ቁልፍ ልዩነት - Exome vs Transcriptome
አንድ ጂን በውስጡ ኮድ እና ኮድ የማይሰጡ ክልሎችን ይዟል። ኮድ ማድረጊያ ቅደም ተከተሎች exons በመባል ይታወቃሉ, እና ኮድ ያልሆኑ ቅደም ተከተሎች ኢንትሮንስ በመባል ይታወቃሉ. የጂን ኤክስፖኖች ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል የተወሰነውን ፕሮቲን ለማዋሃድ የጂን ጄኔቲክ ኮድን ይወክላል። ስለዚህ ኤክሰኖች በ mRNA ሞለኪውል ውስጥ ይቀራሉ። የጂኖም አጠቃላይ የኤክስዮን ክልል exome በመባል ይታወቃል፣ እና የጂኖም አስፈላጊ አካል ነው። የጂኖች የጄኔቲክ ኮድ ወደ ኤምአርኤንኤ ሞለኪውል የጄኔቲክ ኮድ ይቀየራል, እሱም ለፕሮቲን ምርት አስፈላጊ ነው. በአንድ ጊዜ በሴል ወይም በሴል ህዝብ ውስጥ የተገለበጡ አጠቃላይ የኤምአርኤንኤ ሞለኪውሎች ትራንስክሪፕት በመባል ይታወቃሉ።በ exome እና transcriptome መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት exome የጂኖም የኤክስዮን ክልሎችን ቅደም ተከተሎች የሚወክል ሲሆን ትራንስክሪፕት ግን የአንድ ሕዋስ ወይም የሕብረ ሕዋስ አጠቃላይ ኤምአርኤን በአንድ የተወሰነ ጊዜ ይወክላል።
Exome ምንድን ነው?
ጂኖች በኤክሰኖች፣ መግቢያዎች እና የቁጥጥር ቅደም ተከተሎች የተዋቀሩ ናቸው። ኤክሰኖች በሚገለበጥበት ጊዜ ወደ mRNA ቅደም ተከተል የተገለበጡ የጂን ክልሎች ናቸው። መግቢያዎች እና ሌሎች ኮድ የማይሰጡ ክልሎች በጽሁፍ ግልባጭ ወቅት ይወገዳሉ። የኤክስዮን ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል የዘረመል ኮድን የሚወስን ሲሆን ይህም ኮድ የሚያወጣበትን ልዩ ፕሮቲን ያዋህዳል። በፕሮቲን ኤምአርኤን ውስጥ የሚቀሩት ኤክሰኖች ብቻ ናቸው። በጂኖም ውስጥ ያሉ የኤክሶን ስብስብ (exome of an organism) በመባል ይታወቃል። በጂኖች ውስጥ የተገለጸውን የጂኖም ክፍል ይወክላል. በሰዎች ውስጥ, exome ከጂኖም 1% ይይዛል. እሱ የሰው ጂኖም የፕሮቲን ኮድ ክፍል ነው።
ሥዕል 01፡ Exome
ትራንስክሪፕት ምንድን ነው?
