ቁልፍ ልዩነት - CRISPR vs RNAi
የጂኖም አርትዖት እና የጂን ማሻሻያ በጄኔቲክስ እና በሞለኪውላር ባዮሎጂ ውስጥ መጪ የፍላጎት መስኮች ናቸው። የጂን ማሻሻያ ለጂን ቴራፒ ጥናቶች በሰፊው የሚተገበር ሲሆን የጂን ባህሪያትን፣ የጂን ተግባራዊነት እና በጂን ውስጥ ያለው ሚውቴሽን ስራውን እንዴት እንደሚጎዳ ለመለየት ይጠቅማል። በህያዋን ሴሎች ጂኖም ላይ ትክክለኛ እና የታለሙ ለውጦችን ለማድረግ ቀልጣፋ እና አስተማማኝ መንገዶችን ማዘጋጀት አስፈላጊ ነው። እንደ CRISPR እና RNAi ያሉ ቴክኒኮች ጂኖችን በከፍተኛ ትክክለኛነት ለመቀየር ያገለግላሉ። CRISPR ወይም ክላስተር በመደበኛነት የተጠላለፈ አጭር ፓሊንድሮሚክ ተደጋጋሚ በተፈጥሮ የተገኘ ፕሮካርዮቲክ በሽታን የመከላከል መከላከያ ዘዴ ሲሆን በቅርብ ጊዜ ለ eukaryotic gene editing እና ማሻሻያ ጥቅም ላይ ውሏል።አር ኤን ኤ ወይም አር ኤን ኤ ጣልቃገብነት ከኒውክሊክ አሲዶች ጋር የሚያገናኝ እና የጂን አገላለፅን የሚቆጣጠር ትንሽ ባለ ሁለት ገመድ አር ኤን ኤ በማስተዋወቅ ጂኖችን ዝም ለማሰኘት ተከታታይ-ተኮር ዘዴ ነው። ይህ በCRISPR እና RNAi መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
CRISPR ምንድን ነው?
የ CRISPR ስርዓት ኢ. ኮላይ እና አርኬያንን ጨምሮ በአንዳንድ ባክቴሪያዎች ውስጥ የሚገኝ ተፈጥሯዊ ዘዴ ነው። ከውጭ ዲኤንኤ ላይ ከተመሰረቱ ወረራዎች ጋር የሚጣጣም የመከላከያ መከላከያ ነው. ተከታታይ-ተኮር ዘዴ ነው. የ CRISPR ስርዓት በርካታ የዲኤንኤ ተደጋጋሚ ንጥረ ነገሮችን ይዟል። እነዚህ ንጥረ ነገሮች ከባዕድ ዲ ኤን ኤ እና ከበርካታ ካስ ጂኖች በተገኙ አጭር የ "ስፔሰር" ቅደም ተከተሎች የተጠላለፉ ናቸው. አንዳንድ የካስ ጂኖች ኒውክሊየስ ናቸው። ስለዚህም ሙሉ የበሽታ መከላከያ ስርዓቱ CRISPR/Cas ሲስተም ይባላል።
ምስል 01፡ CRISPR/ Cas system
የ CRISPR/Cas ስርዓት በአራት ደረጃዎች ይሰራል።
- ስርአቱ ወራሪ ፋጅን እና ፕላዝማይድ ዲኤንኤ ክፍሎችን (ስፔሰርስ)ን ወደ CRISPR loci (የስፔሰር ማግኛ ደረጃ ተብሎ የሚጠራው) በዘረመል እያገናኘ ነው።
- crRNA የብስለት ደረጃ - አስተናጋጁ ሁለቱንም CRISPR ተደጋጋሚ ክፍሎችን እና የተዋሃዱ የስፔሰር ክፍሎችን የያዘ CRISPR loci ገልብጦ ያስኬዳል።
- የ crRNA ማግኘት - ይህ በተጨማሪ ቤዝ ማጣመር ይመቻቻል። ይህ ኢንፌክሽን ሲኖር እና ተላላፊ ወኪል ሲገኝ አስፈላጊ ነው።
- የዒላማ ጣልቃገብነት ደረጃ - crRNA የውጭ ዲ ኤን ኤ ያገኛል፣ ከባዕድ ዲ ኤን ኤ ጋር ውስብስብ ይፈጥራል እና አስተናጋጁን ከባዕድ ዲ ኤን ኤ ይከላከላል።
በአሁኑ ጊዜ CRISPR/Cas የአጥቢ እንስሳትን ጂኖም በመገለባበጥ ወይም በማግበር ለመቀየር ወይም ለማሻሻል ይጠቅማል። አጥቢ እንስሳው ሕዋሳት ለ CRISPR/Cas9 መካከለኛ ዲኤንኤ መግቻዎች የጥገና ዘዴን በመከተል ምላሽ መስጠት ይችላሉ።አንድም ግብረ-ሰዶማዊ ያልሆነ የመጨረሻ መቀላቀል ዘዴን (NHEJ) ወይም homology directed repair (HDR) በመጠቀም ሊከናወን ይችላል። ሁለቱም እነዚህ የጥገና ዘዴዎች የሚከናወኑት ባለ ሁለት መስመር እረፍቶችን በማስተዋወቅ ነው። ይህ የአጥቢ እንስሳትን ጂን ማስተካከል ያስከትላል. ስለዚህ በአሁኑ ጊዜ CRISPR/Cas ሲስተም በቴራፒዩቲክ፣ ባዮሜዲካል፣ ግብርና እና ምርምር አፕሊኬሽኖች ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል።
አርኤንኤ ምንድን ነው?
