በሲስ እና ትራንስ ስፕሊሲንግ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ሲስ ስፔሊንግ ኢንትሮኖችን የሚያስወግድ እና በተመሳሳይ አር ኤን ኤ ትራንስክሪፕት ውስጥ ያሉትን ኤክሰኖች የሚቀላቀለው ሲሆን ትራንስ-ስፕሊሲንግ ደግሞ ኢንትሮን ወይም ዉጭን የሚያስወግድ ኢንተርሞለኩላር ዘዴ ነው። በተመሳሳዩ የአር ኤን ኤ ግልባጭ ውስጥ ያልሆኑትን ኤክሰኖች ይቀላቀላል።
አር ኤን ኤ መሰንጠቅ ከፕሮቲን ውህደት በፊት የአር ኤን ኤ ሂደት ነው። በዚህ ሂደት፣ አዲስ የተሰራ የቅድመ-መልእክተኛ አር ኤን ኤ ቅጂ ወደ ብስለት መልእክተኛ አር ኤን ኤ ይቀየራል። የበሰለ መልእክተኛ አር ኤን ኤ የፕሮቲን ሞለኪውል ለማምረት ይረዳል። በአር ኤን ኤ ስፔሊንግ ወቅት ኢንትሮኖች (ኮድ ያልሆኑ ክልሎች) ይወገዳሉ፣ እና ኤክሰኖች (ኮዲንግ ክልሎች) አንድ ላይ ተጣምረው የጎለመሰ ኤምአርኤን ይሠራሉ።Cis እና trans splicing ሁለት አይነት የአር ኤን ኤ መግጠሚያ ዘዴዎች ናቸው።
Cis Splicing ምንድን ነው?
Cis splicing ኢንትሮኖችን የሚያስወግድ እና በተመሳሳይ የአር ኤን ኤ ግልባጭ ውስጥ ያሉትን ኤክሰኖች የሚቀላቀል የውስጠ-ሞለኪውላር ዘዴ ነው። መደበኛ የሲስ ስፕሊንግ አንድ ነጠላ አር ኤን ኤ ሞለኪውል ይሠራል። Cis splicing በ spliceosomes የሚካሄደው የቅድመ ኤምአርኤን የተለመደ የስፕሊንግ ሂደት ነው። በመግቢያው ውስጥ, ለጋሽ ቦታ (የመግቢያው 5' ጫፍ), የቅርንጫፍ ቦታ (ከመግቢያው 3' ጫፍ አጠገብ) እና ተቀባይ ቦታ (የመግቢያው 3' ጫፍ) ለመገጣጠም በጣም አስፈላጊ ናቸው. የስፕላስ ለጋሹ ቦታ በመግቢያው 5' መጨረሻ ላይ የማይለዋወጥ ቅደም ተከተል GU ያካትታል። በመግቢያው 3' ጫፍ ላይ ያለው የስፕላስ ተቀባይ ጣቢያ የማይለዋወጥ AG ቅደም ተከተል አለው። ከ AG ቅደም ተከተል ወደ ላይ, ፒሪሚዲን ክልል (ፖሊፒሪሚዲን ትራክት) የሚባል ክልል አለ. ከ polypyrimidine ትራክት ወደላይ ከፍ ብሎ ወደላይ, አዴኖሲን ኑክሊዮታይድ ያካተተ የቅርንጫፍ ነጥብ አለ. ይህ ኑክሊዮታይድ በላሪያት አፈጣጠር ውስጥ ይሳተፋል።
ስእል 01፡ሲስ እና ትራንስ ስፕሊንግ
ዋናዎቹ ስፕሊሶሶሞች U1፣ U2፣ U4፣ U5 እና U6 ናቸው። ከነሱ መካከል U1 እና U2 በጣም አስፈላጊ ናቸው. በcis splicing ውስጥ, U1 ከ 5 'splice site, እና U2 ከ 3' ስፔስ ቦታ አጠገብ ካለው የቅርንጫፍ ነጥብ ጋር ይያያዛል. U5/U4/U6 ኤክሰኖችን በ5' ጣቢያ ያገናኛል፣ U6 ከ U2 ጋር በማያያዝ። በኋላ, U1 ተለቋል. U5 ከኤክሶን ወደ ኢንትሮን ይቀየራል፣ እና U6 በ5' ስፕላስ ቦታ ላይ ይያያዛል። በተጨማሪም U4 እንዲሁ ተለቋል። U6/U2 transesterificationን ያመነጫል፣የመግቢያው 5' ጫፍ ኢንትሮን ላይ ወደ ኤ ኑክሊዮታይድ ያደርገዋል። ይህ የላሪያት መፈጠርን ያነሳሳል። ላሪያት በሚፈጠርበት ጊዜ, U5 በ 3 'splice site, እና 5' ጣቢያው ላይ ኤክሰንን ያስራል. በመጨረሻው የመከፋፈያ ደረጃ፣ U2/U5/U6 ከላሪያት ጋር እንደታሰረ ይቆያል፣ እና 3’ ቦታ ተቆርጧል። ከዚህም በተጨማሪ ኤክሰኖች በዚህ ደረጃ ATP hydrolysis በመጠቀም ተያይዘዋል.
