ቁልፍ ልዩነት - ፕሮቲዮሚክስ vs ትራንስክሪፕቶሚክስ
የኦሚክ ቴክኖሎጂ የወቅቱ አዝማሚያ ሲሆን የተለያዩ የሰውነት ባዮሞለኪውሎች ባህሪያቱን እና ተግባራቶቹን በተመለከተ እንደ አጠቃላይ ስብስብ የሚታዩበት። የኦሚክ ቴክኖሎጂ ሰፋ ያለ አፕሊኬሽኖች አሉት። የተለያዩ የባዮሎጂካል ናሙናዎች ጂኖሚክስ፣ ፕሮቲዮሚክስ፣ ትራንስክሪፕቶሚክስ እና ሜታቦሎሚክስ ያካትታሉ። ፕሮቲዮሚክስ በሕያው አካል ውስጥ ያሉትን ሁሉንም ፕሮቲኖች ሙሉ ጥናት ያካትታል። በሰውነት ውስጥ ያሉ ሁሉም የተገለጹ ፕሮቲኖች ስብስብ ፣ መዋቅራዊ እና ተግባራዊ ባህሪዎች ስብስብ ተብሎ ይገለጻል። የተሟሉ የፕሮቲኖች ስብስብ, ስለዚህ, ፕሮቲን ይመሰርታሉ.ትራንስክሪፕቶሚክስ በሕያው አካል ውስጥ የሚገኙትን የመልእክተኛው አር ኤን ኤ (ኤምአርኤን) ሞለኪውሎች ሙሉ ጥናት ነው። ስለዚህም ትራንስክሪፕቶሚክስ በሕያው አካል ውስጥ በንቃት የሚገለጹትን ጂኖች ይመለከታል። በሕያው አካል ውስጥ ያለው አጠቃላይ የ mRNA ስብስብ እንደ ትራንስክሪፕት ተብሎ ይጠራል። በፕሮቲዮሚክስ እና ትራንስክሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት በባዮሞለኪውል ዓይነት ላይ የተመሠረተ ነው። በፕሮቲዮሚክስ ውስጥ፣ በአንድ ህይወት ያለው አካል ውስጥ ያሉት አጠቃላይ የተገለጹ ፕሮቲኖች ይጠናል፣ በትራንስክሪፕቶሚክስ ግን የአንድ ህይወት ያለው አካል አጠቃላይ ኤምአርኤን ይማራል።
Proteomics ምንድን ነው?
ፕሮቲዮሚክስ የሚለው ቃል እ.ኤ.አ. በ1995 የተፈጠረ ሲሆን በመጀመሪያ በሴል፣ ቲሹ ወይም አካል ውስጥ ያለው አጠቃላይ የፕሮቲን ማሟያ ተብሎ ይገለጻል። በፕሮቲዮሚክ ጥናቶች እድገት ፣ ብዙ የጥናት መስኮች የተካተቱበት እንደ ጃንጥላ ቃል እንዲቆጠር ተሻሽሏል። በአሁኑ ጊዜ በፕሮቲዮቲክስ ርዕስ ስር አወቃቀሩ, አቀማመጥ, ተግባራት, መስተጋብሮች, ማሻሻያዎቹ, አፕሊኬሽኖቹ እና ፕሮቲኖችን አስፈላጊነት ያጠናል.ስለዚህ በአሁኑ ጊዜ በፕሮቲዮሚክስ ዘርፍ ብዙ ጥናቶች እየተካሄዱ ነው።
የመጀመሪያዎቹ የፕሮቲን ጥናቶች የተካሄዱት በ Escherichia coli ውስጥ ያለውን የፕሮቲን ይዘት ለመለየት ነው። የአጠቃላይ የፕሮቲን ይዘት የካርታ ስራ የተከናወነው ባለ ሁለት ጂልስ (2D) በመጠቀም ነው። በዚህ ስኬት ላይ ሳይንቲስቶች በእንስሳት ውስጥ እንደ ጊኒ አሳማ እና አይጥ ያሉ አጠቃላይ የፕሮቲን ይዘቶችን ለመለየት ተንቀሳቅሰዋል። በአሁኑ ጊዜ የሰው ፕሮቲን ካርታ በ2D ጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ በመጠቀም ይከናወናል።
የፕሮቲዮሚክስ መተግበሪያዎች
