እቅድ የተዘጋጀው የማጅራት ገትር በሽታ እና ሴፕቲክሚያ በሽታ መንስኤ የሆነው ኒሴሪያ ሜኒንጊቲዲስ ነው። ከመግቢያው ጀምሮ፣ MLST ለሰው በሽታ አምጪ ተውሳኮች ብቻ ሳይሆን ለዕፅዋት በሽታ አምጪ ተህዋስያንም ጥቅም ላይ ውሏል።
በMLVA እና MLST መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- MLVA እና MLST ሁለት ሞለኪውላዊ ባዮሎጂካል ቴክኒኮች በጥቃቅን ተህዋሲያን ትየባ ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላሉ።
- ሁለቱም ቴክኒኮች ለማይክሮባዮል ፋይሎጄኔቲክ ትንታኔ ሊያገለግሉ ይችላሉ።
- ሁለቱም ቴክኒኮች በጄኔቲክ ፖሊሞርፊዝም ላይ የተመሰረቱ ናቸው።
- ማይክሮባይል በሽታ አምጪ ተህዋስያንን የሚያስከትሉ የሰዎች በሽታዎችን ለመለየት ሊያገለግሉ ይችላሉ።
- ሁለቱም ቴክኒኮች በሰለጠነ ሞለኪውላር ባዮሎጂስቶች መከናወን አለባቸው።
በMLVA እና MLST መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
MLVA የማይክሮቢያዊ ዝርያዎችን ለመለየት በተከታታይ የሚደጋገሙ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን (polymorphism) የሚጠቀም ቴክኒክ ነው። ይህ በእንዲህ እንዳለ፣ MLST ረቂቅ ተሕዋስያን ዝርያዎችን ለመለየት የበርካታ የቤት አያያዝ ጂኖች የውስጥ ክፍልፋዮችን የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ፖሊሞርፊዝም የሚጠቀም ቴክኒክ ነው። ስለዚህ ይህ በ MLVA እና MLST መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። በተጨማሪም የMLVA ዘዴ ከMLST ዘዴ የበለጠ መራጭ ነው።
ከታች ያለው መረጃግራፊክ በMLVA እና MLST መካከል ያለውን ልዩነት በጎን ለጎን ለማነፃፀር በሰንጠረዥ ያቀርባል።
ማጠቃለያ - MLVA vs MLST
MLVA እና MLST ሁለት ሞለኪውላዊ ባዮሎጂካል ቴክኒኮች በማይክሮባይል ትየባ ናቸው። MLVA የጥቃቅን ዝርያዎችን ለመለየት በተከታታይ የተደጋገሙ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ፖሊሞርፊዝም ይጠቀማል፣ MLST ደግሞ ማይክሮቢያል ዝርያዎችን ለመለየት የዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን የብዙ የቤት አያያዝ ጂኖች ፖሊሞርፊዝም ይጠቀማል።ስለዚህ፣ ይህ በMLVA እና MLST መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
