የቁልፍ ልዩነት - ፉሽን vs ታቅ ፖሊመሬሴ
ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴዎች በሞለኪውላር ባዮሎጂ ቴክኒኮች በስፋት ጥቅም ላይ የሚውሉ ኢንዛይሞች ሲሆኑ በተፈጥሮ በዲኤንኤ መባዛት በሚደረግባቸው ፍጥረታት ውስጥም ይገኛሉ። በማባዛት ወቅት የሚያካትቱ ቁልፍ ፖሊመሪንግ ኢንዛይሞች ናቸው። ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ኑክሊዮታይድ ወደ 3′ ነፃ የዲ ኤን ኤ ገመዱ ጫፍ በመጨመር አዲስ ፈትል እንዲራዘም ያደርጋል። በአሁኑ ጊዜ በሞለኪውላር ባዮሎጂ በበሽታ መመርመሪያ እና በኢንዱስትሪ አፕሊኬሽኖች ውስጥ በተፈጠሩት እድገቶች ምክንያት የተለያዩ ጠቃሚ ባህሪያት ያላቸውን ፖሊመሬሶችን ማምረት አስፈላጊ ነው. ይህ ዘዴው ትክክለኛነት እንዲጨምር እና የበለጠ ፈጣን ዘዴ ያደርገዋል.ፉዥን እና ታክ ፖሊሜሬሴ በልዩ ሞለኪውላዊ አፕሊኬሽኖች ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውሉ ሁለቱ በገበያ የሚመረቱ ቴርሞስታብል ፖሊመሬሴ ኢንዛይሞች ናቸው። ፉዥን ከፓይሮኮከስ ፉሪየስ የነጠለ ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ነው እና ታማኝነትን ለመጨመር በዋናነት በክሎኒንግ ሙከራዎች ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል። ታክ ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ በፖሊሜራስ ሰንሰለት ምላሽ (PCR) ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውለው መደበኛ የዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ነው፣ እና ከሙቀት መቆጣጠሪያ ባክቴሪያ ተለይቷል፤ Thermus aquaticus. በሁለቱ ኢንዛይሞች መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ምንጭ ረቂቅ ተሕዋስያን ነው. ፉዥን ከኤክስሬሞፊል፣ ፒሮኮከስ ፉሪዮስስ፣ ታክ ፖሊሜሬሴ ግን ከቴርሞፊል፣ Thermus aquaticus ተነጥሏል።
Phusion ምንድን ነው?
Phusion DNA polymerase ኤንዛይም ከፒሮኮከስ ፉሪዮስ በመለየት የሚመረተው ልቦለድ ፖሊመሬሴ ነው፣ይህም አክራሪ አርኬያ ነው። እነዚህ ረቂቅ ተህዋሲያን እጅግ በጣም ከፍተኛ በሆነ የሙቀት መጠን ውስጥ ይኖራሉ, በዚህም ፖሊሜሬዝ ከፍተኛ ሙቀት-የተረጋጋ ፖሊመሬሴስ ያደርገዋል. ፉዥን ፖሊሜሬዝ በተለመደው ቴርሞስታብል ፖሊሜሬዝ ላይ ከፍተኛ ታማኝነትን ለማግኘት ይጠቅማል; Taq polymerase.ፉዥን ፖሊሜሬዝ ረጅም አብነቶችን እስከ 7.5 ኪ.ቢ. የጂኖም ዲ ኤን ኤ ማጉላት ይችላል። የPhusion polymerase ምርጥ ፖሊሜራይዜሽን አቅም 720 C ነው። ፉዥን በክሎኒንግ ምርቶች ላይም ለቅደም ተከተል፣ ለመግለፅ እና ለሚውቴሽን ትንተና ጥቅም ላይ ይውላል።
