በCRISPR እና CRISPR Cas9 መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት CRISPR (በየጊዜው የተጠላለፈ አጭር ፓሊንድሮሚክ መድገም) በተፈጥሮ የሚገኝ የፕሮካርዮቲክ የበሽታ መከላከያ ዘዴ ሲሆን CRISPR cas9 በአር ኤን ኤ የሚመራ Cas9 ኑክሊዝ ሲሆን እሱም የ CRISPR አስማሚ አካል ነው። የበሽታ መከላከያ ስርዓት።
CRISPR በባክቴሪያ እና አርኬያ ውስጥ የሚገኝ የፀረ-ቫይረስ መከላከያ በሽታ የመከላከል ስርዓት ነው። በባክቴሪያ ጂኖም ውስጥ የሚገኙት የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ቤተሰብ ነው. ቀደም ሲል በበሽታ ከያዙት የባክቴሪያ ፋጅስ ዲ ኤን ኤ ቁርጥራጮች የተገኙ የስፔሰር ቅደም ተከተሎችን ያካትታል። በቀጣዮቹ የቫይረስ ኢንፌክሽኖች, ባክቴሪያዎች የቫይረስ ዲ ኤን ኤ ለማጥፋት እነዚህን ቅደም ተከተሎች ይጠቀማሉ.የ CRISPR ቅደም ተከተሎች አጫጭር የፓሊንድሮሚክ ድግግሞሾች እና የስፔሰር ቅደም ተከተሎች አሏቸው። በተጨማሪም፣ CRISPR የስፔሰር ቅደም ተከተሎችን ይደግማል ብዙውን ጊዜ ጂኖች ለ Cas ፕሮቲኖች ኮድ አላቸው። Cas9 በአር ኤን ኤ የሚመራ ኢንዶኑክሊዝ ነው። ከ CRISPR ቅደም ተከተሎች ጋር፣ Cas9 ፕሮቲን በባክቴሪያ ውስጥ ከባክቴሪዮፋጅስ ጋር እንደ ተለዋዋጭ የበሽታ መቋቋም ስርዓት ሆኖ ያገለግላል።
CRISPR ምንድን ነው?
CRISPR ክላስተር በመደበኛነት የተጠላለፈ አጭር ፓሊንድሮሚክ ተደጋጋሚ ማለት ነው። በባክቴሪያ ጂኖም ውስጥ የሚገኘው የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ስብስብ ነው። በባክቴሪያ ውስጥ እንደ ተፈጥሯዊ መከላከያ ዘዴ ይሠራል, እና በመጀመሪያ በ E. Coli ውስጥ ተለይቷል. በባክቴሪያዎች ውስጥ በተለይም በባክቴሪያዎች ላይ እንደ ተለዋዋጭ የመከላከያ መከላከያ ይሠራል. ስለዚህ፣ ተከታታይ-ተኮር ስልት ነው።
ምስል 01፡ CRISPR
የ CRISPR ስርዓት በርካታ አጭር-ክፍል የዲኤንኤ ተደጋጋሚ ቅደም ተከተሎችን ይዟል።እነዚህ ድግግሞሾች ፓሊንድሮሚክ ናቸው፣ ከ5’ እስከ 3’ በሚያነቡበት ጊዜ አንድ አይነት የመሠረት ቅደም ተከተል ሲኖራቸው ሌላኛው ደግሞ ከ3‘እስከ 5’ በሚያነቡበት ጊዜ ተመሳሳይ ቅደም ተከተል አላቸው። ከዚህም በላይ ድግግሞሾች ተመሳሳይ ናቸው. ተመሳሳይ ባልሆኑ አጭር የ "spacer" ዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች መካከል ይገኛሉ. ነገር ግን እነዚህ የስፔሰር ዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተሎች ከውጭ ባክቴሪዮፋጅ ዲ ኤን ኤ ጋር ተመሳሳይ ወይም ተዛማጅ ናቸው። ከ CRISPR ጋር የተያያዙ ጂኖች CRISPR ተያያዥ ጂኖች ወይም ካስ ጂኖች በመባል ይታወቃሉ። የካስ ጂኖች ኮድ ለካስ ፕሮቲኖች ሄሊኬሴስ ወይም ኒውክሊየስ። ሄሊካሴስ ዲ ኤን ኤ ሲከፍት ኒውክሊየስ ዲ ኤን ኤ ሲቆርጥ። ባጠቃላይ CRISPRን ስናስብ በባክቴርያ ፋጅስ (ቫይረሶችን የሚበክሉ ባክቴሪያዎች) ላይ የሚሰራ የባክቴሪያ በሽታ የመከላከል ስርዓት ነው።
CRISPR Cas9 ምንድነው?