ፕሮቲኖች በፕሮቲኖች አበረታች ባህሪ ምክንያት የአብዛኛውን እንቅስቃሴ የሚቆጣጠሩ ሞለኪውሎች በመሆናቸው ፕሮቲዮሚክስን በማጥናት ብዙ ጥቅሞች አሉት። ስለዚህ የሙሉ ፕሮቲኖች ጥናት የአንድን አካል የጤና ሁኔታ በተመለከተ መረጃ ሊሰጥ ይችላል። አንዳንድ መተግበሪያዎች፤ ናቸው
- የጂኖም ማብራሪያ፡ የሰውነትን ፕሮቲን ይዘት በማጥናት ለፕሮቲን ውህድ ተጠያቂ የሆኑትን ትክክለኛ ጂኖም ማወቅ ይቻላል። በዚህ ሁኔታ ከሁሉም የጂኖም ውጤቶች፣ ትራንስክሪፕቶሚክስ እና ፕሮቲዮሚክስ አስፈላጊ ናቸው።
- የበሽታ መለያ/መመርመሪያ፡- ፕሮቲዮሚክስ የበሽታውን ሁኔታ ለመለየት፣ጤናማውን እና የታመሙትን በማነፃፀር ጥቅም ላይ ይውላል።
- በሙከራ ጊዜ የተጠና የፕሮቲን አገላለጽ ለማከናወን።
- የፕሮቲን ማሻሻያ እና መስተጋብር ጥናቶች፡- ፕሮቲኖችን በብልቃጥ ሁኔታዎች ወይም እና በቫይኦ ሁኔታዎች ለመጠቀም፣ የእነዚህን የተወጡት ፕሮቲኖች የማከማቻ ሁኔታ ለመወሰን እና የፕሮቲን ባህሪን በብልቃጥ፣ በቪኦ እና ውስጥ ለማጥናት - የሲሊኮ ዘዴዎች።
ሥዕል 01፡ ፕሮቲዮሚክስ
በፕሮቲዮሚክስ ውስጥ የተካተቱ የተለያዩ ቴክኒኮች አሉ
- ከአጠቃላይ ፕሮቲን ማውጣት እና ፕሮቲኖችን 2D ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ በመጠቀም መለየት። ፕሮቲኖች ከፍተኛ አፈጻጸም ያለው ፈሳሽ ክሮማቶግራፊ (HPLC) በመጠቀም ሊለያዩ ይችላሉ።
- የተወጡትን ፕሮቲኖች እንደ የኤድመንድ ቅደም ተከተል ዘዴ ወይም Mass spectrometry ያሉ ዘዴዎችን በመጠቀም ቅደም ተከተል ማስያዝ።
- ተከታታዩ ከታወቁ በኋላ የፕሮቲን ይዘቱ መዋቅራዊ እና ተግባራዊ ባህሪያት በኮምፒውተር ላይ የተመሰረቱ ሶፍትዌሮችን እና ባዮኢንፎርማቲክስ መሳሪያዎችን በመጠቀም ይተነተናል።
Transcriptomics ምንድን ነው?
የጽሑፍ ግልባጭ ቃሉ በቅርብ ጊዜ የተፈጠረ ነው። ትራንስክሪፕቶሚክስ የአንድ ኦርጋኒክ አጠቃላይ mRNA ይዘት ጥናት ነው። አጠቃላይ ኤምአርኤን በህያው አካል ወይም ሕዋስ ውስጥ የተገለጸው ዲ ኤን ኤ ነው። የኤምአርኤን ሙሉ ስብስብ እንደ ግልባጭ ተጠቅሷል።
ግልባጩን ለመተንተን የሚወስዱት እርምጃዎች፣ያካትታሉ።
- አር ኤን ኤ ማውጣት፣ ኤምአርኤን መለየት ከአምድ ጄል ክሮማቶግራፊ ከፖሊ ዲቲ ዶቃዎች ጋር።
- የኤምአርኤን ቅደም ተከተል ተከናውኗል።
ማይክሮአረይ ቴክኖሎጂ የሰውነት ግልባጭን የመለየት አንዱ የተለመደ መንገድ ነው። የማይክሮአረይ ቴክኒክ ከትራንስክሪፕት ተጓዳኝ ክሮች ጋር የፍተሻ ሳህንን ያካትታል። ከተዳቀለ በኋላ፣ በሰውነት ወይም በሴሎች ውስጥ ያለው mRNA ሊታወቅ ይችላል።
ምስል 02፡ የጽሑፍ ግልባጭ ቴክኒኮች
