በናኖፖር እና በኢሉሚና ቅደም ተከተል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ናኖፖር ተከታታይ የሶስተኛ ትውልድ ተከታታይ ቴክኒክ ሲሆን የዲኤንኤ ሞለኪውልን ቅደም ተከተል ለማወቅ ናኖፖርን የሚጠቀም ሲሆን የኢሉሚና ቅደም ተከተል ደግሞ የሚቀለበስ የሁለተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ዘዴ ነው የዲኤንኤ ሞለኪውል ቅደም ተከተል ለማወቅ ማቅለሚያ ቴርሚናተሮች ቴክኖሎጂ።
የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ትክክለኛ ኑክሊዮታይድ ወይም የዲኤንኤ ሞለኪውል መሠረት ቅደም ተከተል መወሰን ነው። ባዮሎጂያዊ እና የሕክምና ምርምር ግኝቶችን የሚያፋጥኑ የኑክሊክ አሲድ ቅደም ተከተሎችን ለመወሰን ብዙ ፈጣን ዘዴዎች አሉ. ከመጀመሪያዎቹ የዲኤንኤ ሴኪውሲንግ ቴክኒኮች አንዱ (Sanger sequencing) በFredrick Sanger በ1975 በኤምአርሲ ሴንተር፣ ካምብሪጅ፣ ዩኬ ውስጥ የፕሪመር ኤክስቴንሽን ስትራቴጂን በመከተል ተዘጋጅቷል።ዛሬ፣ አብዛኛው ፈጣን የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ቴክኒኮች የሁለተኛው ትውልድ (የሚቀጥለው ትውልድ) እና የሶስተኛ ትውልድ ዲኤንኤ ቅደም ተከተል ምድቦች ናቸው። ናኖፖሬ እና ኢሉሚና ቅደም ተከተል ሁለት አዳዲስ የዲኤንኤ ቴክኖሎጂዎች ናቸው።
የናኖፖሬ ቅደም ተከተል ምንድን ነው?
የናኖፖር ቅደም ተከተል የዲ ኤን ኤ ሞለኪውል የኒውክሊክ አሲድ ቅደም ተከተል ለማወቅ ፕሮቲን ናኖፖርን የሚጠቀም የሶስተኛ ትውልድ ተከታታይ ቴክኒክ ነው። በናኖፖር ቅደም ተከተል ፣ በናኖፖር ውስጥ የሚያልፍ ዲ ኤን ኤ የአሁኑን ይለውጣል። ይህ ለውጥ በዲ ኤን ኤ ቅደም ተከተል ቅርፅ, መጠን እና ርዝመት ይወሰናል. የውጤቱ ምልክት የተወሰነውን ዲ ኤን ኤ ወይም አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ለማግኘት ይገለጣል። ይህ ዘዴ የተሻሻሉ ኑክሊዮታይዶችን አይፈልግም፣ እና የሚሰራው በእውነተኛ ጊዜ ነው።
ሥዕል 01፡ የናኖፖሬ ቅደም ተከተል
ኦክስፎርድ ናኖፖሬ ቴክኖሎጂዎች በርካታ የናኖፖር ተከታታይ መሳሪያዎችን የሚያመርት ታዋቂ ኩባንያ ነው። አብዛኛዎቹ የኦክስፎርድ ናኖፖር ተከታታይ መሳሪያዎች የወራጅ ሴሎች አሏቸው። ይህ ወራጅ ሴል ኤሌክትሮ ተከላካይ በሆነው ሽፋን ውስጥ የተካተቱ በርካታ ጥቃቅን ናኖፖሮች አሉት። እያንዳንዱ ናኖፖር ከራሱ ኤሌክትሮል ጋር ይዛመዳል. ይህ ኤሌክትሮድ ወደ ሰርጥ እና ዳሳሽ ቺፕ ይገናኛል. ይህ ኤሌክትሮድ በ nanopore ውስጥ የሚፈሰውን የኤሌክትሪክ ፍሰት ይለካል. አንድ ሞለኪውል በናኖፖር ውስጥ ሲያልፍ አሁን ያለው ሁኔታ ይለወጣል ወይም ይስተጓጎላል። ከዚህም በላይ ይህ መስተጓጎል የባህሪ ማሽኮርመም ይፈጥራል. ይህ squiggle የዲኤንኤ ወይም አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል በቅጽበት ለመወሰን ዲኮድ ይደረጋል።
የኢሉሚና ቅደም ተከተል ምንድን ነው?
