የቁልፍ ልዩነት - አልፋ ሄሊክስ vs ቤታ የተለጠፈ ሉህ
የአልፋ ሄሊስ እና ቤታ ፕላትድ ሉሆች በፖሊፔፕታይድ ሰንሰለት ውስጥ በብዛት የሚገኙት ሁለቱ ሁለተኛ ደረጃ መዋቅሮች ናቸው። እነዚህ ሁለት መዋቅራዊ ክፍሎች የ polypeptide ሰንሰለት በማጠፍ ሂደት ውስጥ የመጀመሪያዎቹ ዋና ደረጃዎች ናቸው. በአልፋ ሄሊክስ እና በቤታ የታሸገ ሉህ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት በአወቃቀራቸው ውስጥ ነው። አንድ የተወሰነ ሥራ ለመሥራት ሁለት የተለያዩ ቅርጾች አሏቸው።
አልፋ ሄሊክስ ምንድን ነው?
አንድ አልፋ ሄሊክስ በፖሊፔፕታይድ ሰንሰለት ላይ የሚገኝ የአሚኖ አሲድ ቀሪዎች የቀኝ እጅ ጥቅል ነው። የአሚኖ አሲድ ቅሪቶች ከ 4 እስከ 40 ቅሪቶች ሊለያዩ ይችላሉ.በላይኛው ጠምዛዛ ላይ ባለው የ C=O ቡድን ኦክሲጅን እና የታችኛው ጠመዝማዛ የ N-H ቡድን ሃይድሮጂን መካከል የተፈጠረው የሃይድሮጂን ቁርኝት ጥቅልሉን አንድ ላይ ለማቆየት ይረዳል። ከላይ በተጠቀሰው መንገድ በሰንሰለቱ ውስጥ በየአራት የአሚኖ አሲድ ቅሪቶች የሃይድሮጂን ትስስር ይፈጠራል። ይህ ወጥ የሆነ ንድፍ እንደ የመጠምጠሚያው ውፍረት ያሉ የተወሰኑ ባህሪያትን ይሰጠዋል እና በሄሊክስ ዘንግ ላይ የእያንዳንዱን ሙሉ መዞር ርዝመት ይገልጻል። የአልፋ ሄሊክስ መዋቅር መረጋጋት በብዙ ሁኔታዎች ላይ የተመሰረተ ነው።
ኦ አተሞች በቀይ፣ ኤን አቶሞች በሰማያዊ፣ እና ሃይድሮጂን ቦንድ እንደ አረንጓዴ ነጠብጣብ መስመሮች
ቤታ የተለጠፈ ሉህ ምንድን ነው?
ቤታ ፕሌትድ ሉህ፣እንዲሁም የቅድመ-ይሁንታ ሉህ በመባልም የሚታወቀው፣ በፕሮቲኖች ውስጥ እንደ ሁለተኛ ደረጃ አወቃቀር ይቆጠራል። በሥዕሉ ላይ እንደሚታየው በትንሹ በሁለት ወይም በሶስት የጀርባ አጥንት ሃይድሮጂን ቦንድ ወደ ጎን የተገናኙ የቅድመ-ይሁንታ ክሮች ይዟል።የቤታ ክር የ polypeptide ሰንሰለት የተዘረጋ ነው; ርዝመቱ በአጠቃላይ ከ3 እስከ 10 አሚኖ አሲዶች ጋር እኩል ነው፣ በተራዘመ ማረጋገጫ ውስጥ የጀርባ አጥንትን ጨምሮ።
4-የተጣመረ ፀረ-ትይዩ β ሉህ ቁራጭ ከክሪስታል መዋቅር ኢንዛይም ካታላዝ።
a) በፔፕታይድ ኤን ኤች እና በCO ቡድኖች መካከል ያለውን ፀረ-ትይዩ ሃይድሮጂን ቦንዶች (ነጥብ) በአጎራባች ክሮች ላይ ያሳያል። ቀስቶች የሰንሰለት አቅጣጫን ያመለክታሉ፣ እና የኤሌክትሮን ጥግግት ኮንቱርዎች H ያልሆኑትን አቶሞች ይዘረዝራሉ። ኦ አተሞች ቀይ ኳሶች ናቸው፣ ኤን አቶሞች ሰማያዊ ናቸው፣ እና ኤች አቶሞች ለቀላልነት ተትተዋል፤ የጎን ሰንሰለቶች የሚታዩት ከመጀመሪያው sidechain C አቶም (አረንጓዴ) ብቻ ነው።
b) ጠርዝ-በማዕከላዊ ሁለት β ክሮች እይታ ላይ
በቅድመ-ይሁንታ ሉሆች ውስጥ፣ የፖሊፔፕታይድ ሰንሰለቶች እርስ በእርስ አብረው ይሄዳሉ።እንደ መዋቅሩ ሞገድ በሚመስል ገጽታ ምክንያት "የተጣበቀ ሉህ" የሚል ስም ያገኛል. በሃይድሮጂን ቦንዶች አንድ ላይ ተያይዘዋል. ይህ መዋቅር የ polypeptide ሰንሰለትን በመዘርጋት ተጨማሪ የሃይድሮጂን ቦንዶችን ለመፍጠር ያስችላል።