Phusion DNA polymerase 3'-5' exonuclease እንቅስቃሴ አለው። ይህ ከተዋሃደ በኋላ አዲስ የተሰራውን ፈትል ማረም ያስችላል። ስለዚህ የኑክሊዮታይድ አለመመጣጠን በቀላሉ ይስተካከላል። ስለዚህ, ያነሰ የስህተት መጠን አለው. የPhusion polymerase አጠቃላይ ጥቅሞች፤ ናቸው።
- እጅግ ታማኝነት
- ከፍተኛ ፍጥነት እና የተቀነሰ የኤክስቴንሽን ጊዜ
- ጠንካራ ምላሾች እና አነስተኛ ማመቻቸትን ይፈልጋል
- ከፍተኛ ምርት
ሥዕል 01፡ ፊዚዮን
የPhusion polymerase ዋነኛ ጉዳቱ ዲኦክሲዩሪዲን ትሪፎስፌት (dUTP) ሲኖር መከልከሉ ነው። dUTPs በምላሽ ድብልቅ ውስጥ ሲከማች፣ የPhusion polymerase ድርጊቶችን ሊገታ ይችላል። ይህ ኢንዛይሙን ከመጨመራቸው በፊት የምላሽ ድብልቅን ከ dUTPase ጋር በማከም ይከላከላል። በአሁኑ ጊዜ፣ ለዚህ ችግር መፍትሄ ከPhusion polymerase ይልቅ የDUTP ተከላካይ የPhusion polymerase ተለዋጭ Pfu Turbo ጥቅም ላይ ይውላል።
Taq Polymerase ምንድነው?
Taq DNA polymerase ፈጠራ የሞለኪውላር ባዮሎጂ መስክ ላይ ለውጥ አድርጓል። በዲኤንኤ ማጉላት ላይ ትልቅ ችግር ፈቷል. ታክ ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ከቴርሞፊል ባክቴሪያ ቴርሙስ አኳቲከስ የወጣ እና የሚገለል የሙቀት የተረጋጋ ፖሊሜሬሴ ኢንዛይም ነው። የዚህ ኢንዛይሞች ግኝት የ PCR እድገትን ያመጣል. ይህ ኢንዛይም ከተለመደው አድካሚ ክሎኒንግ ቴክኒኮች ይልቅ የ polymerase chain reaction በዲ ኤን ኤ ማጉላት ውስጥ እንዲጠቀም ፈቅዷል።PCR አሁን በሞለኪውላር ምርመራ፣ በግብርና እና በኢንዱስትሪ መስኮች በቴክኒኩ ላይ ብዙ አዳዲስ ልዩነቶች ተጨምረዋል።
ምስል 02፡ Taq Polymerase
Taq DNA polymerase በ720C - 800C መካከል ባለው ምርጥ የሙቀት መጠን ይሰራል። ታክ ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴስ የጋራ መጠቀሚያ ያስፈልገዋል; ማግኒዥየም ለተግባሩ. Taq polymerase 3'-5' የማረም ችሎታ የለውም፣ስለዚህ የTaq DNA polymerase የስህተት መጠን ከአዳዲስ የዲኤንኤ ፖሊመሬሴዎች እንደ ፉዥን ፖሊመሬሴ ወዘተ ጋር ሲወዳደር ከፍተኛ ነው።ነገር ግን የTaq DNA polymerase ተወዳጅነት አሁንም ድረስ በኢንዛይም ምቹነት እና ተለዋዋጭነት ምክንያት በመላው የሳይንስ አለም።
በPhusion እና Taq polymerase መካከል ያሉ ተመሳሳይነቶች ምንድን ናቸው?
