የቁልፍ ልዩነት - Exome vs RNA Sequencing
Nucleic acid sequencing የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል በተወሰነ የዲኤንኤ ወይም አር ኤን ኤ ክፍልፋይ የሚወስን ዘዴ ነው። የሴል ዲ ኤን ኤ እና አር ኤን ኤ ሜካፕን በመለየት እና ለተግባራዊ ፕሮቲኖች ኮድ የሆኑትን የተወሰኑ ጂኖችን ለመለየት ቅደም ተከተል አስፈላጊ ነው; ስለዚህም ቅደም ተከተል የእነዚህን ጂኖች እና የጂን መግለጫዎች ሚውቴሽን ለመረዳት ያስችላል። የSanger Sequencing ዘዴ ወይም በጣም የላቀ የቀጣይ ትውልድ ቅደም ተከተል ዘዴዎች በተለምዶ ጥቅም ላይ የሚውሉት የቅደም ተከተል ዘዴዎች ናቸው። Exome sequencing ማለት በሰውነት ውስጥ የሚገኙትን የኤክስዮን ወይም ኮድ ዲ ኤን ኤ ክልሎችን በቅደም ተከተል ማስያዝ ሲሆን አር ኤን ኤ ደግሞ የ Ribonucleic acids (RNA) ቅደም ተከተል ነው።ይህ በ exome እና RNA ተከታታይ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
Exome Sequencing ምንድን ነው?
Exome የጂኖም ንኡስ ስብስብ ሲሆን እሱም የአንድ የተወሰነ አካል ኮድ ጂኖች። ኮዲንግ ጂኖች ኤክስዮን ተብለው ተሰይመዋል እና ወደ ኤምአርኤን የተገለበጡ እና ከዚያም ወደ አሚኖ አሲድ ቅደም ተከተሎች ይተረጎማሉ። በድህረ ግልባጭ ማሻሻያዎች ወቅት፣ በ eukaryotes ውስጥ ያለው የአር ኤን ኤ ስፔሊንግ ዘዴ ኢንትሮኖችን (ኮድ ያልሆኑ ክልሎችን) ያስወግዳል፣ እና ኤክሰኖች ይቀራሉ። exome sequencing የሚከናወንባቸው ሁለት ዋና ቴክኒኮች አሉ፡መፍትሄ ላይ የተመሰረተ እና ድርድር ላይ የተመሰረተ።
በመፍትሄ ላይ በተመሰረተ የኤክስሜሽን ቅደም ተከተል፣ የዲኤንኤ ናሙናዎች ገደብ ኢንዛይሞችን ወይም ሜካኒካል ዘዴን በመጠቀም የተከፋፈሉ እና በሙቀት የተቆራረጡ ናቸው። በዚህ ቴክኒክ ባዮቲንላይድ ኦሊጎኑክሊዮታይድ መመርመሪያዎች (baits) በጂኖም ውስጥ ካሉ የታለሙ ክልሎች ጋር በምርጫ ለማዳቀል ያገለግላሉ። ለማሰሪያው ደረጃ መግነጢሳዊ ስትሬፕታቪዲን ዶቃዎች ጥቅም ላይ ይውላሉ። ማሰሪያው ያልታሰሩ እና ያልታለሙ ቅደም ተከተሎች በሚታጠቡበት የማጠቢያ ደረጃ ይከተላል.የታሰሩ ኢላማዎች በPolymerase Chain reaction (PCR) ይጠናከራሉ ከዚያም Sanger sequencing ወይም Next Generation Sequencing ቴክኒኮችን በመጠቀም በቅደም ተከተል ይቀመጣሉ።
ምስል 01፡ Exome Sequencing
አደራደርን መሰረት ያደረገ ዘዴም እንዲሁ ከመፍትሔው ዘዴ ጋር ተመሳሳይ ነው፣ የዲኤንኤ ቁርጥራጮች ወደ ማይክሮ ድርድር ከመያዙ በስተቀር፣ እና የማሰር እና የማጠቢያ እርምጃዎች ከመቀጠላቸው በፊት ይከተላሉ።
Exome sequencing በበርካታ አፕሊኬሽኖች ውስጥ እንደ በሽታዎች ጀነቲካዊ ምርመራ፣ በጂን ቴራፒ፣ ልብ ወለድ ጀነቲካዊ ማርከሮችን በመለየት፣ በግብርና ላይ የተለያዩ ጠቃሚ አግሮኖሚክ ባህሪያትን ለመለየት እና በእጽዋት እርባታ ሂደት ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል።
አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ምንድን ነው?
አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል በጽሑፍ ግልባጭ ላይ የተመሰረተ ነው፣ እሱም የሕዋስ ሙሉ ቅጂዎች ነው።የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ቁልፍ ግቦች ኤምአርኤን፣ ኮዲንግ ያልሆነ አር ኤን ኤ እና ትንሽ አር ኤን ን ጨምሮ ሁሉንም የፅሁፉ ዓይነቶች ካታሎግ ማድረግ የጂኖችን ግልባጭ አወቃቀር ለመወሰን እና በእድገት ወቅት የእያንዳንዱን ግልባጭ አገላለጽ መጠን ለመለካት ነው። በአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ወቅት፣ የማዳቀል ቴክኖሎጂዎች (ከጎለመሱ ኤምአርኤንኤ ቅደም ተከተሎች የተገኙ ተጓዳኝ ዲ ኤን ኤ ነበሩ) መጀመሪያ ላይ በቅደም ተከተል ጥቅም ላይ ውለዋል። በአሁኑ ጊዜ ለአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የበለጠ ትክክለኛ እና የላቀ ቴክኒክ ጥቅም ላይ ይውላል።
ምስል 02፡ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
በአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል፣ አጠቃላይ አር ኤን ኤ ወይም ክፍልፋይ የሆነ አር ኤን ኤ የሆነ ናሙና ወደ ተጓዳኝ ዲ ኤን ኤ (ሲዲኤንኤ) ተቀይሯል እና የሲዲኤንኤ ላይብረሪ ተዘጋጅቷል። እያንዳንዱ የሲዲኤንኤ ቁራጭ በሁለቱም በኩል ወደ አስማሚዎች ተያይዟል (የጥምር መጨረሻ ቅደም ተከተል) ወይም በአንድ በኩል (ነጠላ የመጨረሻ ቅደም ተከተል)።እነዚህ መለያ የተደረገባቸው ቅደም ተከተሎች የሳንገር ቅደም ተከተል ወይም ቀጣይ ትውልድ እንደ exome sequencing።
በExome እና RNA Sequencing መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- አጭር የተመረጡ ቁርጥራጮች ወይም ሙሉው የዲኤንኤ/አር ኤን ኤ ስብስብ ለExome ወይም RNA ቅደም ተከተል መጠቀም ይቻላል።
- የተከታታይ ቁርጥራጮች በቤተ-መጽሐፍት ውስጥ ተጠብቀዋል።
- Sanger ቅደም ተከተል ወይም ቀጣይ ትውልድ ቅደም ተከተል መጠቀም ይቻላል።
- ሁለቱም በብልቃጥ ቅደም ተከተሎች ውስጥ ናቸው።
- የተከታታይ ቁርጥራጮች በፍሎረሰንት መለያዎች ሊወሰኑ ይችላሉ።
በExome እና RNA Sequencing መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Exome vs RNA Sequencing |
|
| Exome ቅደም ተከተል በአንድ አካል ውስጥ የሚገኙትን የተሟሉ የኤክሰኖች ወይም የዲኤንኤ ክልሎች ቅደም ተከተል ነው። | አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የሪቦኑክሊክ አሲዶች (አር ኤን ኤ) ቅደም ተከተል ሂደትን ያመለክታል። ግልባጩ። |
| የጀማሪ ናሙና | |
| ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ የ exome ቅደም ተከተል መነሻ ናሙና ነው። | አር ኤን ኤ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል መነሻ ናሙና ነው። |
| ጥንቅር | |
| ይህ ከጠቅላላው ዲኤንኤ ኤክሰንስ ብቻ ነው የሚይዘው | ይህ RNA-mRNA / ግልባጭ ይዟል። |
| ቅደም ተከተል | |
| ሁለት ዋና ዋና የ exome ቅደም ተከተል ዘዴዎች አሉ; መፍትሄ ላይ የተመሰረቱ እና ድርድር ላይ የተመሰረቱ ቴክኖሎጂዎች። | አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የሚከናወነው አጠቃላይ አር ኤን ኤ ወይም የተበጣጠሰ አር ኤን በማውጣት በሲዲኤንኤ ቤተ-መጽሐፍት ዝግጅት ነው። |
ማጠቃለያ - Exome vs RNA Sequencing
ኤክሶም የአንድ አካል ሙሉ የኮድ ማድረጊያ ክልሎች ሲሆን የኤክሶም ትክክለኛ ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ለመወሰን የተካተቱት ቴክኒኮች exome sequencing በመባል ይታወቃል። የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የአንድ አካል አር ኤን ኤ ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተልን ለመወሰን የሚረዳ ዘዴ ነው። ይህ በ exome እና RNA ተከታታይ መካከል ያለው ልዩነት ነው።
የኤክሶም vs አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ፒዲኤፍ ስሪት አውርድ
የዚህን ጽሁፍ ፒዲኤፍ ስሪት አውርደው እንደ ጥቅስ ማስታወሻ ከመስመር ውጭ ዓላማ መጠቀም ይችላሉ። እባኮትን የፒዲኤፍ ስሪት እዚህ ያውርዱ በExome እና RNA Sequencing መካከል ያለው ልዩነት
