በሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ እና በሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ የፕሮቲን ዲሜሪዜሽን ሲያስተላልፍ ሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ የጂን አገላለፅን በዲኤንኤ ማሰሪያ ይቆጣጠራል።
የፕሮቲን ሞቲፍ ከተለየ የዲኤንኤ ተግባራት ጋር የተቆራኘ አጭር-የተጠበቀ ቅደም ተከተል ነው። በዋናነት ልዩ የሆነ ኬሚካል ወይም ባዮሎጂካል ተግባር ካለው ልዩ መዋቅራዊ ቦታ ጋር የተያያዘ ነው። እነዚህ ዘይቤዎች የተለያዩ የፕሮቲን ሞለኪውሎች ያሏቸው የአሚኖ አሲዶች ባለ ሶስት አቅጣጫዊ አወቃቀሮች ትናንሽ ክልሎችን ይይዛሉ። ብዙውን ጊዜ የግለሰብ ዘይቤዎች ጥቂት ንጥረ ነገሮችን ብቻ ይይዛሉ። Helix-loop-helix እና Helix-turn-helix ሶስት አካላትን ይይዛሉ.የእነርሱ የፕሮቲን መዋቅራዊ ጭብጦች የተለያየ ርዝመት እና ያልተገለጹ አወቃቀሮች ያሏቸው loops ያካትታሉ።
Helix-Loop-Helix ምንድነው?
A Helix-loop-helix (HLH) የፕሮቲን መዋቅራዊ ሞቲፍ ሲሆን ከትልቅ ቤተሰቦች መካከል አንዱን የመገለባበጥ ሁኔታዎችን ይገልፃል። እነዚህ የጽሑፍ ግልባጭ ምክንያቶች የዲኤንኤ ትስስር ዘዴን ለማመቻቸት የአሚኖ አሲዶች ቅሪቶችን ይይዛሉ, እና ዲሜሪክ ናቸው. የፕሮቲን መዋቅራዊ ንድፍ ሁለት α-ሄልስ ይዟል, እና እነሱ በ loop የተገናኙ ናቸው. አንድ ሄሊክስ ከሁለቱ ሄሊክስ ያነሰ ሆኖ ይታያል፣ እና የሉፕው ተለዋዋጭነት ከሌላ ሄሊክስ ጋር በማሸግ እና በማጣጠፍ እንዲዳከም ያስችላል። ትልቅ የሚታየው ሄሊክስ አብዛኛውን ጊዜ ዲ ኤን ኤ የሚይዙ ክልሎችን ይይዛል። የ HLH ፕሮቲኖች ኢ-ሣጥን ተብሎ ከሚታወቀው የጋራ ስምምነት ቅደም ተከተል ጋር ይጣመራሉ። የስምምነት ቅደም ተከተል ኑክሊዮታይድ ወይም አሚኖ አሲድ ቀሪዎችን የያዘ የተሰላ ቅደም ተከተል ነው። ኢ-ቦክስ በአንዳንድ eukaryotes ውስጥ ለዲኤንኤ ምላሽ የሚሰጥ እንደ ፕሮቲን ማሰሪያ ጣቢያ ሆኖ የሚያገለግል እና የጂን አገላለፅን ይቆጣጠራል።
ስእል 01፡ Helix-loop-helix motif
የ HLH ግልባጭ ምክንያቶች ለዕድገት እና ለሴል እንቅስቃሴ አስፈላጊ ናቸው። HLH ፕሮቲኖች በዋነኛነት ከስድስት ቡድኖች የተውጣጡ ናቸው፣ እነዚህም ከሀ እስከ ኤፍ የሚያመለክቱ ናቸው። በእያንዳንዱ ቡድን ውስጥ የተካተቱት የመገለባበጥ ምክንያቶች፡
ቡድን A፡ MyoD፣ Myf5፣ Beta2/NeuroD1፣ Scl፣ p-CaMK፣ NeuroD እና Neurogenins፣
ቡድን B፡MAX፣C-Myc፣N-Myc እና TCF4
ቡድን ሲ፡ AhR፣ BMAL-1-CLOCK፣ HIF፣ NPAS1፣ NPAS3 እና MOP5
ቡድን D; EMC
ቡድን ኢ፡HEY1 እና HEY2
ቡድን ረ፡ EBF1
አብዛኞቹ የ HLH ግልባጭ ምክንያቶች ሄትሮዲመሪክ በመሆናቸው፣ ዲሜሪዜሽን ብዙ ጊዜ ይቆጣጠራል።
Helix-Turn-Helix ምንድነው?
