በፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ እና ራይቦዞም ፕሮፋይል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ፖሊሶም ፕሮፋይል በትርጉም ጊዜ ሁለቱንም ራይቦዞም እና ኤምአርኤን (ፖሊሶም) በመጠቀም የሪቦዞም ባህሪን ይተነትናል፣ ራይቦዞም ፕሮፋይሊንግ ደግሞ በትርጉም ጊዜ የኤምአርኤን ቅደም ተከተል በመጠቀም ብቻ የሪቦዞም ባህሪን ይተነትናል።
ትርጉም በኤምአርኤን ውስጥ ያለውን መረጃ ወደ አሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል የሚቀይር የፕሮቲን ውህደት ሁለተኛ ደረጃ ነው። ትራንስላቶሚክስ በኦርጋኒክ ሕዋስ ውስጥ በንቃት የሚተረጎሙ የ ORFs (ክፍት የንባብ ፍሬሞች) ጥናት ነው። ፖሊሶም እና ራይቦዞም ፕሮፋይሊንግ ቴክኒኮች በሞለኪውላር ባዮሎጂ መስክ ሁለት ዓይነት ቴክኒኮችን ለመገምገም እና ለትርጉም ትንተና በመተንተን የተለያዩ መለኪያዎችን ለመገምገም ነው።
ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ ምንድን ነው?
የፖሊሶም ፕሮፋይል የሪቦዞም እና ኤምአርኤን (ፖሊሶም) ባህሪን በመተንተን የአንድ የተወሰነ ኤምአርኤን የትርጉም ደረጃን የሚያመለክት ዘዴ ነው። በሌላ አነጋገር, ይህ ዘዴ ኤምአርኤን ከ ribosomes ጋር በማያያዝ መረጃን እና መደምደሚያዎችን ያቀርባል. ፖሊሶም የሚያመለክተው በትርጉም ማራዘሚያ ወቅት ካለው ኤምአርኤን ጋር የተቆራኘውን የሪቦዞም ቡድን ነው።
ስእል 01፡ ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ
የፖሊሶም ፕሮፋይል ማድረግ የሕዋስ lysate ያስፈልገዋል፣ይህም ሴንትሪፉፉድ ነው። ከዚያም ሴንትሪፉድ የተደረገው ናሙና በእፍጋታቸው ላይ ተመስርቶ ትናንሽ እና ትላልቅ የሪቦዞምስ ክፍሎች እና በፖሊሶም መፈጠር ውስጥ የተሳተፈውን ኤምአርኤን ለመለየት ያስችላል።በተጨማሪም ሂደቱ የኦፕቲካል እፍጋትን መለካትንም ያካትታል። ባለሙያዎች ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ ማድረግ አለባቸው።
የፖሊሶም ፕሮፋይል ቴክኒክ ለብዙ አፕሊኬሽኖች ጠቃሚ መሳሪያ ነው። የሳይንስ ሊቃውንት በሴሎች ውስጥ የትርጉም ደረጃን ለማጥናት ይህንን ዘዴ ይጠቀማሉ. በተለየ መልኩ, በግለሰብ ፕሮቲኖች እና በተወሰኑ ኤምአርኤንኤዎች ጥናት ላይ ትክክለኛ መረጃን ለማቅረብ መሳሪያ ነው. የአንድ የተወሰነ mRNA የትርጉም ደረጃን በማጥናት አውድ ውስጥ፣ የፖሊሶም ፕሮፋይል ቴክኒክ አስፈላጊ ነው። እዚህ፣ የአንድ mRNA 3' እና 5' ቅደም ተከተሎች በተመረተው ኤምአርኤን መጠን እና የትርጉም ደረጃ ላይ ያላቸውን ተፅእኖ በማጣቀስ ሊመረመሩ ይችላሉ።
ሪቦዞም ፕሮፋይሊንግ ምንድን ነው?