Transcriptomics አሁን በህክምናው ዘርፍ በስፋት ጥቅም ላይ ውሏል። የበሽታ መመርመሪያ እና የበሽታ መገለጫ ትራንስክሪፕቶሚክስ ጥቅም ላይ የሚውልባቸው ዋና ዋና መስኮች ናቸው። የኦርጋኒክ ግልባጭን በመተንተን የውጭ mRNA ሊታወቅ ይችላል, እና ማንኛውም ኢንፌክሽኖች ካሉ, ሊታወቅ ይችላል. ኮዲንግ ያልሆነውን አር ኤን ኤ ትራንስስክሪፕቶሚክ ቴክኖሎጂዎችን በመጠቀም መለየት ይቻላል። እንዲሁም በተለያዩ የአካባቢ ጭንቀቶች ውስጥ ያሉ የጂን አገላለጾች ቁጥጥር ሊደረግባቸው ይችላል።
በፕሮቲኦሚክስ እና ትራንስክሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- ሁለቱም የኦሚክ ቴክኖሎጂ ጽንሰ ሃሳብ አካል ናቸው።
- ሁለቱም ለበሽታ መመርመሪያ እና የሰውነት አካል በሽታ መለያነት ያገለግላሉ።
- ሁለቱም የጥናት ቦታዎች ባዮሞለኪውልን ማውጣት፣ ባዮሞለኪውልን መለየት እና ቅደም ተከተሎችን ያካትታሉ።
በፕሮቲዮሚክስ እና ትራንስክሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
ፕሮቴሚክስ vs ትራንስክሪፕቶሚክስ |
|
| ፕሮቲዮሚክስ በህያው አካል ውስጥ ያሉትን ሁሉንም ፕሮቲኖች ሙሉ ጥናት ያካትታል። | Transcriptomics በሕያው አካል ውስጥ የሚገኙትን የመልእክተኛው አር ኤን ኤ (ኤምአርኤን) ሞለኪውሎች ሙሉ ጥናት ነው። |
| የተጠና የባዮ ሞለኪውል ዓይነት | |
| ፕሮቲኖች በፕሮቲዮሚክስ ይጠናል። | mRNA የሚጠናው በግልባጭ ነው። |
| ምክንያቶች የተጠኑ | |
| የፕሮቲኖች አወቃቀር፣ ተግባር፣ መስተጋብር፣ ማሻሻያ እና አተገባበር በፕሮቲዮሚክስ ውስጥ ይማራል። | የቅደም ተከተል አወቃቀር፣ከአካባቢው ጋር ያለው መስተጋብር እና የኤምአርኤን አፕሊኬሽኖች በጽሑፍ ግልባጭ ይጠናል። |
ማጠቃለያ - ፕሮቲዮሚክስ vs ትራንስክሪፕቶሚክስ
ኦሚክስ በህይወት ሳይንስ መስክ ትልቅ ሚና ይጫወታል። ፕሮቲዮሚክስ የሚያመለክተው በሴል ወይም በኦርጋኒክ ውስጥ የተሟሉ የፕሮቲን ስብስቦችን የሚመሰርት የፕሮቲን ጥናትን ነው። ትራንስክሪፕቶሚክስ የሚያመለክተው በኤምአርኤን (mRNA) መልክ ያለው የተሟላ የዲ ኤን ኤ ስብስብ የሆነውን የትራንስክሪፕት ጥናት ነው። ሁለቱ የጥናት ቦታዎች ማለትም ፕሮቲዮሚክስ እና ትራንስክሪፕቶሚክስ ጂኖሚክስ ከገባ በኋላ የተገኙ እና በአሁኑ ጊዜ በህክምና ምርመራ እና በባህሪያት እና ፍጥረታትን ለማጣራት በሰፊው ጥቅም ላይ ይውላሉ. ይህ በፕሮቲዮሚክስ እና በጽሑፍ ግልባጭ መካከል ያለው ልዩነት ነው።
የProteomics vs Transcriptomics PDF አውርድ
የዚህን ጽሁፍ ፒዲኤፍ ስሪት አውርደህ ከመስመር ውጭ አላማዎች በጥቅስ ማስታወሻ መጠቀም ትችላለህ። እባክዎ የፒዲኤፍ ሥሪቱን እዚህ ያውርዱ፡ በፕሮቲኦሚክስ እና ትራንስሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ልዩነት