በአልፋ ሄሊክስ እና በቅድመ-ይሁንታ ወረቀት መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
የአልፋ ሄሊክስ እና የቅድመ-ይሁንታ የተለጠፈ ሉህ መዋቅር
አልፋ ሄሊክስ፡
በዚህ መዋቅር ውስጥ የፖሊፔፕቲድ የጀርባ አጥንት በምናባዊ ዘንግ ዙሪያ እንደ ጠመዝማዛ መዋቅር በጥብቅ ታስሯል። የፔፕታይድ ሰንሰለት የሄሊኮይድ ዝግጅት በመባልም ይታወቃል።
የአልፋ ሄሊክስ መዋቅር መፈጠር የሚከሰተው ፖሊፔፕታይድ ሰንሰለቶች ወደ ጠመዝማዛ ሲጣመሙ ነው። ይህ በሰንሰለቱ ውስጥ ያሉት ሁሉም አሚኖ አሲዶች ሃይድሮጂን ቦንድ (በኦክስጅን ሞለኪውል እና በሃይድሮጂን ሞለኪውል መካከል ያለው ትስስር) እርስ በርስ እንዲተሳሰሩ ያስችላቸዋል። የሃይድሮጂን ቦንዶች ሄሊክስ ክብ ቅርጽን እንዲይዝ ያስችለዋል እና ጥብቅ ጥቅል ይሰጣል. ይህ ክብ ቅርጽ የአልፋ ሄሊክስን በጣም ጠንካራ ያደርገዋል.
የሃይድሮጅን ቦንዶች በቢጫ ነጥቦቹ ይጠቁማሉ።
ቤታ የተለጠፈ ሉህ፡
ሁለት ወይም ከዚያ በላይ የሆኑ የ polypeptide ሰንሰለት(ዎች) ቁርጥራጮች እርስ በእርሳቸው ሲደራረቡ የሃይድሮጂን ትስስር እርስ በእርስ ሲደራረቡ የሚከተሉት መዋቅሮች ሊገኙ ይችላሉ። በሁለት መንገዶች ሊከሰት ይችላል; ትይዩ ዝግጅት እና ፀረ-ትይዩ ዝግጅት።
የአወቃቀሩ ምሳሌዎች፡
አልፋ ሄሊክስ፡ ጥፍር ወይም የእግር ጣት ጥፍር እንደ የአልፋ ሄሊክስ መዋቅር ምሳሌ ሊወሰድ ይችላል።
Beta Pleated Sheet፡ የላባዎች መዋቅር ከቤታ ፕላትድ ሉህ መዋቅር ጋር ተመሳሳይ ነው።
የመዋቅሩ ባህሪያት፡
አልፋ ሄሊክስ፡ በአልፋ ሄሊክስ መዋቅር ውስጥ፣ በሄሊክስ ተራ 3.6 አሚኖ አሲዶች አሉ።ሁሉም የ peptide ቦንዶች ትራንስ እና ፕላን ናቸው, እና በፔፕታይድ ቦንዶች ውስጥ ያሉ የኤን-ኤች ቡድኖች ወደ ተመሳሳይ አቅጣጫ ያመለክታሉ, ይህም ከሄሊክስ ዘንግ ጋር ተመሳሳይ ነው. የሁሉም የ peptide bonds የ C=O ቡድኖች ወደ ተቃራኒው አቅጣጫ ያመለክታሉ, እና እነሱ ከሄሊክስ ዘንግ ጋር ትይዩ ናቸው. የእያንዳንዱ የፔፕታይድ ቦንድ C=O ቡድን ከኤን-ኤች ቡድን የፔፕታይድ ቦንድ የሃይድሮጂን ቦንድ ይመሰርታል። ሁሉም R- ቡድኖች ከሄሊክስ ወደ ውጭ ተጠቁመዋል።
ቤታ የተለጠፈ ሉህ፡ በቅድመ-ይሁንታ ሉህ ውስጥ ያለው እያንዳንዱ የፔፕታይድ ቦንድ እቅድ ያለው እና ትራንስፎርሜሽን አለው። ከአጎራባች ሰንሰለቶች የሚመጡ የፔፕታይድ ቦንዶች የ C=O እና N-H ቡድኖች በአንድ አውሮፕላን ውስጥ ሲሆኑ በመካከላቸው የሃይድሮጅን ትስስር በመፍጠር ወደ አንዱ ያመለክታሉ። በማንኛውም ሰንሰለት ውስጥ ያሉ ሁሉም R- ቡድኖች በአማራጭ ከሉህ አውሮፕላን በላይ እና በታች ሊከሰቱ ይችላሉ።
ትርጉሞች፡
ሁለተኛ ደረጃ መዋቅር፡- በጀርባ አጥንት አሚድ እና በካርቦንሊል ቡድኖች መካከል ባለው የሃይድሮጂን ትስስር ምክንያት የሚታጠፍ ፕሮቲን ቅርጽ ነው።