የኢሉሚና ቅደም ተከተል የዲኤንኤ ሞለኪውሎች ቅደም ተከተል ለማወቅ የሚቀለበስ ቀለም ተርሚናተሮች ቴክኖሎጂን የሚጠቀም የሁለተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ቴክኒክ ነው። አሁን የኢሉሚና ኩባንያ አካል የሆነው ሶሌክስ ኩባንያ በ1998 ተመሠረተ።
ስእል 02፡ ኢሉሚና ተከታታይነት
በኢሉሚና ቅደም ተከተል ዘዴ፣ ናሙናው መጀመሪያ ወደ አጭር ክፍሎች ይከፈታል። ስለዚህ, በኢሉሚና ቅደም ተከተል, 100-150bp አጭር ንባቦች ወይም ቁርጥራጮች መጀመሪያ ላይ ይፈጠራሉ. እነዚህ ቁርጥራጮች ከአጠቃላይ አስማሚዎች ጋር ተጣብቀው ወደ ስላይድ ተጣብቀዋል። PCR የሚከናወነው እያንዳንዱን ክፍልፋዮች ለማጉላት ነው። ይህ ብዙ ተመሳሳይ ቁርጥራጮች ያሉት ቦታ ይፈጥራል። በኋላ, ወደ ነጠላ-ክር ተለያይተዋል እና በቅደም ተከተል ይከተላሉ. ተከታታይ ስላይድ በፍሎረሰንት የተለጠፈ ኑክሊዮታይድ፣ ዲ ኤን ኤ ፖሊመሬሴ እና ተርሚናተር ይዟል። በተርሚናተሩ ምክንያት, በአንድ ጊዜ አንድ መሠረት ብቻ ይጨመራል. እያንዳንዱ ዑደት ማብቂያ ይወገዳል, እና የሚቀጥለውን መሠረት በጣቢያው ላይ ለመጨመር ያስችላል. በተጨማሪም, በፍሎረሰንት ምልክቶች ላይ በመመስረት, ኮምፒዩተሩ በእያንዳንዱ ዑደት ውስጥ የተጨመረውን መሰረት ይገነዘባል.የኢሉሚና ተከታታይ ቴክኖሎጂ ከ4 እስከ 56 ሰአታት ውስጥ ቅደም ተከተሎችን ይገነባል።
በናኖፖሬ እና ኢሉሚና ቅደም ተከተል መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- Nanopore እና illumina sequencing ሁለት ተከታታይ ቴክኒኮች ናቸው።
- ሁለቱም ፈጣን እና አዲስ የቅደም ተከተል ዘዴዎች ናቸው።
- የዲኤንኤ እና የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን ለማወቅ ይጠቅማሉ።
- ሁለቱም ከፍተኛ ትክክለኛነት አላቸው።
በናኖፖሬ እና በኢሉሚና ቅደም ተከተል መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
የናኖፖር ቅደም ተከተል የዲኤንኤ ሞለኪውሎች ቅደም ተከተል ለማወቅ ናኖፖርን የሚጠቀም የሶስተኛ ትውልድ ተከታታይ ቴክኒክ ነው። በአንፃሩ የኢሉሚና ቅደም ተከተል የዲኤንኤ ሞለኪውሎች ቅደም ተከተል ለማወቅ የሚቀለበስ ቀለም ተርሚናተሮች ቴክኖሎጂን የሚጠቀም የሁለተኛው ትውልድ ቅደም ተከተል ዘዴ ነው። o፣ ይህ በናኖፖር እና በኢሉሚና ቅደም ተከተል መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። ከዚህም በላይ የናኖፖር ቅደም ተከተል ከ92-97% ትክክለኛነት ሲኖረው የኢሉሚና ቅደም ተከተል 99% ትክክለኛነት አለው።
የሚከተለው ኢንፎግራፊክ በናኖፖሬ እና በኢሉሚና ቅደም ተከተል መካከል ያለውን ልዩነት በሰንጠረዥ መልኩ ይዘረዝራል።
ማጠቃለያ - ናኖፖሬ vs ኢሉሚና ቅደም ተከተል
የከፍተኛ-ተከታታይ ቴክኒኮች ሁለተኛ-ትውልድ (አጭር-ተነባቢ) እና ሶስተኛ-ትውልድ (ረጅም-የተነበበ) ቅደም ተከተል ዘዴዎችን ያካትታሉ። ናኖፖሬ እና ኢሉሚና ቅደም ተከተል የሶስተኛ-ትውልድ እና ሁለተኛ-ትውልድ (ቀጣዩ-ትውልድ) የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ምድቦች የሆኑ ሁለት አዳዲስ የዲኤንኤ ቴክኖሎጂዎች ናቸው። የናኖፖር ቅደም ተከተል የዲኤንኤ ሞለኪውሎችን ቅደም ተከተል ለማወቅ ናኖፖርን ይጠቀማል። በሌላ በኩል የኢሉሚና ቅደም ተከተል የዲ ኤን ኤ ሞለኪውሎችን ቅደም ተከተል ለማወቅ የሚቀለበስ ቀለም ተርሚናተሮችን ይጠቀማል። ስለዚህም ይህ በናኖፖሬ እና በኢሉሚና ቅደም ተከተል መካከል ያለው ልዩነት ማጠቃለያ ነው።
