በአር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት አር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር ሲግማ ፋክተር የሌለው ኢንዛይም ሲሆን አር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ሆሎኤንዚም ደግሞ ሲግማ ፋክተር ያለው ኢንዛይም ነው።
በባክቴሪያ ውስጥ ያለው ግልባጭ የባክቴሪያ ዲ ኤን ኤ ክፍል በአር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኤንዛይም በመጠቀም አዲስ ወደተመረተ ኤምአርኤን የሚቀዳበት ሂደት ነው። ይህ ሂደት በሶስት ዋና ዋና ደረጃዎች ይከናወናል-አነሳሽነት, ማራዘም እና መቋረጥ. የባክቴሪያ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴስ በ 6 ንዑስ ክፍሎች የተገነባ ነው. አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር β፣ β′፣ α2 እና ω ንዑስ ክፍሎች አሉት። ይህ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር σ (sigma) ፋክተር ከዋናው ኢንዛይም ጋር ሲያያዝ ወደ ሆሎኤንዛይም ይቀየራል።አር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም የባክቴሪያ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኢንዛይም ዓይነቶች ናቸው።
አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር ምንድን ነው?
አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር ከሲግማ ፋክተር ነፃ የሆነ በባክቴሪያ ጽሑፍ ውስጥ የሚሳተፍ ኢንዛይም ነው። እንደ β፣ β′፣ α2 እና ω የተሰየሙ 5 ንዑስ ክፍሎችን ያቀፈ ነው። ይህ ኢንዛይም ከባክቴሪያ እና ከፋጅ ዲ ኤን ኤ አስተዋዋቂዎች የተለየ ቅጂ አይጀምርም። ይህ የሆነበት ምክንያት የትኛውንም የተለየ የባክቴሪያ ወይም የፋጅ ዲኤንኤ አራማጆችን ስለማያውቅ ነው። ሆኖም፣ ይህ ኢንዛይም አር ኤን ኤ ልዩ ካልሆኑ የማስጀመሪያ ቅደም ተከተሎች የመገልበጥ ችሎታ ይይዛል። ከዚህም በላይ በዚህ ኢንዛይም ላይ የሲግማ ፋክተር መጨመር ኢንዛይሙ አር ኤን ኤ ውህደትን ከተወሰኑ ባክቴሪያ እና ፋጅ አራማጆች እንዲጀምር ያስችለዋል። የአር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር ኢንዛይም ሞለኪውላዊ ክብደት 400 ኪሎ ዳ ነው።
ምስል 01፡ RNA Polymerase Core
ዋናው ኢንዛይም የአር ኤን ኤ ፖሊመሬሴን ካታሊቲክ ባህሪያትን ይዟል። የ α ንዑስ ክፍል 36.5 ኪዳ የሆነ ሆሞዲመር ነው። በ rpoA ጂን የተመሰጠረ ነው። የዚህ ንዑስ ክፍል ተግባራት አር ኤን ኤፒ ስብሰባ፣ ከዲኤንኤ ጋር ያለው ግንኙነት እና የጽሑፍ ግልባጭ ሁኔታዎች ናቸው። Β ንዑስ መጠን 150.4 ኪዳ ነው። በ rpoB ጂን የተመሰጠረ ነው። የዚህ ንዑስ ክፍል ተግባራት ዲ ኤን ኤ እና አር ኤን ኤ ማሰሪያ፣ አር ኤን ኤ ውህደት፣ ኤንቲፒ ማሰሪያ፣ RMP ማሰሪያ ቦታ እና σ ፋክተር ማሰሪያ ናቸው። β′ ንዑስ መጠን 155 ኪዳ ነው፣ እና በ rpoC ጂን የተመሰጠረ ነው። የዚህ ንዑስ ክፍል ተግባራት ዲኤንኤ ማሰሪያ፣ አር ኤን ኤ ሲንተሲስ፣ ካታሊቲክ Mg2+ ማስተባበር፣ ppGpp ማሰሪያ ጣቢያ 1 እና σ ምክንያት ማሰሪያ ናቸው። በተጨማሪም፣ የ ω ፋክተር መጠን 10.2 ኪዳ እና በ rpoZ ጂን የተመሰጠረ ነው። የω ፋክተር ተግባር RNAP ማጠፍ እና ፒጂፒፒ ማሰሪያ ጣቢያ 1 ነው።
አር ኤን ኤ Polymerase Holoenzyme ምንድን ነው?
አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ሆሎኤንዛይም ከ β፣ β′፣ α2 እና ω ንዑስ ክፍሎች ውጭ ሲግማ ፋክተር በመባል የሚታወቅ የተወሰነ አካል ያቀፈ ነው።በሲግማ ፋክተር ምክንያት፣ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ሆሎኤንዛይም አስተዋዋቂዎችን ሊያውቅ ይችላል። የሲግማ ፋክተር አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴን ሆሎኤንዛይም በትክክል ለማስቀመጥ እና በመነሻ ቦታው ላይ ለማራገፍ ይረዳል። ሲግማ ፋክተሩ የሚፈለገውን እና ልዩ ተግባሩን ካከናወነ በኋላ ከአር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ሆሎኤንዛይም ሲለይ የአር ኤን ኤ ፖሊሜሬዝ ካታሊቲክ ክፍል (β፣ β′፣ α2 እና ω) በዲ ኤን ኤ ውስጥ ይቀራል እና መገለባበጡን ይቀጥላል።
ምስል 02፡ RNA Polymerase Holoenzyme
የሲግማ ምክንያቶች ብዛት በባክቴሪያ ዝርያዎች መካከል ይለያያል። ኮላይ ሰባት ሲግማ ምክንያቶች አሉት። ከዚህም በላይ የሲግማ ምክንያቶች በባህሪያቸው ሞለኪውላዊ ክብደቶች ተለይተዋል. ለምሳሌ σ70 የሞለኪውላዊ ክብደት 70 ኪዳ ያለው ሲግማ ፋክተር ነው።የተለያዩ የሲግማ ምክንያቶች በተለያዩ የአካባቢ ሁኔታዎች ውስጥ በባክቴሪያዎች ጥቅም ላይ ይውላሉ. የተለያዩ የ σ ምክንያቶች ምሳሌዎች; σ19፣ σ24፣ σ18፣ σ32 ፣ σ38፣ እና σ54
በአር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም ሁለት አይነት የባክቴሪያ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኢንዛይም ናቸው።
- ሁለቱም ቅጾች በባክቴሪያ ቅጂ ውስጥ ይሳተፋሉ።
- ንዑሳን ክፍሎች አሏቸው።
- ከአሚኖ አሲድ የተሠሩ የፕሮቲን ሞለኪውሎች ናቸው።
በአር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር ሲግማ ፋክተር የሌለው ኢንዛይም ሲሆን አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ሆሎኤንዛይም ደግሞ ሲግማ ፋክተርን የያዘ ኢንዛይም ነው። ስለዚህ, ይህ በ RNA polymerase core እና holoenzyme መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው. በተጨማሪም አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኮር በዋናነት የሚሳተፈው በግልባጩ የማራዘም ደረጃ ላይ ሲሆን አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ሆሎኤንዛይም ደግሞ የጽሑፍ ግልባጩን መጀመሪያ ደረጃ ላይ ያደርገዋል።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በአር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም መካከል ያለውን ልዩነት በጎን ለጎን ለማነፃፀር በሰንጠረዥ መልክ ያቀርባል።
ማጠቃለያ – RNA Polymerase Core vs Holoenzyme
ባክቴሪያል አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ባለ ብዙ ንዑስ ዲ ኤን ኤ ላይ የተመሰረተ ኢንዛይም ነው። በባክቴሪያዎች ቅጂ ውስጥ ይሳተፋል. እሱ የጂን አገላለጽ ቁልፍ ኢንዛይም እና የቁጥጥር ዒላማ ነው። አር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም ሁለት የባክቴሪያ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኢንዛይም ዓይነቶች ናቸው። አር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር የሲግማ ፋክተር የለውም፣ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ሆሎኤንዛይም ሲግማ ፋክተር አለው። ስለዚህ፣ ይህ በአር ኤን ኤ ፖሊሜሬሴ ኮር እና ሆሎኤንዛይም መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።