Trans Splicing ምንድን ነው?
Trans splicing introns ወይም outronsን የሚያስወግድ እና በተመሳሳይ የአር ኤን ኤ ግልባጭ ውስጥ ያልሆኑትን ኤክሰኖች የሚቀላቀል ኢንተርሞለኩላር ዘዴ ነው። በትራንስ-ስፕሊሲንግ ውስጥ፣ የU1 ፕሮቲን ለማሰር በቅድመ ኤምአርኤንኤ ሞለኪውል ላይ ምንም የ5' ስፕሊሽ ቦታ የለም። በምትኩ፣ የታሸገ የስፕሊስ መሪ (SL) አር ኤን ኤ በውጫዊው ውስጥ በቅደም ተከተል ተከፋፍሏል።
ምስል 02፡ ትራንስ ስፕሊንግ
Outron የቅድመ ኤምአርኤን በ5' ቆብ እና በትራንስ ስፕሊስ ቦታ መካከል ያለ ክልል ነው። ሆኖም፣ U2 ፕሮቲን አብዛኛውን ጊዜ ከ3' ስፕላስ ቦታ ጋር ይያያዛል። ውጫዊውን ካስወገደ በኋላ የስፕላስ መሪ (SL) exon በቅድመ ኤምአርኤንኤ ላይ ከመጀመሪያው ኤክሶን ጋር ይሰፋል። በተጨማሪም ፣ ትራንስ-ስፕሊንግ በተወሰኑ ረቂቅ ተሕዋስያን ውስጥ እንደ የኪኔቶፕላስሴ ክፍል ፕሮቲስቶች ጂኖችን ለመግለጽ የሚታይ ዘዴ ነው።
በሲስ እና ትራንስ ስፕላሲንግ መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- Cis እና trans splicing ሁለት አይነት የአር ኤን ኤ መግጠሚያ ዘዴዎች ናቸው።
- በሁለቱም ስልቶች መግቢያዎች ይወገዳሉ።
- እንዲሁም በሁለቱም ስልቶች ኤክሰኖች ተቀላቅለው የበሰለ ኤምአርኤን ይመሰርታሉ።
- ሁለቱም ዘዴዎች በ eukaryotes ውስጥ ይገኛሉ።
- እነዚህ ዘዴዎች በፕሮካርዮትስ ውስጥ የሉም።
በሲስ እና ትራንስ ስፕላሲንግ መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Cis splicing ኢንትሮኖችን አስወግዶ በተመሳሳይ አር ኤን ኤ ግልባጭ ውስጥ ያሉትን ኤክሰኖች የሚቀላቀል ዘዴ ሲሆን ትራንስ-ስፕሊሲንግ ደግሞ ኢንትሮን ወይም ዉጭን አስወግዶ ተመሳሳይ አር ኤን ኤ ውስጥ ያልሆኑትን ኤክሰኖች የሚቀላቀል ዘዴ ነው። ግልባጭ ስለዚህ፣ ይህ በሲስ እና በትራንስ ስፕሊንግ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። በተጨማሪም፣ በሲስ መሰንጠቅ፣ ውስጠ-ቁሳቁሶች ይወገዳሉ የበሰለ ኤምአርኤን ለመፍጠር። በሌላ በኩል፣ በ trans splicing introns ወይም outrons ይወገዳሉ የበሰለ ኤምአርኤን ለመፍጠር።
የሚከተለው ኢንፎግራፊክ በጎን ለጎን ለማነፃፀር በcis እና trans splicing መካከል ያለውን ልዩነት በሠንጠረዥ መልክ ይዘረዝራል።
ማጠቃለያ – Cis vs Trans Splicing
አር ኤን ኤ መሰንጠቅ ከፕሮቲን ውህደት ሂደት በፊት የአር ኤን ኤ ሂደት ነው። Cis እና trans splicing በ eukaryotes ውስጥ የሚገኙ ሁለት አይነት የአር ኤን ኤ መግጠሚያ ዘዴዎች ናቸው። Cis splicing ኢንትሮኖችን አስወግዶ በተመሳሳዩ አር ኤን ኤ ትራንስክሪፕት ውስጥ ያሉትን ኤክሰኖች የሚቀላቀል የውስጠ-ሞለኪውላር ዘዴ ሲሆን ትራንስ-ስፕሊሲንግ ደግሞ ኢንትሮን ወይም ውጩን አውጥቶ በተመሳሳይ የአር ኤን ኤ ግልባጭ ውስጥ ከሌሉ ኤክሶን ጋር የሚቀላቀል ነው። ስለዚህ፣ ይህ በሲስ እና ትራንስ ስፕሊኪንግ መካከል ያለውን ልዩነት ውይይቱን ያበቃል።
