ቁልፍ ልዩነት – ዩካሪዮቲክ vs ፕሮካርዮቲክ አራማጆች
መገልበጥ በዲኤንኤ ቅደም ተከተል የተከማቸውን የዘረመል መረጃ ወደ ኤምአርኤን ቅደም ተከተል የመቀየር ሂደት ነው። በጽሑፍ ግልባጭ ክፍል 5' መጨረሻ ላይ የሚገኘው የተወሰነ የዲኤንኤ ክልል ይህንን ሂደት ይጀምራል። ያ ክልል አስተዋዋቂ ክልል በመባል ይታወቃል። እነዚህ አስተዋዋቂዎች በተለምዶ ከጽሑፍ ቅጂው መጀመሪያ ጣቢያ አጠገብ ይገኛሉ። የአስተዋዋቂው ርዝመት ከ 100 bp እስከ 1000 bp ይለያያል. አራማጆች እንደ ኦርጋኒዝም አይነት ይለያያሉ። ዩኩሪዮቲክ እና ፕሮካርዮቲክ አራማጆች አንዳቸው ከሌላው የተለዩ ናቸው። በፕሮካርዮት ውስጥ፣ ሶስት አይነት የአስተዋዋቂ ቅደም ተከተሎች ብቻ ይገኛሉ እነሱም -10 ፕሮሞተሮች፣ -35 አራማጅ እና ወደ ላይ ያሉ አካላት።በ eukaryotes ውስጥ እንደ TATA ቦክስ፣አስጀማሪ ኤለመንቶች፣ጂሲ ቦክስ፣CAAT ቦክስ፣ወዘተ ያሉ ብዙ የተለያዩ አስተዋዋቂ አካላት አሉ።ይህ በ eukaryotic እና prokaryotic ፕሮካሪዮቲክ አራማጆች መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
የዩካርዮቲክ አራማጆች ምንድናቸው?
ሶስት ዋና ክፍሎች; ዋና አራማጅ፣ ፕሮክሲማል አራማጅ እና የርቀት አራማጅ፣ በአንድነት አስተዋዋቂ ይመሰርታሉ። በ eukaryotes አውድ ውስጥ፣ እጅግ በጣም የተራቀቁ እና ከአስተዋዋቂዎች የበለጠ የተለያዩ የሆኑ ብዙ ቁጥር ያላቸው አስተዋዋቂ ንጥረ ነገሮች አሉ። በዚህ የ eukaryotic ፕሮሞተሮች ውስብስብነት ምክንያት ዲ ኤን ኤው በራሱ ላይ የመገጣጠም ችሎታ እንዳለው ታውቋል. ይህ ደግሞ እውነታውን ያብራራል, የብዙ የቁጥጥር ቅደም ተከተሎች ውጤት ከተገለበጠበት ቦታ ብዙ ኪሎባሴስ ቢገኙም. እነዚህ eukaryotic አራማጆች በተለያዩ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች የማለፍ ችሎታ አላቸው።
ስእል 01፡ የዩካሪዮቲክ ፕሮሞተር
ለአንዳንድ eukaryotic አራማጆች ምሳሌዎች ፕሪብኖው ቦክስ (ታታ ሳጥን)፣ ጂሲ ቦክስ፣ CAAT ቦክስ ወዘተ በTATA ሳጥን አውድ ውስጥ፣ በዋናው ውስጥ ያለው የ5'-TAATA-3' ቅደም ተከተል ነው። አስተዋዋቂ ክልል. ወደ TATA ሣጥን፣ የጽሑፍ ግልባጭ ፕሮቲኖች እና ሂስቶን ፕሮቲኖች ታስረዋል። የጽሑፍ ግልባጭ ፕሮቲኖችን ከታታ ሳጥን ጋር ማያያዝ አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴን ለማገናኘት ይረዳል፣ ይህም የጽሑፍ ግልባጭ ውስብስብነት እንዲፈጠር ያደርጋል። በቀላል አነጋገር, የእነዚህ ፕሮቲኖች ትስስር የመገልበጥ ሂደቱን ያንቀሳቅሰዋል. ሂስቶን ፕሮቲኖች ከታታ ሳጥን ጋር ሲተሳሰሩ ይህ ሂደት ይታገዳል። ስለዚህ የቲኤታ ሳጥን የኢውካርዮቲክ ቅጂን መጠን መቆጣጠርን የሚያካትት አስፈላጊ አስተዋዋቂ አካል ነው።
ፕሮካርዮቲክ አራማጆች ምንድናቸው?