- ሁለቱም ፉዥን እና ታቅ ፖሊሜሬዝ ኢንዛይሞች ፖሊመራይዝድ ኢንዛይሞች ሲሆኑ ኑክሊዮታይድን ወደ 3′ ነፃ የዲ ኤን ኤ ስትራንድ ማከል የሚችሉ።
- ሁለቱም ፊዚዮን እና ታክ ፖሊመሬሴዎች ፖሊሜራይዜሽን ለመጀመር የመጀመሪያ ደረጃ ቅደም ተከተል ያስፈልጋቸዋል።
- ሁለቱም ፉሽን እና ታክ ፖሊመሬሴዎች ሙቀት የተረጋጋ ናቸው።
- ሁለቱም Phusion እና Taq polymerases በ PCR ስልቶች ዲኤንኤን ለመጨመር ያገለግላሉ።
- ፖሊመሬዜን ወደ ምላሹ ውህድ ሲጨምሩ ሁለቱም ፉሽን እና ታክ ፖሊሜሬሴዎች የኢንዛይሙን ውጤታማነት ለማረጋገጥ በመጨረሻ ይጨመራሉ።
- ሁለቱም ፉሽን እና ታክ ፖሊመሬሴዎች ለሞለኪውላር ባዮሎጂ የሙከራ ዓላማዎች የተዋሃዱ ናቸው።
- ሁለቱም ፊዚዮን እና ታክ ፖሊመሬሴዎች ተግባሩን ለማጠናቀቅ ኮፋክተር ያስፈልጋቸዋል።
በPhusion እና Taq Polymerase መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Phusion vs Taq Polymerase |
|
Phusion ከፓይሮኮከስ ፉሪዮስ የነጠለ ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ነው እና ታማኝነትን ለመጨመር በዋናነት በክሎኒንግ ሙከራዎች ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል። | Taq DNA Polymerase በPolymerase Chain Reaction (PCR) ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውለው መደበኛ ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ ነው፣ እና ቴርሞስ አኳቲከስ ከሚባለው ቴርሞስ አኳቲከስ ተነጥሏል። |
ምንጭ ኦርጋኒዝም | |
Phusion ከጽንፈኛ አርኬያ - ፒሮኮከስ ፉሪዮስ የወጣ ነው። | እነዚህ የስነ-ጽሁፍ ስራዎች ከቅኝ ግዛት እስከ ቅኝ ግዛት ዘመን ድረስ ያሉ ናቸው። |
የማንበብ ችሎታ | |
3'-5' የማንበብ ችሎታ በPhusion ውስጥ አለ። | 3'-5' የማንበብ ችሎታ በTaq polymerase የለም። |
ታማኝነት | |
ከፍተኛ ታማኝነት ከPhusion ጋር አለ። | Taq polymerase ዝቅተኛ ታማኝነትን ያሳያል። |
ማጉላት | |
Phusion ረጅም የዲኤንኤ ቁርጥራጮችን ማጉላት ይችላል። | Taq polymerase በጣም አጠር ያሉ የDNA ቁርጥራጮችን ማጉላት ይችላል። |
dUTP መርዝ | |
የፉሽን እርምጃ በማከማቸት ታግዷል። | Taq polymerase በdUPT አልተከለከለም። |
ማጠቃለያ - ፉሽን vs ታክ ፖሊሜሬሴ
Phusion እና Taq DNA polymerase በ PCR ቴክኒኮች ጥቅም ላይ የሚውሉ ሁለት የሙቀት መጠን ያላቸው ፖሊመሬሴዎች ናቸው። ፉዥን ከኤክስሬሞፊል፣ ከፒሮኮከስ ፉሪዮስስ፣ ታክ ግን ከቴርሞስከስ ባክቴሪያ ተለይቶ የሚታወቅ ፖሊመሬሴ ነው።የታክ ዲ ኤን ኤ ፖሊሜሬዝ ግኝት ወደ PCR ፈጠራ ይመራል። ፉዥን ከታክ ብዙ ጥቅሞች አሉት ይህም ከፍተኛ ታማኝነት ያለው ዲኤንኤ ለማምረት ፉዮንን የተሻለ አማራጭ አድርጎታል። ሆኖም፣ Taq polymerase አሁንም በ PCR ውስጥ እንደ መደበኛ ፖሊሜሬሴ ኢንዛይም ጥቅም ላይ ይውላል። ይህ በPhusion እና Taq polymerase መካከል ያለው ልዩነት ነው።