በመስመሮች እና በSINE መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት LINEs (ረጅም የተጠላለፉ የኑክሌር ኤለመንቶች) ረጅም ያልሆኑ LTR retrotransposons ሲሆኑ SINEs (አጭር የተጠላለፉ የኑክሌር ንጥረ ነገሮች) በጣም አጭር ያልሆኑ LTR retrotransposons አይነት ናቸው።
LTR ያልሆኑ retrotransposons የረጅም ተርሚናል ድግግሞሾችን (LTR) አልያዙም። ነገር ግን፣ ለተገላቢጦሽ ትራንስክሪፕትሴ፣ ለአር ኤን ኤ ማሰሪያ ፕሮቲን፣ ኑክሊዮስ እና ራይቦኑክሊዝ ኤች ጎራ ጂኖችን ይይዛሉ። LTR ያልሆኑ retrotransposons አጭር ድግግሞሾች አሏቸው። እነዚህ ድግግሞሾች እርስ በእርሳቸው አጠገብ የተገለበጠ የመሠረት ቅደም ተከተል አላቸው። ከዚህ ውጭ፣ LTR ያልሆኑ retrotransposons እንዲሁ በኤልአርቲ ትራንስፖሶኖች ውስጥ ቀጥተኛ ተደጋጋሚነት አላቸው።LTR ያልሆኑ retrotransposons እንደ LINEs እና SINEs በሁለት ምድቦች ይከፈላሉ።
መስመሮች ምንድን ናቸው?
መስመሮች (ረዣዥም የተጠላለፉ የኑክሌር ኤለመንቶች) ረዘም ያለ LTR ያልሆኑ ዳግም ትራንስፖሶኖች ናቸው። በ eukaryotes ጂኖም ውስጥ በሰፊው ተሰራጭተዋል. እነሱ ብዙውን ጊዜ ከሰው ልጅ ጂኖም 21.1% ይይዛሉ። እያንዳንዱ መስመር ወደ 7000 የመሠረት ጥንዶች ርዝመት አለው። LINEs ወደ ኤምአርኤን ገልብጦ ወደ ፕሮቲን ወደ ተገላቢጦሽ ትራንስክሪፕትሴዝ ኢንዛይም ሆኖ ሊሠራ ይችላል። ይህ የተገላቢጦሽ ግልባጭ የ LINEs አር ኤን ኤ ቅጂዎችን ይፈጥራል። እነዚህ የዲኤንኤ ቅጂዎች በአዲስ ጣቢያ ወደ ጂኖም ሊዋሃዱ ይችላሉ።
ምስል 01፡ LINEs እና SINEs
የሰው ጂኖም የተትረፈረፈ አንድ መስመር ብቻ ነው ያለው LINE-1። LINE-1 ኤለመንት ወደ 6000 የመሠረት ጥንዶች ርዝመት አለው። በሰው ጂኖም ውስጥ ወደ 100,000 የተቆራረጡ LINE-1 ንጥረ ነገሮች አሉ።የዘፈቀደ ሚውቴሽን በ LINEs ውስጥ ሊከሰት ይችላል። በዘፈቀደ ሚውቴሽን ምክንያት፣ LINEዎቹ ሊበላሹ ይችላሉ። ከአሁን በኋላ አልተገለበጡም ወይም አልተተረጎሙም። በተጨማሪም መስመሮች በአምስት ዋና ዋና ቡድኖች እንደ L1፣ RTE፣ R2፣ I እና jockey ይመደባሉ። እነዚህ አምስት ቡድኖች ወደ ሌላ 28 ክፍሎች ይከፋፈላሉ።
መስመሮች በተለምዶ ኢላማ ፕራይም ሪቨር ትራንስሪፕሽን ሜካኒካል (TPRT) በተባለ ዘዴ ይሰራጫሉ። LINEsን ማስገባት የሰው ልጅ እንደ ሄሞፊሊያ ኤ፣ ካንሰር፣ ሜንዴሊያን ዲስኦርደር ወዘተ ያስከትላል።
SINEs ምንድን ናቸው?