Cas9 ወይም CRISPR ተያያዥነት ያለው ፕሮቲን 9 በባክቴሪያ በአር ኤን ኤ የሚመራ ኢንዶኑክሊዝ ነው። ስለዚህ፣ ከመመሪያው አር ኤን ኤ ጋር የተጣጣመ ኢላማውን ዲ ኤን ኤ (በተለይ ባክቴሪዮፋጅ ዲ ኤን ኤ) ለይቶ የሚያውቅ እና የሚቆርጥ ኢንዛይም ነው። ፈትል-ተኮር ስንጥቅ ያካሂዳል። የ Cas9 ፕሮቲን ከ CRISPR ተዛማጅ ጂን ኮድ ተቆጥሯል።CRISPR cas9 በአር ኤን ኤ የሚመራ CRISPR-Cas9 ኒውክላይዝ ሲስተም ነው እሱም እንደ አር ኤን ኤ ፕሮግራም ሊደረግ የሚችል ዲኤንኤ ኢላማ ማድረግ እና አርትዖት መድረክ ለጂኖም አርትዖት፣ ግልባጭ መጣስ፣ ኤፒጄኔቲክ ማሻሻያ እና ጂኖም ኢሜጂንግ ነው። ይህ CRISPR cas9 ስርዓት በአሁኑ የጂኖም አርትዖት ስርዓቶች ውስጥ በጣም ታዋቂ ነው።
ምስል 02፡ CRISPR Cas9
በአሁኑ ጊዜ፣ CRISPR/Cas9 የአጥቢ እንስሳትን ጂኖም በመገለባበጥ ወይም በማግበር ለመቀየር ወይም ለማሻሻል ጥቅም ላይ ይውላል። አጥቢ እንስሳው ሕዋሳት የመጠገን ዘዴን በመከተል ለ CRISPR/Cas9 መካከለኛ የዲኤንኤ መግቻዎች ምላሽ መስጠት ይችላሉ። አንድም ግብረ-ሰዶማዊ ያልሆነ የመጨረሻ መቀላቀል ዘዴን (NHEJ) ወይም homology-directed repair (HDR) በመጠቀም ሊከናወን ይችላል። ሁለቱም እነዚህ የመጠገን ዘዴዎች የሚከናወኑት ባለ ሁለት ገመድ እረፍቶችን በማስተዋወቅ ነው። ይህ የአጥቢ እንስሳትን ጂን ማረም ያስከትላል።NHEJ የጂን ሚውቴሽን መጥፋት ሊያስከትል ይችላል እና የተግባር ውጤቶች ማጣት ለመፍጠር ጥቅም ላይ ሊውል ይችላል. HDR የተወሰኑ የነጥብ ሚውቴሽንን ለማስተዋወቅ ወይም የተለያየ ርዝመት ያላቸውን የዲኤንኤ ክፍሎችን ለማስተዋወቅ ሊያገለግል ይችላል። በአሁኑ ጊዜ የ CRISPR/Cas ስርዓት በህክምና፣ ባዮሜዲካል፣ ግብርና እና የምርምር አፕሊኬሽኖች ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል።
በCRISPR እና CRISPR Cas9 መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- Cas9 የCRISPR Cas ስርዓት አካል ነው።
- Crisper Cas9 ሲስተም በተፈጥሮ በባክቴሪያ ውስጥ የሚገኝ የበሽታ መከላከያ ስርዓት ነው።
በCRISPR እና CRISPR Cas9 መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
CRISPR በባክቴሪያ ጂኖም ውስጥ የሚገኝ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ስብስብ ሲሆን ይህም ከባክቴሪዮፋጅስ እንደ ተፈጥሯዊ መከላከያ ሆኖ ይሰራል። በመደበኛነት የተጠላለፉ አጫጭር ፓሊንድሮሚክ ድግግሞሾችን፣ ስፔሰርስ እና ተያያዥ ጂኖችን ያካትታል። በአንጻሩ፣ Cas9 ከ CRISPR ጋር የተያያዘ ፕሮቲን 9 ነው፣ እሱም በአር ኤን ኤ የሚመራ ኤንዶኑክሊዝ ኢንዛይም ነው።የዲኤንኤ ድርብ ቫይረሶችን ያውቃል እና ይሰነጠቃል። በእርግጥ, የ CRISPR መከላከያ ስርዓት አካል ነው. ስለዚህ በ CRISPR እና CRISPR cas9 መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ይህ ነው።
ማጠቃለያ - CRISPR vs CRISPR Cas9
CRISPR Cas ሲስተም ማይክሮቢያል መከላከያ ሲስተም ነው። CRISPR ፓሊንድሮሚክ አጫጭር ድግግሞሾች፣ የስፔሰር ቅደም ተከተሎች እና ተያያዥ ጂኖች ያቀፈ የዲኤንኤ ተከታታይ ስብስብ ነው። Cas9 አንድ የካስ ፕሮቲን ሲሆን እሱም በአር ኤን ኤ የሚመራ ኢንዶኑክሊዝ ነው። CRISPR እና Cas9 ፕሮቲን በሽታን የመከላከል ስርዓትን ፈጥረዋል ይህም በባክቴሪያ ውስጥ በባክቴሪያ የሚመጡ ኢንፌክሽኖችን ይከላከላል። የ Cas9 ፕሮቲን የውጭ የቫይረስ ዲ ኤን ኤ ፈልቅቆ እነሱን ማደናቀፍ ይችላል። CrRNA የቫይረስ ዲ ኤን ኤ ለመለየት cas9 ይመራል። ስለዚህ, CRISPR cas9 ስርዓት በባክቴሪያ ውስጥ በቫይረሶች ውስጥ የሚገኝ ተፈጥሯዊ የመከላከያ ዘዴ ነው. ስለዚህ፣ ይህ በ CRISPR እና CRISPR cas9 መካከል ያለው ልዩነት ማጠቃለያ ነው።