በፕሮካርዮቲክ ህዋሳት ውስጥ፣ ወደ ጽሁፍ ግልባጭ የሚያደርገው አስተዋዋቂው ሲግማ ፋክተር በሚባለው ተያያዥነት ተለይቶ ይታወቃል።የሲግማ ምክንያቶች ለተለያዩ የአስተዋዋቂ ቅደም ተከተሎች ልዩ ናቸው. ስለዚህ፣ እያንዳንዱ ነጠላ ሲግማ ፋክተር አንድ የኮር አራማጅ ቅደም ተከተል ይገነዘባል ተብሏል። ይህ በፕሮካርዮቲክ ግልባጭ ሂደት ውስጥ የሚገኝ ልዩ ባህሪ ነው። ሁለቱም አር ኤን ኤ ፖሊመሬሴ እና ሲግማ ፋክተር ትክክለኛውን የአስተዋዋቂ ክልል ለይተው የጽሑፍ ግልባጭን ይመሰርታሉ።
የፕሮካርዮቲክ ፕሮካርዮቲክ ፕሮካርዮቲክ አራማጅ የያዘው ሶስት አይነት የአስተዋዋቂ ክፍሎችን ብቻ ነው። በፕሮካርዮት ውስጥ ያሉ የፕሮካርዮት አራማጆች ተሳትፎ አነስተኛ መሆኑ ከፍተኛ ቁጥር ያላቸውን የአስተዋዋቂ ቅደም ተከተሎችን የሚያካትት የዩካሪዮቲክ ግልባጭ ጋር ሲወዳደር የመገልበጥ ሂደታቸው የተራቀቀበት ዋና ምክንያት ነው። ከሶስቱ ፕሮካርዮት ፕሮካርዮቶች ውስጥ ሁለት ዋና ዋና ሁለት አጫጭር የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች አሉ። እነዚህ ቅደም ተከተሎች እንደየአካባቢያቸው ይከፋፈላሉ. እነሱም፣ -10 አስተዋዋቂዎች ወይም ኤለመንቶች (ይህ 10ቢፒ ወደላይ የሚገለበጥበት ቦታ ያለው) -35 አስተዋዋቂዎች ወይም ኤለመንቱ (ይህም 35ቢፒ ወደላይ የሚገለበጥበት ቦታ ላይ የሚገኝ) ናቸው።
ምስል 02፡ ፕሮካርዮቲክ ፕሮሞተር
የ -10 አስተዋዋቂው ከ eukaryotic TATA ሣጥን ወይም ፕሪብኖው ሳጥን ጋር እኩል ነው እና በፕሮካርዮት ውስጥ የጽሑፍ ግልባጭ ለመጀመር አስፈላጊ አካል ነው። የ -35 አስተዋዋቂው የፕሮካርዮቲክ ግልባጭ መጠንን ለመቆጣጠር በንቃት የሚሳተፍ TTGACA ነው።
በዩኩሪዮቲክ እና ፕሮካርዮቲክ ፕሮሞተሮች መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- በሁለቱም አይነት አስተዋዋቂዎች በተለያዩ የዲኤንኤ ቁጥጥር ስርአቶች የሚቆጣጠሩት ማበልጸጊያ፣ ዝምታ ሰጪዎች፣ ኢንሱሌተሮች እና የድንበር ክፍሎችን ያካተቱ ናቸው።
- አስተዋዋቂዎች በፕሮካርዮት እና በ eukaryotes ግልባጭ የሚጀምሩት ቅደም ተከተሎች ናቸው።
- አስተዋዋቂዎች የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ናቸው።
