በNGS እና WGS መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት የቀጣዩ ትውልድ ቅደም ተከተል (NGS) በከፍተኛ ደረጃ ትይዩ የሆነ የሁለተኛ ትውልድ ተከታታይ ቴክኖሎጂ ሲሆን ከፍተኛ መጠን ያለው፣ ዝቅተኛ ወጪ እና ፈጣን ሲሆን ሙሉ-ጂኖም ቅደም ተከተል (WGS) እንደ Sanger sequencing፣ shotgun approach ወይም high throughput NGS ተከታታይ ዘዴዎችን በመጠቀም የአንድን ሕዋስ አጠቃላይ ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ በአንድ ጊዜ ለመተንተን አጠቃላይ ዘዴ።
ባለፉት ጥቂት አስርት ዓመታት ውስጥ ፈጣን ተከታታይ ቴክኒኮች እና የባዮኢንፎርማቲክስ መሳሪያዎች በመገኘቱ የሰው እና የሌሎች እንስሳት ጂኖም ግንዛቤ በከፍተኛ ደረጃ ጨምሯል። እንደ Sanger sequencing ያሉ ተለምዷዊ ተከታታይ ቴክኒኮች ውስንነታቸው ነበራቸው፣ ይህም እንደ ቀጣዩ ትውልድ ቅደም ተከተል (ኤንጂኤስ) እና ናኖፖር ቅደም ተከተል ያሉ አዳዲስ ፈጣን የቅደም ተከተል ዘዴዎች እንዲፈጠሩ ጠይቋል።የሙሉ-ጂኖም ቅደም ተከተል (WGS) ቴክኒክ እንደ 100, 000 የጂኖም ፕሮጄክት በጂኖሚክ እንግሊዝ ፣ ዩኬ ባሉ በብዙ የጂኖም የምርምር ፕሮጀክቶች ውስጥ ቀድሞውኑ ጥቅም ላይ የዋለ የቅርብ ጊዜ አካሄድ ነው። ስለዚህ NGS እና WGS በአሁኑ ጊዜ በብዙ ጂኖሚክ ፕሮጄክቶች ውስጥ የሚያካትቱ ሁለት ተከታታይ ዘዴዎች ናቸው።
NGS ምንድን ነው?
NGS (የቀጣዩ ትውልድ ቅደም ተከተል) ከፍተኛ መጠን ያለው፣ ዝቅተኛ ወጪ እና ፈጣን የሆነ የሁለተኛ-ትውልድ ተከታታይ ቴክኖሎጂ ነው። ለቀጣይ ትውልድ ቅደም ተከተል ትክክለኛ ፍቺ የለም። ነገር ግን ከተለመዱት ካፊላሪ-ተኮር ቅደም ተከተል ዘዴዎች በግልጽ ልንለየው እንችላለን. የሚቀጥለው ትውልድ ቅደም ተከተል የዲኤንኤ ሞለኪውል በአንድ ሙከራ ውስጥ በአጠቃላይ ከ 1 ሚሊዮን ቤዝ ጥንዶች የበለጠ መጠን ያለው ቅደም ተከተል እንዲኖር ያስችላል። ከዚህ በፊት ታይቶ የማይታወቅ የፍጥነት እና ከፍተኛ የመተላለፊያ አማራጮችን ይሰጣል፣ ለምሳሌ የበርካታ ግለሰቦችን የዲኤንኤ ቅደም ተከተል በተመሳሳይ ጊዜ መፍቀድ። ይህ የሚገኘው የግለሰቦችን ቅደም ተከተል ምላሽ መጠን በመቀነስ ነው። በተጨማሪም ፣ ይህ የመሳሪያውን መጠን ይገድባል እና በአንድ ምላሽ የሪኤጀንቶች ወጪን ይቀንሳል።
ምስል 01፡ NGS መድረኮች
NGS ቀድሞውንም ባዮሎጂያዊ የምርምር መስክ ላይ ለውጥ ያመጣ አጭር የተነበበ የቅደም ተከተል ዘዴ ነው። በተጨማሪም NGS እንደ ዴ ኖቮ ጂኖም ቅደም ተከተል፣ ሙሉ ጂኖም ቅደም ተከተል፣ የትራንስክሪፕት ትንታኔ፣ አነስተኛ አር ኤን ኤ እና ማይክሮ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል፣ የታለመ ቅደም ተከተል እና ሙሉ-ኤግዚም ቅደም ተከተል ባሉ የተለያዩ አካባቢዎች ይተገበራል።
WGS ምንድን ነው?
