በሲዲኤስ እና በ ORF መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ሲዲኤስ ትክክለኛው የጂን ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ሲሆን ወደ ፕሮቲን የሚተረጎም ሲሆን ORF ደግሞ በትርጉም ማስጀመሪያ ቦታ (መጀመሪያ ኮዶን) የሚጀምር እና የሚጨርሰው የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ነው። የትርጉም ማቋረጫ ጣቢያ (ኮዶን አቁም)።
አንድ ጂን ኮድ ማድረጊያ ቅደም ተከተል (ሲዲኤስ) አለው። እሱ አጠቃላይ የጂን እና የመነሻ ኮድን እና የማቆሚያ ኮድን ያካትታል። ፕሮቲኑን የሚተረጉመው እና የሚያመነጨው ትክክለኛው የጂን ክፍል ነው። ክፍት የንባብ ፍሬም ወይም ORF በመነሻ ኮድን እና በማቆሚያ ኮድ መካከል የሚገኝ የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ነው። በ ORF ውስጥ ወደ ፕሮቲን የሚተረጎመውን የዘረመል ኮድ የሚያቋርጥ የማቆሚያ ኮድን የለም።በፕሮካርዮት ውስጥ፣ የጂን ሲዲኤስ እና ORF ተመሳሳይ ናቸው።
ሲዲኤስ ምንድን ነው?
ሲዲኤስ ወይም ኮድ ማድረጊያ ቅደም ተከተል በትክክል ወደ ፕሮቲን የሚተረጎመው የጂን አካል ነው። ኤክሰኖች እና ሁለት ኮዶን (AUG codon) እና ስቶፕ ኮዶን በመባል የሚታወቁትን ያካትታል። CDS ሁለት ያልተተረጎሙ ክልሎችን አልያዘም: 5' UTR እና 3 UTR. በተጨማሪም፣ መግቢያዎች በሲዲኤስ ውስጥ አይካተቱም።
ስእል 01፡የመቀየሪያ ቅደም ተከተል
ከአንድ ግለሰብ አጠቃላይ ጂኖም ጋር ሲወዳደር፣የኮድ ቅደም ተከተሎች ትንሽ ክፍልፋይ ናቸው። የኮድ ቅደም ተከተል የፕሮቲን አሚኖ አሲድ ቅደም ተከተል ለመፍጠር አስፈላጊውን የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ያካትታል. ስለዚህ ሲዲኤስ ወደ ኑክሊዮታይድ ትሪፕሌትስ ወይም ኮዶን ሊከፋፈሉ የሚችሉ ኤክሰኖች ናቸው። ኮዶኖች አሚኖ አሲዶችን ይፈጥራሉ።
ኦአርኤፍ ምንድን ነው?
የክፍት የማንበብ ፍሬም ወይም ORF በጅማሬ ኮዶን የሚጀምር እና በቆመ ኮድን የሚጨርሰው የኑክሊዮታይድ ተከታታይ ዝርጋታ ነው።በቀላል ቃላት፣ ORF የሚያመለክተው በመነሻ እና በማቆሚያ ኮዶች መካከል የሚገኘውን የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ክልል ነው። በመካከል፣ ORFን የሚያቋርጥ የማቆሚያ ኮድ የለም። በመነሻ እና በማቆሚያ መካከል ያለው የኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተል ኮዶን ለአሚኖ አሲዶች ይመሰክራል። ባጠቃላይ የመጀመርያ ኮዶን ATG ሲሆን የማቆሚያ ኮዶች TAG፣TAA እና TGA ናቸው። ORF ሲገለበጥ እና ሲተረጎም የሚሰራ ፕሮቲን ይሰጣል። ስለዚህ፣ ORF ጅምር ኮድን፣ በመካከለኛው ክልል ውስጥ ያሉ በርካታ ኮዶችን እና የማቆሚያ ኮድን ያካትታል። የሚገርመው፣ ORF በሦስት ሊካፈል የሚችል ርዝመት አለው።
ስእል 02፡ የንባብ ፍሬም ክፈት
በፕሮካርዮት ውስጥ፣ ምንም መግቢያዎች ስለሌለ፣ ORF የጂን ኮድ ማድረጊያ ቅደም ተከተል ነው ወደ ኤምአርኤን በቀጥታ የሚገለበጥ። ስለዚህ፣ CDS እና PRF በፕሮካርዮት ውስጥ አንድ ናቸው። በፕሮካርዮት ውስጥ ጂኖችን በሚፈልጉበት ጊዜ ORF ን ማግኘት እና በፕሮካርዮት ውስጥ ጂን ማግኘት ቀላል ነው።በ eukaryotes ውስጥ፣ ኢንትሮኖች ስላሉ፣ ORF ከሂደቱ በኋላ ወይም አር ኤን ኤ ከተሰነጣጠለ በኋላ የሚፈጠረው የኮዶን ቅደም ተከተል ነው። ORF የጂን አካል እስከሆነ ድረስ የጂን ትንበያ የሚረዳ ማስረጃ ነው።
በሲዲኤስ እና ORF መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- በፕሮካርዮትስ፣ ሲዲኤስ እና ORF ተመሳሳይ ናቸው።
- ሁለቱም ኮዶን ጀማሪ እና ኮድን ያቆማሉ።
- በሶስት የሚከፈሉ በርካታ ኑክሊዮታይዶች አሏቸው።
- ከተተረጎሙ በኋላ የአሚኖ አሲድ ቅደም ተከተሎችን ያመርታሉ።
በሲዲኤስ እና ORF መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
ሲዲኤስ ወደ ፕሮቲን የሚተረጎመው ትክክለኛው የጂን ክፍል ሲሆን ORF ደግሞ በመነሻ ኮድን እና በስቶክ ኮድን መካከል ያለው የዲ ኤን ኤ መወጠር ነው። ስለዚህ፣ ይህ በሲዲኤስ እና ORF መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው። በተጨማሪም ሲዲኤስ ኢንትሮኖችን አልያዘም ነገር ግን ORF ኢንትሮኖችን ሊይዝ ይችላል። ሲዲኤስ ሙሉ በሙሉ ወደ ሙሉ የኤምአርኤንኤ ቅደም ተከተል ይገለበጣል፣ ORF ደግሞ የ mRNA ቅደም ተከተል አካል ሊሆን ይችላል።ስለዚህ፣ ይህ በሲዲኤስ እና ORF መካከል ያለው ሌላ ልዩነት ነው።
ከታች የመረጃ ሥዕላዊ መግለጫዎች በCDS እና ORF መካከል ያለውን ልዩነት ጎን ለጎን።
ማጠቃለያ - CDS vs ORF
CDS እና ORF የጂን ሁለት ጠቃሚ ክፍሎች ናቸው። ሲዲኤስ የሚያመለክተው ወደ ፕሮቲን የሚተረጎመውን የዲኤንኤ ትክክለኛ ክልል ነው። ORF በመነሻ ኮድን “ATG” የሚጀምር የዲኤንኤ ቅደም ተከተል ነው እና በማንኛውም የሶስቱ ማብቂያ ኮዶች (TAA፣ TAG ወይም TGA) ያበቃል። ORF የጂን ሙሉ ኤምአርኤን አካል ሊሆን ይችላል። ነገር ግን፣ የጂን ኮድ ማድረጊያ ቅደም ተከተል የኤምአርኤን ቅደም ተከተል ለማጠናቀቅ ይገለበጣል። ሁሉም ሲዲኤስ ORFዎች ናቸው። ግን ሁሉም ORFዎች ሲዲኤስ አይደሉም። ስለዚህ፣ ይህ በCDS እና ORF መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል።