Helix-turn-helix (HTH) የፕሮቲን መዋቅራዊ ሞቲፍ ሲሆን ዲኤንኤን ማሰር የሚችል ነው። እያንዳንዱ ሞኖመር በሁለት α-helices የተደራጀ እና በአጭር የአሚኖ አሲድ ክር ይቀላቀላል። ይህ በዲ ኤን ኤ ሄሊክስ ውስጥ ካለው ጎድጎድ ጋር ይያያዛል። የኤችቲኤችዲ ዘይቤዎች ብዙውን ጊዜ የጂን አገላለጽ ይቆጣጠራሉ። የኤችቲኤችዲ ማወቂያ እና ከዲ ኤን ኤ ጋር ማገናኘት የሚከናወነው በሁለት α-helices ነው። አንድ ሄሊክስ የኤን-ተርሚናል መጨረሻን ሲይዝ ሌላኛው በ C-terminus ላይ ነው። በአብዛኛዎቹ ሁኔታዎች, ሄሊክስ የዲኤንኤ እውቅናን ያካሂዳል. ስለዚህ, የማወቂያ ሄሊክስ በመባል ይታወቃል. በዲ ኤን ኤ ውስጥ ካለው ግሩቭ ጋር ያለው ትስስር የሚከናወነው በተከታታይ የቫን ደር ዋልስ መስተጋብር እና የሃይድሮጂን ቁርኝት ከመሠረት ጋር ነው። ሌላው α-ሄሊክስ የፕሮቲን እና የዲኤንኤ መስተጋብርን ያረጋጋል እና እውቅና ለመስጠት ትልቅ ሚና አይጫወትም. ሆኖም፣ የማወቂያ ሄሊክስ እና ቀሪው ሄሊክስ ተመሳሳይ አቅጣጫ አላቸው።
ሥዕል 02፡ Helix-turn-helix of TetR ቤተሰብ
ኤችቲኤችአይ የተመደበው በሄሊሲዎች መዋቅር እና የቦታ አቀማመጥ መሰረት ነው። ዋናዎቹ ዓይነቶች di-helical, tri-helical, tetra-helical, እና ባለ ክንፍ HTH ናቸው. ዲ-ሄሊካል ዓይነት ከሁለት ሄልስ እና ገለልተኛ የታጠፈ ፕሮቲን ጎራ ያለው ቀላሉ ዓይነት ነው። ባለሶስት ሄሊካል ዓይነት በጽሑፍ ግልባጭ አክቲቪተር Myb ውስጥ ይገኛል። ቴትራ ሄሊካል ዓይነት ተጨማሪ ሲ-ተርሚናል ሄሊክስ አለው። በመጨረሻም፣ ክንፍ ያለው HTH በ3-ሄሊካል ጥቅል እና 3- ወይም 4- strand beta sheet የተሰራ ነው።
በHelix-Loop-Helix እና Helix-Turn-Helix መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- Helix-loop-helix እና Helix-turn-helix የፕሮቲን መዋቅራዊ ምክንያቶች ናቸው።
- ሁለቱም ባሳል እና ልዩ የጽሑፍ ግልባጭ ሁኔታዎች ውስጥ አንድ የጋራ መለያ አላቸው።
- በ eukaryotes ውስጥ ይገኛሉ።
በ Helix-Loop-Helix እና Helix-Turn-Helix መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Helix-loop-helix የፕሮቲን ዳይሜሽንን ያማልዳል፣ሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ ግን የጂን አገላለፅን በዲኤንኤ ትስስር ይቆጣጠራል። ስለዚህ ይህ በሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ እና በሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው. በተጨማሪም፣ HLH የተወሰኑ ፕሮቶ-ኦንኮጂንስ እና የጽሑፍ ግልባጭ ሁኔታዎችን በመለየት ላይ የተሳተፉ ጂኖችን ይዟል፣ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤች ቲ ኤም ብዙ ሆሞቲክ ጂኖችን ይዟል። ከዚህም በላይ ሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ በዋነኛነት በአልፋ-ሄሊስ በ loop የተገናኙ ሲሆን ሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ በዋናነት በአጭር አሚኖ አሲድ መቆሚያ የተገጣጠሙ ቀለበቶችን ያቀፈ ነው።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ እና በሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ መካከል ያለውን ልዩነት በጎን ለጎን ለማነፃፀር በሰንጠረዡ ያቀርባል።
ማጠቃለያ - Helix-Loop-Helix vs Helix-Turn-Helix
የፕሮቲን ሞቲፍ ከተለየ የዲኤንኤ ተግባራት ጋር የተቆራኘ አጭር-የተጠበቀ ቅደም ተከተል ነው።Helix-loop-helix እና helix-turn-helix ሁለት አይነት የፕሮቲን መዋቅራዊ ዘይቤዎች ናቸው። በሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ እና በሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ የፕሮቲን ዳይሜሽንን ያገናኛል, ሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ ግን የጂን መግለጫን በዲ ኤን ኤ ትስስር ይቆጣጠራል. HLH ከትላልቅ ቤተሰቦች መካከል አንዱን የመገለባበጥ ሁኔታዎችን የሚያዳክም የፕሮቲን መዋቅራዊ ገጽታ ነው። የፕሮቲን መዋቅራዊ ንድፍ ሁለት α-ሄልስ ይዟል, እና እነሱ በ loop የተገናኙ ናቸው. ኤች ቲ ኤች ዲ ኤን ኤ ማገናኘት የሚችል የፕሮቲን መዋቅራዊ ንድፍ ነው። እያንዳንዱ ሞኖመር በሁለት α-helices የተደራጀ ነው፣ እና በአጭር የአሚኖ አሲድ ክር ይጣመራል እና በዲ ኤን ኤ ሄሊክስ ውስጥ ካለው ቦይ ጋር ይጣመራል። ስለዚህ፣ ይህ በሄሊክስ-ሉፕ-ሄሊክስ እና በሄሊክስ-ተርን-ሄሊክስ መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