SINEs (አጭር የተጠላለፉ የኑክሌር ንጥረ ነገሮች) በጣም አጭር LTR ያልሆኑ retrotransposons አይነት ናቸው። ርዝመታቸው ከ 100 እስከ 700 የሚደርሱ ጥንድ ጥንድ ናቸው. SINEs በኤውካሪዮቲክ ጂኖም ውስጥ በአር ኤን ኤ መካከለኛዎች ውስጥ እራሳቸውን የሚያጎሉ የዲኤንኤ ንጥረ ነገሮች ናቸው። SINE ዎች ከአጥቢ እንስሳት ጂኖም 13% ያህሉ ናቸው። የ SINEs ውስጣዊ ክልሎች የሚመነጩት ከ tRNA ነው። በከፍተኛ ደረጃ ተጠብቆ ይቆያል።ብዙውን ጊዜ በበርካታ የአከርካሪ እና የጀርባ አጥንቶች ዝርያዎች ውስጥ ይገኛሉ. በSINE ዎች ውስጥ ያለው የቅጂ ቁጥር ልዩነት እና ሚውቴሽን በሥርዓተ-ዝርያ ላይ የተመሠረተ የዝርያ ምደባን ለመገንባት ሊካተት ይችላል።
SINEዎች በሶስት ዋና ዋና ዓይነቶች ሊመደቡ ይችላሉ፡ CORE-SINEs፣ V-SINEs እና AmnSINEs። Alu element በፕሪምቶች ውስጥ በጣም የተለመደው SINE ነው። ከዚህም በላይ የ SINE ዎችን ከማስገባት ጋር የተያያዙ ከ 50 በላይ የሰዎች በሽታዎች አሉ. በኤክስዮን ውስጥ ወይም አቅራቢያ ሲያስገቡ፣ ተገቢ ያልሆነ መሰንጠቅን ሊያስከትሉ ወይም የንባብ ፍሬሙን ሊቀይሩ ይችላሉ። ይህ ወደ በሽታ ፊኖታይፕስ ይመራል እንደ የጡት ካንሰር፣ የአንጀት ካንሰር፣ ሉኪሚያ፣ ሄሞፊሊያ፣ ሳይስቲክ ፋይብሮሲስ፣ የአንጀት ካንሰር፣ የዴንት በሽታ፣ ኒውሮፊብሮማቶሲስ፣ ወዘተ።
በመስመሮች እና በSINEs መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- መስመሮች እና SINE ሁለት አይነት LTR ያልሆኑ ዳግም ትራንስፖሶኖች ናቸው።
- ሁለቱም ረጅም ተርሚናል ክልል (LTR) የላቸውም።
- ሁለቱም በብዛት የሚገኙት በ eukaryotes ውስጥ ብቻ ነው።
- ሁለቱም ራሳቸውን የቻሉ አይደሉም።
በመስመሮች እና በSINEs መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
መስመሮች ረጃጅም LTR ያልሆኑ ትራንስፖሶኖች ሲሆኑ SINE ደግሞ በጣም ያጠረ LTR ያልሆኑ ትራንስፖሶኖች ናቸው። ስለዚህ፣ ይህ በ LINEs እና SINEs መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። በተጨማሪም የ LINES ኮድ ለተገላቢጦሽ ትራንስክሪፕትሴስ ኢንዛይም ሲሆን SINE ደግሞ ለተገላቢጦሽ ትራንስክሪፕትase ኢንዛይም ኮድ አይሰጥም። ስለዚህ፣ ይህ በ LINEs እና SINEs መካከል ያለው ሌላ ልዩነት ነው።
በLINEs እና SINEs መካከል ያሉ ተጨማሪ ልዩነቶች በጎን ለጎን ለማነፃፀር ከዚህ በታች ተዘርዝረዋል።
ማጠቃለያ - LINEs vs SINEs
Retrotransposons በዋነኛነት በሁሉም eukaryotes ውስጥ ይገኛሉ ነገር ግን በፕሮካርዮት ውስጥ አይገኙም። በግምት 37% የሚሆነው የሰው ልጅ ጂኖም retrotransposons ይይዛል። Retrotransposons በዋናነት ሁለት ዓይነት ናቸው፡ LTR እና LTR ያልሆኑ retrotransposons። LTR ያልሆኑ retrotransposons በ LTR retrotransposons ውስጥ የሚገኙትን ረጅም ተርሚናል ተደጋጋሚዎች (LTR) አልያዙም።LTR ያልሆኑ retrotransposons በተጨማሪ በሁለት ምድቦች ይከፈላሉ፡ LINEs እና SINEs። LINEs ረዘም ያለ LTR ያልሆኑ retrotransposons ሲሆኑ SINEs ደግሞ በጣም ያጠረ LTR ያልሆኑ ትራንስፖሶኖች ናቸው። ስለዚህ፣ ይህ በ LINEs እና SINEs መካከል ያለው ልዩነት ማጠቃለያ ነው።