አር ኤን ኤ ጣልቃገብነት ባለ ሁለት መስመር አር ኤን ኤ መካከለኛ ዘዴ ነው፣ እሱም የጂን አገላለፅን ለመቆጣጠር ያገለግላል። ዋናው ውህድ ትንሽ ጣልቃ የሚገቡ አር ኤን ኤዎች (siRNAs) ነው። ሲአርኤንኤዎች ሁለት ኑክሊዮታይድ ያላቸው 3' በላይ ማንጠልጠያ ያላቸው እና የ5' ፎስፌት ቡድን ያላቸው ባለ ሁለት-ክር አር ኤን ኤዎች ልዩ አይነት ናቸው። አር ኤን ኤ ኢንዳክድድ የዝምታ ኮምፕሌክስ (RISC) የተፈጠረው በአር ኤን ኤ ጣልቃ ገብነት ሲሆን ይህም ከሲአርኤን ጋር የተያያዘውን ጂን መበስበስን ያስከትላል።
ምስል 02፡ RNAi
የአርኤንኤው አሰራር እንደሚከተለው ነው።
- በድርብ-ክር ያለው አር ኤን ኤ በሳይቶፕላዝም ውስጥ በ RNase III አይነት ኢንዶሪቦኑክሊዝ Dicer በተባለው ዳይሰርር ~21 ኑክሊዮታይድ ረጅም ሲአርኤን እንዲያመነጭ ይደረጋል
- የሲአርኤን የተሳሰረ Dicer ወደ Argonaute ማዛወር፣በድርብ-ክር በሆኑ አር ኤን ኤ ማሰሪያ ፕሮቲኖች (dsRNABP) እገዛ።
- የአርጎናውት ከአንድ የዱፕሌክስ (መመሪያ ፈትል) ጋር ማሰር። ይህ ሌላውን ፈትል ያስወግዳል. ይህ አጠቃላይ ፕሮቲን - አር ኤን ኤ ኮምፕሌክስን ያስከትላል ይህም RISC ይባላል።
- የRISC ኮምፕሌክስ ማጣመር ከአንድ ባለ ገመድ መመሪያ አር ኤን ኤ ከአርጎናውት ጋር የተያያዘ።
- የተመሳሳይ አር ኤን ኤ ኢላማ ከመመሪያው አር ኤን ኤ ጋር ማጣመር።
- የአርጎናውት ማግበር የዒላማው አር ኤን ኤ ውድመትን ያስከትላል
በCRISPR እና RNAi መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
ሁለቱም እንደ ጂን አገላለጽ የምርምር መሳሪያዎች ያገለግላሉ።
በCRISPR እና RNAi መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
CRISPR vs RNAi |
|
| CRISPR የበሽታ መከላከያ ዘዴ ነው በቅርብ ጊዜ ለ eukaryotic gene editing እና ማሻሻያ ስራ ላይ ውሏል። | አርኤንኤይ ትንሽ ድርብ ገመድበማስተዋወቅ ጂኖችን ዝም ለማሰኘት ተከታታይ-ተኮር ዘዴ ነው። |
| የማነጣጠር ቅደም ተከተል | |
| Synthetic RNA (መመሪያ አር ኤን ኤ) የCRISPR ኢላማ ቅደም ተከተል ነው። | siRNA የ RNAi ኢላማ ቅደም ተከተል ነው። |
| ቅልጥፍና በጂን ማፈን | |
| ዝቅተኛ በCRISPR | በአር ኤን ኤ ውስጥ ከፍተኛ |
| ውጤቶች | |
| የጂኖች መውደቅ በCRISPR ውስጥ ይከሰታል። | ማንኳኳት / ጸጥ ማድረግ በአርኤንኤ ውስጥ ይከሰታል። |
ማጠቃለያ - CRISPR vs RNAi
CRISPR ወይም ክላስተር በመደበኛነት የተጠላለፈ አጭር Palindromic Repeats በተፈጥሮ የሚገኝ የፕሮካርዮቲክ በሽታ የመከላከል ዘዴ ሲሆን በቅርብ ጊዜ ለ eukaryotic ጂን አርትዖት እና ማሻሻያ ስራ ላይ ውሏል። አር ኤን ኤ ወይም አር ኤን ኤ ጣልቃ ገብነት ከኒውክሊክ አሲዶች ጋር የሚያገናኝ እና የጂን አገላለፅን የሚቆጣጠር ትንሽ ባለ ሁለት ገመድ አር ኤን ኤ በማስተዋወቅ ጂኖችን ዝም ለማሰኘት ተከታታይ-ተኮር ዘዴ ነው። ይህ በ CRISPR እና RNAi መካከል ያለው መሠረታዊ ልዩነት ተደርጎ ሊወሰድ ይችላል። ሁለቱም ቴክኒኮች፣ CRISPR/Cas እና RNAi፣ ለጂን መጠቀሚያዎች ኃይለኛ መሳሪያዎች ናቸው ምንም እንኳን CRISPR/Cas በእርግጠኝነት ከአርኤንአይኤን የበለጠ የላቀ ነው ምክንያቱም ሁለቱንም ማስገባት እና መሰረዝን ለማነሳሳት ጥቅም ላይ ሊውል ይችላል። ልዩነቱ በCRISPR/Cas ስርዓት ከፍተኛ ነው።
የ CRISPR vs RNAi የፒዲኤፍ ስሪት አውርድ
የዚህን ጽሁፍ ፒዲኤፍ ስሪት አውርደው እንደ ጥቅስ ማስታወሻ ከመስመር ውጭ ዓላማ መጠቀም ይችላሉ። እባኮትን የፒዲኤፍ ሥሪት እዚህ ያውርዱ በCRISPR እና RNAi መካከል ያለው ልዩነት
