በፕሪመር እና ፕሮሞተር መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ፕሪመር በንግድ የተቀናበረ አጭር የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ሲሆን በ PCR ውስጥ ለታለመ ዲኤንኤ ቅደም ተከተል ማጉላት ጥቅም ላይ የሚውል ሲሆን አስተዋዋቂው ደግሞ ለአር ኤን ኤ ደህንነቱ የተጠበቀ የመነሻ ማሰሪያ ጣቢያ የሚሰጥ የተወሰነ የDNA ተከታታይ መሆኑ ነው። ግልባጭ ለመጀመር ፖሊመሬሴ እና ግልባጭ ምክንያቶች።
ዋና እና አስተዋዋቂ ሁለት አይነት የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ናቸው። ፕሪመር ለ polymerase chain reaction (PCR) የሚያስፈልገው ትንሽ የዲ ኤን ኤ ቁራጭ ነው። ከዲ ኤን ኤው ገመድ ጎን ካለው ጫፍ ጋር የሚደጋገፉ አጫጭር ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተሎች አሉት። ሁለት ዓይነት ፕሪመርሮች አሉ, እና አዲስ የዲ ኤን ኤ ክሮች ለመገጣጠም እንደ መነሻ ሆነው ይሠራሉ.በአንጻሩ፣ አስተዋዋቂ ወደ ጂን ግልባጭ መነሻ ቦታ ላይ የሚገኝ የተወሰነ የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ነው። የዲኤንኤ ግልባጭን ለመቆጣጠር እንደ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ እና የጽሑፍ ግልባጭ ሁኔታዎች ካሉ የጽሑፍ ግልባጭ አካላት ጋር በቀጥታ ይገናኛል። ስለዚህ፣ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ እና ሌሎች የጽሑፍ ግልባጭ ምክንያቶች ከአስተዋዋቂው ቅደም ተከተል ጋር ተያይዘው ወደ ጽሑፍ መገልበጥ ይጀምራሉ።
ፕራይመር ምንድን ነው?
ፕሪመሮች ለታላሚ ዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ማጉላት የተነደፉ አጫጭር የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ናቸው። በመዋቅራዊ ደረጃ፣ ከዲኤንኤው ድርብ ክሮች ጎን ለጎን የሚደጋገፉ አጫጭር ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተሎችን ይዘዋል። አብዛኛውን ጊዜ 20 ኑክሊዮታይድ ርዝማኔ አላቸው. በ PCR ጊዜ ታክ ፖሊሜሬዝ ኑክሊዮታይድ ወደ ቀድሞው ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል መጨመርን ያበረታታል. ስለዚህ ፕሪመር ለአዳዲስ ክሮች ውህደት እንደ መነሻ ሆነው ያገለግላሉ። Taq polymerase የሚሠራው ከ 5' እስከ 3' አቅጣጫ ብቻ ነው. ስለዚህ፣ የዲኤንኤ ውህደት በተመሳሳይ ከ5’ እስከ 3’ አቅጣጫ ይከናወናል። ዲ ኤን ኤ ባለ ሁለት መስመር ስለሆነ በ PCR ውስጥ ሁለት ዓይነት ፕሪመርቶች ያስፈልጋሉ.በዲኤንኤ ውህደት ወቅት የፕሪመርን የማራዘም አቅጣጫ መሰረት በማድረግ ወደፊት ፕሪመር እና ተገላቢጦሽ ፕሪመር በመባል ይታወቃሉ።
ሥዕል 01፡ Primers
ወደ ፊት ፕሪመር አንቲሴንስ ዲ ኤን ኤ ስትራንድ በማድረግ የጂን ዘረ-መል (+ strand) ውህደትን ከ5' እስከ 3' አቅጣጫ ይጀምራል። ከፀረ ስሜት ፈትሹ 3' ጎን ጫፍ ጋር የሚደጋገፍ አጭር የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል አለው። የተገላቢጦሽ ፕሪመር ከስሜት ህዋሳት ጋር ይሰርዛል እና ተጨማሪ የኮዲንግ ፈትል ውህደቱን ይጀምራል፣ እሱም - የጂን ፈትል ወደ 5'ለ 3' አቅጣጫ። ስለዚህ፣ የተገላቢጦሽ ፕሪመር በኮድ ገመዱ 3' ጫፍ ላይ ማሟያ የተነደፈ ነው። ሁለቱም የተገላቢጦሽ እና ወደፊት ፕሪመርሮች ኢላማ ወይም ፍላጎት ያላቸውን የተወሰኑ የዲኤንኤ ክልሎች በሚሊዮኖች እስከ ቢሊየን የሚቆጠሩ ቅጂዎችን ለማምረት አስፈላጊ ናቸው።
አስተዋዋቂ ምንድነው?