ትራንስክሪፕቱ የሁሉም ፕሮቲን-ኮድ እና ኮድ-ያልሆኑ ቅጂዎች (አር ኤን ኤዎች) በተሰጠው ቲሹ ውስጥ ስብስብ ነው። ትራንስክሪፕት በሴል ወይም በቲሹ ውስጥ በጂኖች የተገለጹትን የጠቅላላ mRNA ሞለኪውሎች ስብስብ ይወክላል። የሕዋስ ግልባጭ ከሌላ የሕዋስ ዓይነት ግልባጭ ጋር ሊለያይ ይችላል። ትራንስክሪፕት እንዲሁ ተለዋዋጭ ነው - ለሁለቱም ውስጣዊ እና ውጫዊ ማነቃቂያዎች ምላሽ በጊዜ ይለወጣል. በተመሳሳዩ ቲሹ ውስጥ ወይም በተመሳሳዩ የሴል አይነት ውስጥ እንኳን፣ ግልባጭ ከጥቂት ደቂቃዎች በኋላ ሊቀየር ይችላል።
ትራንስክሪፕት ከኦርጋኒዝም exome ይለያል። ትራንስክሪፕት የተገለጹትን የ exome ቅደም ተከተሎችን ብቻ ያካትታል። ምንም እንኳን የሕዋስ መውጣት ተመሳሳይ ቢሆንም፣ የጂን አገላለጽ ለሁሉም ሕዋሳት ወይም ሕብረ ሕዋሳት ተመሳሳይ ስላልሆነ በሴሎች መካከል ግልባጭ ይለያያል። በተለያዩ ሴሎች እና ቲሹዎች ውስጥ አስፈላጊ የሆኑ ጂኖች ብቻ ይገለጣሉ.የጂን አገላለጽ የሕዋስ ወይም የሕዋስ ዓይነት የተወሰነ ሂደት ነው። የአካባቢ ሁኔታዎችን ጨምሮ በተለያዩ ሁኔታዎች ቁጥጥር ይደረግበታል. ስለዚህ፣ ትራንስክሪፕት እንደ ውጫዊ የአካባቢ ሁኔታዎች ሊለያይ ይችላል።
Transcriptome ለፕሮቲዮሚክስ ጥናቶች እንደ ቅድመ ሁኔታ ጥቅም ላይ ይውላል። ሁሉም ፕሮቲኖች ከ mRNA ቅደም ተከተሎች የተገኙ ናቸው. የትርጉም ማሻሻያ በፕሮቲኖች ውስጥ ለውጦችን ሊያስከትል ይችላል. ሆኖም፣ ትራንስክሪፕት ለፕሮቲዮሚክ ጥናቶች ጠቃሚ መሰረታዊ መረጃን ይሰጣል።
ስእል 02፡ የፅንስ ግንድ ሴሎች ግልባጭ
በExome እና Transcriptome መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome የጂኖች ፕሮቲን-ኮድ ክልል ስብስብ ነው። | Transcriptome mRNAን ጨምሮ የሁሉም የተገለበጡ አር ኤን ኤ ስብስብ ነው። |
| ናሙና | |
| Exome የሚጠናው የDNA ናሙና በመጠቀም ነው። | ትራንስክሪፕት የሚጠናው አር ኤን ኤ ናሙና በመጠቀም ነው። |
| የጥናት ዘዴ | |
| ሙሉ exome ተከታታይነት exome የማጥናት ዘዴ ነው። | አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ግልባጭ የማጥናት ዘዴ ነው። |
ማጠቃለያ - Exome vs Transcriptome
ኤክሰኖች የጂኖች ኮድ ማድረጊያ ቅደም ተከተሎች ናቸው እና የፕሮቲኖችን ኤምአርኤን ቅደም ተከተል ይወስናሉ። የእነዚህ የኮዲንግ ቅደም ተከተሎች (ኤክሰኖች) ስብስብ (exome of an organism) በመባል ይታወቃል። ጂኖች ፕሮቲኖችን ከመስራታቸው በፊት ወደ mRNA ሞለኪውሎች ይገለበጣሉ። የአንድ ሕዋስ ወይም የሕብረ ሕዋስ ጠቅላላ mRNA ሞለኪውሎች በማንኛውም ጊዜ ትራንስክሪፕት በመባል ይታወቃሉ።ትራንስክሪፕት በማንኛውም ጊዜ ወደ ኤምአርኤን በንቃት የሚገለጹትን ጂኖች ይወክላል። ትራንስክሪፕት ሴል እና ቲሹ ልዩ ነው እና ከአካባቢያዊ ሁኔታዎች ጋር ተፅዕኖ አለው. ይህ በ exome እና በግልባጭ መካከል ያለው ልዩነት ነው።