በዩካርዮቲክ እና ፕሮካርዮቲክ ፕሮሞተሮች መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters |
|
Eukaryotic አስተዋዋቂዎች የዩኩሪዮቲክ ህዋሳትን ቅጂ የሚጀምሩት የቁጥጥር ቅደም ተከተሎች ናቸው። | የፕሮካርዮቲክ ፕሮካርዮቲክ አራማጆች የፕሮካርዮቲክ ጂኖች ቅጂን የሚጀምሩት የቁጥጥር ቅደም ተከተሎች ናቸው። |
ንጥረ ነገሮች | |
ፕሮካርዮቲክ ፕሮካርዮቲክ አራማጅ ወደ ላይ ያሉ ክፍሎችን፣ -10 ኤለመንትን እና -35 ክፍሎችን ያካትታል። | Eukaryotic ፕሮሞተር ፕሪብኖው ቦክስ (ታታ ሳጥን)፣ CAAT ሣጥን፣ ጂሲ ቦክስ እና አስጀማሪ ክፍሎችን ያካትታል። |
ማጠቃለያ – Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters
አስተዋዋቂ የዲ ኤን ኤ ክልል ሲሆን ይህም ወደ ጽሑፍ መገልበጥ የሚባል ሂደት መጀመርን ያካትታል።እነዚህ አስተዋዋቂዎች በተለምዶ ወደ ግልባጭ መጀመሪያ ቦታ ወደ ላይ ይገኛሉ። ሦስቱ ዋና ዋና ክፍሎች አራማጅ፣ ኮር አራማጅ፣ ፕሮክሲማል አራማጅ እና የርቀት አስተዋዋቂ ናቸው። በ eukaryotes አውድ ውስጥ፣ በአስተዋዋቂው ክልል ውስጥ እጅግ በጣም የተራቀቁ እና ከፕሮካርዮት የበለጠ የተለያዩ የሚያስተዋውቁ ብዙ ቁጥር ያላቸው ንጥረ ነገሮች አሉ። የአንዳንድ eukaryotic ፕሮሞተር ኤለመንቶች ምሳሌዎች ፕሪብኖው ቦክስ (ታታ ሳጥን)፣ ጂሲ ቦክስ፣ CAAT ቦክስ ወዘተ ናቸው። በፕሮካርዮት ውስጥ ሁለት ዋና ዋና አስተዋዋቂ ንጥረ ነገሮች አሉ እነሱም -10 ኤለመንት (ይህም 10ቢፒ ወደላይ የሚገለበጥበት ቦታ ላይ የሚገኝ)፣ -35 ኤለመንቶች አሉ። (ይህ አሁን ያለው 35bp ወደላይ የሚገለበጥበት ቦታ ነው)። -10 አራማጅ ግልባጩን ይጀምራል፣ እና -35 አራማጅ ግልባጭን ይቆጣጠራል። የሁለቱም አይነት አስተዋዋቂዎች በተለያዩ የዲኤንኤ ቁጥጥር ቅደም ተከተሎች የሚቆጣጠሩት ማበልጸጊያ፣ ጸጥ ሰጭ፣ ኢንሱሌተር እና የድንበር አካላትን ያካተቱ ናቸው። ይህ በ eukaryotic እና በፕሮካርዮቲክ አራማጆች መካከል ያለው ልዩነት ነው።
የዩካሪዮቲክ vs ፕሮካርዮቲክ ፕሮሞተርስ ፒዲኤፍ አውርድ
የዚህን ጽሁፍ ፒዲኤፍ ስሪት አውርደው በጥቅስ ማስታወሻ መሰረት ከመስመር ውጭ አላማዎች መጠቀም ይችላሉ። እባክዎ የፒዲኤፍ ቅጂውን እዚህ ያውርዱ፡ በዩካሪዮቲክ እና ፕሮካርዮቲክ ፕሮካርዮቲክ መካከል ያለው ልዩነት