አስተዋዋቂው ወደላይ ወይም በጂን የተቀዳበት ቦታ 5′ መጨረሻ ላይ የሚገኝ የDNA ተከታታይ ነው። የጂን ግልባጭን ለመጀመር ለአር ኤን ኤ ፖሊሜሬዝ እና ለተወሰኑ የቁጥጥር አካላት አስገዳጅ ቦታን ይሰጣል። ጂን ለማብራት ወይም ለማጥፋት የሚያስፈልገው የቁጥጥር ቅደም ተከተል ነው። በአስተዋዋቂው ውስጥ የተወሰነ የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል አለ. 100-1000 መሰረታዊ ጥንዶች ሊኖሩት ይችላል. ፕሮሞተር የጽሑፍ ግልባጭ አቅጣጫ ያሳያል። በተጨማሪም፣ መገለበጥ ያለበትን የስሜት ህዋሳትን ያመለክታል።
ስእል 02፡ የጂን አራማጅ
እንደ ዋና አራማጅ፣ ፕሮክሲማል አራማጅ እና የርቀት አራማጅ ያሉ ሶስት አይነት አስተዋዋቂ አካላት አሉ። ዋና አስተዋዋቂው ወደ ጽሑፍ ግልባጭ ለመጀመር የሚያስፈልገው የአስተዋዋቂው ትንሹ ክፍል ነው።ወደ መጀመሪያው ኮድን በጣም ቅርብ ነው የሚገኘው። TATA ሳጥን በብዙ eukaryotic ኮር አራማጆች ውስጥ የሚገኝ የተጠበቀ ክልል ነው። ከ25 እስከ 35 የመሠረት ጥንዶች ከጽሑፍ ግልባጭ መጀመሪያ ቦታ በላይ ይገኛል። የፕሮክሲማል አራማጅ ወደ ዋናው አራማጅ የበለጠ ወደላይ ይገኛል። በአጠቃላይ፣ በጅረት ኮዶን ላይ 250 ቤዝ ጥንዶች የሚገኝ ሲሆን ዋና የቁጥጥር አካላትን ይዟል። የርቀት አስተዋዋቂው ወደ አቅራቢያው ከፍ ብሎ ይገኛል፣ እና ተጨማሪ የቁጥጥር አካላትን ይዟል። የባክቴሪያ አስተዋዋቂዎች በአስተዋዋቂዎቻቸው ውስጥ ሁለት የአጭር ተከታታይ አካላት አሏቸው። TATAAT በባክቴሪያ አራማጅ -10 ላይ የሚገኝ የጋራ ስምምነት ሲሆን TTGACA ደግሞ በ -35 የጋራ ስምምነት ነው። እነሱም -10 ኤለመንትና -35 አባል በመባል ይታወቃሉ።
በPrimer እና Promoter መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- ዋና እና አስተዋዋቂ ሁለት አይነት የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ናቸው።
- የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተሎችን ያቀፈ ነው።
- ሁለቱም ፕሪመር እና አስተዋዋቂ ለጂን አገላለጽ አስፈላጊ ናቸው።
በፕሪመር እና ፕሮሞተር መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Primer ኢላማ ዲኤንኤን ለመጨመር የተነደፈ አጭር የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ነው። በአንጻሩ፣ አስተዋዋቂው ወደ ዘረ-መል መገለባበጫ ቦታ ወደላይ የሚገኝ የተወሰነ የቁጥጥር ዲኤንኤ ቅደም ተከተል ነው። ስለዚህ በፕሪመር እና ፕሮሞተር መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ይህ ነው። ፕሪመርስ ወደ 20 ቤዝ ጥንዶች ይረዝማሉ ፣ አስተዋዋቂው ከ100 -1000 ቤዝ ጥንዶች ሊኖረው ይችላል። በተግባራዊ መልኩ፣ ፕሪመር ለአዲሱ ስትራንድ ውህድ እንደ መነሻ ቅደም ተከተሎች ሆነው ያገለግላሉ፣ አስተዋዋቂዎች ደግሞ ለአር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ እና ሌሎች የመገለባበጫ ምክንያቶች አስገዳጅ ጣቢያዎችን በማቅረብ የጂን ግልባጭን ይቆጣጠራሉ።
ከዚህም በላይ፣ አስተዋዋቂ እንደ የጽሑፍ ግልባጭ አቅጣጫ ይገለጻል እና የጂን ስሜትን ያሳያል። በመዋቅር ደረጃ፣ ፕሪመር አጭር፣ ነጠላ-ክር ያለው የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ሲሆን አስተዋዋቂ ደግሞ ረጅም ባለ ሁለት ገመድ የDNA ተከታታይ ነው።
ከዚህ በታች ያለው የመረጃ ግራፊክ ተጨማሪ ንጽጽሮችን በፕሪመር እና በአስተዋዋቂ መካከል ያለውን ልዩነት ያሳያል።
ማጠቃለያ - Primer vs Promoter
ፕሪመሮች ለታለመው የዲኤንኤ ድርብ ፈትል አጫጭር የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተሎች ማሟያ ናቸው። በ PCR ውስጥ ሁለት ዓይነት ፕሪመርቶች ጥቅም ላይ ይውላሉ. ለአዳዲስ ክሮች ውህደት እንደ መነሻ ቅደም ተከተሎች ሆነው ያገለግላሉ. ፕሪመርስ ለንግድ የተነደፈ ነው, እና እነሱ የሙቀት መረጋጋት ቅደም ተከተሎች ናቸው. በሌላ በኩል፣ አስተዋዋቂው ወደ ጽሁፍ መገለባበጥ መነሻ ቦታ ላይ የሚገኘው የጂን ተቆጣጣሪ ቅደም ተከተል ነው። አበረታቾች የጂኖችን ቅጂ ይቆጣጠራሉ። ግልባጭ ለመጀመር ለአር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ እና የጽሑፍ ግልባጭ ምክንያቶች አስገዳጅ ቦታዎችን ይሰጣሉ። ስለዚህ፣ ይህ በፕሪመር እና ፕሮሞተር መካከል ያለው ልዩነት ማጠቃለያ ነው።