Ribosome ፕሮፋይሊንግ በትርጉም ጊዜ የሪቦዞምን ባህሪ ከኤምአርኤን አንፃር የሚተነተን ዘዴ ነው። ይህ ዘዴ የተገኘው እና የተገነባው በጆአን ስቴትዝ እና ማሪሊን ኮዛክ ነው። በኋላ ይህ ቴክኖሎጂ በሁለት ሳይንቲስቶች ኒኮላስ እና ጆናታን ከቀጣዩ ትውልድ ቅደም ተከተል ጋር በማጣመር እንደ ሪቦዞም አፊኒቲ ማጽጃ (ትራፕ) ዘዴን የመሳሰሉ የተለያዩ ተዛማጅ ቴክኒኮችን መፍጠር ችሏል።
ምስል 02፡ Ribosome Sequencing
የሪቦዞም ፕሮፋይሊንግ ሂደት ኤምአርኤንን ማግለል፣ ከ ribosomes ጋር ያልተገናኘውን አር ኤንኤን ማስወገድ እና ኤምአርኤን ከ ribosomes ጋር መለየትን ያካትታል። ይህን አሰራር ተከትሎ፣ የኤምአርኤን ኤ ማግለል በተቃራኒው ይገለበጣል፣ እና ሲዲኤንኤ ውህደት ይከናወናል። በመጨረሻም፣የሪቦዞም ባህሪ ባህሪያትን ከኤምአርኤን አንጻር ለማወቅ ከትርጉም መገለጫው ጋር የተከታታይ ውሂብ ሊስተካከል ይችላል።
Ribosome ፕሮፋይል ብዙ ተመራማሪዎች የትርጉም ድረ-ገጾች የሚገኙበትን ቦታ፣ የተተረጎሙ ክፍት የንባብ ክፈፎች (ኦአርኤፍ) በሴል ወይም በቲሹ ውስጥ ያለውን ማሟያ፣ የራይቦዞም ስርጭት በኤምአርኤን እና በኤምአርኤን ላይ ያለውን ስርጭት ለማወቅ እና የዚ ራይቦዞምስ መተርጎም.ሪቦዞም ፕሮፋይሊንግ ሪቦዞም የእግር አሻራ ወይም ሪቦ ሴክ በመባልም ይታወቃል።
በፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ እና በሪቦዞም ፕሮፋይሊንግ መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- ፖሊሶም እና ራይቦዞም ፕሮፋይሊንግ ሞለኪውላር ባዮሎጂካል ቴክኒኮች ለምርምር ጠቃሚ ናቸው።
- በየትርጉም ሂደት ላይ መረጃ ይሰጣሉ።
- ሁለቱም የመገለጫ ሂደቶች መረጃን በትርጉም ትንተና ይሰጣሉ።
- የሙያ ባለሞያዎች ሁለቱንም ቴክኒኮች ለትክክለኛውጤት ያስፈልጋሉ።
- የባዮኢንፎርማቲክስ መሳሪያዎች በሁለቱም ቴክኒኮች ውስጥ ትልቅ ሚና ይጫወታሉ።
በፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ እና በሪቦዞም ፕሮፋይሊንግ መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ በትርጉም ጊዜ ሁለቱንም ራይቦዞም እና ኤምአርኤን (ፖሊሶም) በመጠቀም የሪቦዞም ባህሪን ይተነትናል፣ ራይቦዞም ፕሮፋይሊንግ ደግሞ በትርጉም ጊዜ የኤምአርኤን ቅደም ተከተል በመጠቀም ብቻ የሪቦዞም ባህሪን ይተነትናል።ስለዚህም ይህ በፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ እና በሪቦዞም ፕሮፋይል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። በተጨማሪም፣ ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ እንደ density gradient centrifugation እና optical density መለኪያዎችን ያካትታል፣ ራይቦዞም ፕሮፋይሊንግ ደግሞ ኤምአርኤን ማውጣት እና ተከታታይ ቴክኒኮችን ያካትታል። እንዲሁም የሪቦዞም ፕሮፋይል ከፖሊሶም ፕሮፋይል የበለጠ ትክክል ነው።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በፖሊሶም እና ራይቦዞም ፕሮፋይል መካከል ያለውን ልዩነት በሠንጠረዥ መልክ ከጎን ለጎን ለማነፃፀር ያቀርባል።
ማጠቃለያ - ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ vs Ribosome Profiling
ትርጉም በኤምአርኤን ላይ ያለውን መረጃ ወደ አሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል መቀየርን የሚያካትት የፕሮቲን ውህደት ሁለተኛ ምዕራፍ ነው። ይህ ሂደት የኤምአርኤን አብነት፣ ራይቦዞምስ፣ አሚኖ አሲዶች፣ tRNA እና ሌሎች ነገሮች ያስፈልገዋል። ፖሊሶም እና ራይቦዞም ፕሮፋይል ሁለት ሞለኪውላዊ ቴክኒኮች ናቸው። ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ በትርጉም ጊዜ ሁለቱንም ራይቦዞም እና ኤምአርኤን (ፖሊሶም) በመጠቀም የሪቦዞም ባህሪን ይተነትናል፣ ራይቦዞም ፕሮፋይሊንግ ደግሞ በትርጉም ጊዜ የኤምአርኤን ቅደም ተከተል በመጠቀም ብቻ የሪቦዞም ባህሪን ይተነትናል።ፖሊሶም ፕሮፋይሊንግ እንደ ጥግግት ቅልመት ሴንትሪፍግሽን እና የጨረር ጥግግት መለኪያዎችን ያካትታል። የሪቦዞም ፕሮፋይሊንግ እንደ mRNA ማውጣት፣ ሲዲኤንኤ ውህደት እና ቅደም ተከተል ያሉ ቴክኒኮችን ያካትታል። ስለዚህ፣ ይህ በፖሊሶም ፕሮፋይል እና ራይቦዞም ፕሮፋይል መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