WGS (ሙሉ-ጂኖም ተከታታይነት) እንደ Sanger sequencing፣ shotgun approach ወይም high throughput NGS sequencing የመሳሰሉ የሴኪውሲንግ ቴክኒኮችን በመጠቀም የአንድን ሕዋስ አጠቃላይ ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ በአንድ ጊዜ የምንመረምርበት አጠቃላይ ዘዴ ነው። በተጨማሪም ሙሉ የጂኖም ቅደም ተከተል ወይም ሙሉ የጂኖም ቅደም ተከተል በመባል ይታወቃል. የሙሉ-ጂኖም ቅደም ተከተል ሁሉንም የሰውነት ክሮሞሶም ዲ ኤን ኤ እና ዲ ኤን ኤ በሚቶኮንድሪያ እና ለተክሎች በአንድ ጊዜ በክሎሮፕላስት ውስጥ ያለውን ዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተል ያካትታል።WGS ሳይንቲስቶች ሙሉውን የዲኤንኤ ስብስብ ያካተቱትን ሁሉንም ፊደሎች በትክክል እንዲያነቡ ያስችላቸዋል። WGS የኤንጂኤስ መድረክን በመጠቀም ክሊኒካዊ ውቅረትን እንደሚያሻሽል ይጠበቃል።
ሥዕል 02፡ WGS vs ተዋረዳዊ ሾትgun ቅደም ተከተል
የሙሉ-ጂኖም ቅደም ተከተል በ 2014 ወደ ክሊኒካዊ እንክብካቤ ቀርቧል። በተጨማሪም የ WGS አተገባበር በ SNP ደረጃ የጂን ቅደም ተከተልን ያካትታል በማህበር ጥናቶች ውስጥ ተግባራዊ ልዩነቶችን, የሕክምና ጣልቃገብነት በግል ህክምና, የዝግመተ ለውጥ ባዮሎጂ, ንፅፅር የጂኖም ትንታኔ ፣ ሚውቴሽን እና ዳግም አደረጃጀቶች ጥናቶች፣ ብርቅዬ የልዩነት ማህበራት ጥናቶች እና የበሽታ ተጋላጭነትን እና የመድኃኒት ምላሽን መተንበይ።
በNGS እና WGS መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- NGS እና WGS ሁለት ተከታታይ ቴክኒኮች ናቸው።
- ሁለቱም ቴክኒኮች ዲኤንኤ ወይም አር ኤን ኤ በቅደም ተከተል።
- እነዚህ ቴክኒኮች አዲስ እና አስተማማኝ ናቸው።
- ሁለቱም በሽታዎችን እና የመድኃኒት ግኝቶችን ለመመርመር ያገለግላሉ።
በNGS እና WGS መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
NGS በጅምላ ትይዩ የሁለተኛ ትውልድ ተከታታይ ቴክኖሎጂ ሲሆን ከፍተኛ መጠን ያለው ምርት፣ አነስተኛ ወጪ እና ፈጣን ሲሆን ደብልዩ ጂ ኤስ ደግሞ የአንድን ሕዋስ አጠቃላይ ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ በአንድ ጊዜ የመተንተን አጠቃላይ ዘዴ ነው። እንደ Sanger ቅደም ተከተል ፣ የተኩስ አቀራረብ ወይም ከፍተኛ የ NGS ቅደም ተከተል። ስለዚህ, ይህ በ NGS እና WGS መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው. በተጨማሪም NGS የሁለተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ዘዴዎችን ብቻ ያቀፈ ሲሆን WGS ደግሞ አንደኛ፣ ሁለተኛ እና ሶስተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ዘዴዎችን ያካትታል።
የሚከተለው ሠንጠረዥ በጎን ለጎን ለማነፃፀር በNGS እና WGS መካከል ያለውን ልዩነት በሰንጠረዥ ያቀርባል።
ማጠቃለያ - NGS vs WGS
ባለፉት አስርት ዓመታት ውስጥ በዘመናዊ ሞለኪውላር ምርምር ላይ የተለያዩ የቅደም ተከተል ቴክኒኮች በመደበኛነት ተተግብረዋል። እና ለብዙ ክሊኒካዊ አፕሊኬሽኖች እንኳን በጣም ኃይለኛ መሳሪያዎች ናቸው. NGS እና WGS በአሁኑ ጊዜ በብዙ ጂኖሚክ ፕሮጄክቶች ውስጥ የሚካተቱ ሁለት ተከታታይ ዘዴዎች ናቸው። ኤንጂኤስ የሁለተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ቴክኖሎጂ ሲሆን ይህም ከፍተኛ መጠን ያለው፣ ዝቅተኛ ወጪ እና ፈጣን ነው። በሌላ በኩል፣ WGS እንደ Sanger sequencing፣ shotgun approach ወይም high throughput NGS sequencing የመሳሰሉ ተከታታይ ቴክኒኮችን በመጠቀም የአንድን ሕዋስ አጠቃላይ ጂኖሚክ ዲኤንኤ ወይም ሙሉ ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ በአንድ ጊዜ የመተንተን ዘዴ ነው። ስለዚህ፣ ይህ በ NGS እና WGS መካከል ያለው ልዩነት ማጠቃለያ ነው።
