በሞለኪውላር መትከያ እና የውጤት አሰጣጥ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት መትከያ በሁለት ሞለኪውሎች መካከል ያለውን ትስስር ለመወሰን የሚያገለግል ቴክኒክ ሲሆን ነጥብ ማስቆጠር ደግሞ ምቹ የሆነ የኢንተር ሞለኪውላር መስተጋብርን በመቁጠር የተወሰነ አቋምን የመገምገም ሂደት ነው።
የሞለኪውላር መትከያ እና የውጤት አሰጣጥ ቃላቶች በሞለኪውላር ሞዴልነት መስክ ጥቅም ላይ ይውላሉ። ሞለኪውላር ሞዴሊንግ በተሰጠው ንጥረ ነገር ውስጥ የተለያዩ ሞለኪውሎች ሊኖሩ የሚችሉ ዝግጅቶችን ለመወሰን የሚያገለግል ዘዴ ነው። ይህ ዘዴ አዲስ የተረጋጋ ውህዶችን ለመፍጠር አስፈላጊ ነው።
Molecular Docking ምንድን ነው?
ሞለኪውላር መትከያ የአንድ እጩ ሊጋንድ ከተቀባይ ጋር የሚያቆራኝ ስሌት ማስመሰል ነው።ይህ ዘዴ አንድ ሞለኪውል ወደ ሌላ ሞለኪውል እርስ በርስ ሲተሳሰር የሚመርጠውን አቀማመጥ ይተነብያል። ከዚህ ዘዴ የተገኘው ውጤት በሁለት ሞለኪውሎች መካከል ያለውን ግንኙነት ወይም ትስስር ጥንካሬ ለመተንበይ ሊያገለግል ይችላል. እዚህ፣ የሞለኪውላር ነጥብ ተግባርም አስፈላጊ ነው።
ስእል 01፡ የሞለኪውላር መስተጋብር ሂደትን በባዮሎጂካል ሲስተም የሚያሳይ ቀላል ንድፍ
በአጠቃላይ ይህ ቴክኒክ እንደ ፕሮቲኖች፣ peptides፣ ኑክሊክ አሲዶች፣ ካርቦሃይድሬትስ እና ሊፒድስ ያሉ ባዮሎጂያዊ ተዛማጅ ሞለኪውሎችን ይመለከታል። እነዚህ ሞለኪውሎች በጣም አስፈላጊ ናቸው, እና በሰውነታችን ውስጥ በምልክት ማስተላለፊያ ዘዴዎች ውስጥ ትልቅ ሚና ይጫወታሉ. ስለዚህ፣ ለዚህ የምልክት ማስተላለፊያ ሂደት የሚገናኙት የሁለቱ ሞለኪውሎች አቅጣጫ እዚህ በተፈጠረው የምልክት አይነት ላይ ተጽዕኖ ያሳድራል።ይሄ ማለት; ሞለኪውላር መትከያ በባዮሎጂካል ስርዓቶች ውስጥ በምልክት ሽግግር ወቅት የሚፈጠረውን ጥንካሬ እና የምልክት አይነት ለመወሰን አስፈላጊ ነው።
ከዚህም በላይ ሞለኪውላዊ መትከያ ዘዴዎች መዋቅርን መሰረት ያደረጉ መድሃኒቶችን በመንደፍ ረገድ አስፈላጊ ናቸው። ይህ የሆነበት ምክንያት ትናንሽ ሞለኪውሎች እንደ ሊጋንዶች ወደ ተስማሚ ማያያዣ ቦታ የመገጣጠም መገመቻው ነው።
የሞለኪውላር ነጥብ ምንድነው?
ሞለኪውላር ውጤት የሞለኪውላር መትከያ ሂደትን ለመገምገም ጠቃሚ የሆነ የሂሳብ ተግባር አይነት ነው። በኮምፒውቲሽናል ኬሚስትሪ መስክ፣ የውጤት አሰጣጥ ተግባራት ከመትከሉ ሂደት በኋላ በሁለት ሞለኪውሎች መካከል ያለውን ትስስር ለመተንበይ ያገለግላሉ። ለምሳሌ፣ የአንድ ቅንጣት መድሀኒት ትንሽ ሞለኪውል ካለን እና እንደ ፕሮቲን ያለ ባዮሎጂካል ኢላማ ካለን የመድኃኒቱን ተያያዥነት ወደ ማሰሪያው ቦታ መገምገም እንችላለን። ከዚህም በላይ ሞለኪውላዊው ነጥብ በሁለት ፕሮቲኖች ወይም በፕሮቲን እና በዲ ኤን ኤ ሞለኪውሎች መካከል ያለውን የእርስ በርስ ግንኙነት ለመተንበይ ይጠቅማል።
ሥዕል 02፡ የውጤት አሰጣጥ ተግባር ባጭሩ
የሞለኪውላር ውጤት ዋና አተገባበር በመድሀኒት ዲዛይን ሂደቶች ውስጥ ነው-ለምሳሌ ምናባዊ ማጣሪያ፣ ደ ኖቮ ዲዛይን፣ እርሳስ ማመቻቸት፣ ወዘተ።
በሞለኪውላር መትከያ እና ነጥብ አሰጣጥ መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
ሞለኪውላር መትከያ እና ነጥብ ማስቆጠር በሞለኪውላዊ ሞዴሊንግ ውስጥ አስፈላጊ ናቸው። በሞለኪውላር መትከያ እና በውጤት አሰጣጥ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት መትከያ በሁለት ሞለኪውሎች መካከል ያለውን ትስስር ለመወሰን የሚያገለግል ቴክኒክ ሲሆን ነጥብ መስጠት ደግሞ ምቹ የሆነ የኢንተር ሞለኪውላዊ መስተጋብር ብዛት በመቁጠር የተወሰነ አቋምን የመገምገም ሂደት ነው።
የሚከተለው ኢንፎግራፊክ በሞለኪውላር መትከያ እና በውጤት አሰጣጥ መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
ማጠቃለያ - ሞለኪውላር Docking vs Scoring
ሞለኪውላር መትከያ እና ነጥብ ማስቆጠር በሞለኪውላዊ ሞዴሊንግ ውስጥ አስፈላጊ ናቸው። በሞለኪውላር መትከያ እና በውጤት አሰጣጥ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት መትከያ በሁለት ሞለኪውሎች መካከል ያለውን ትስስር ለመወሰን የሚያገለግል ቴክኒክ ሲሆን ነጥብ መስጠት ደግሞ ምቹ የሆነ የኢንተር ሞለኪውላዊ መስተጋብር ብዛት በመቁጠር የተወሰነ አቋምን የመገምገም ሂደት ነው።
