በሜታጂኖሚክስ እና በሜታራንስክሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት በእያንዳንዱ አካባቢ በተጠናው የባዮሞለኪውሎች አይነት ላይ ነው። Metagenomics ዲኤንኤን፣ ቅደም ተከተሎቹን እና በህዋሳት ውስጥ ያለውን ባህሪ ያጠናል፣ ሜታትራንስክሪፕቶሚክስ ግን የተገለበጠውን ዲኤንኤ፣ በዋናነት የኤምአርኤን ቅደም ተከተል እና በኦርጋኒክ ውስጥ ያለውን ባህሪ ያጠናል።
Metagenomics እና metatranscriptomics ከጥቃቅን ማህበረሰብ ጋር በተያያዘ ባለፉት አመታት ብዙ ተወዳጅነትን ያተረፉ ሁለት መስኮች ናቸው። በጤና አጠባበቅ, በኢንዱስትሪ እና በግብርና ባዮቴክኖሎጂ ውስጥ አስፈላጊ ናቸው. ሁለቱም ሜታጂኖሚክስ እና ሜታራንስክሪፕቶሚክስ በማህበረሰቡ ውስጥ ያሉ ግለሰባዊ ፍጥረታትን እና ጠቃሚ ወይም ጎጂ የሆኑትን ተግባራዊ ሚናዎቻቸውን ለማጥናት ይፈቅዳሉ።
Metagenomics ምንድን ነው?
Metagenomics ዲኦክሲራይቦኑክሊክ አሲድ (ዲ ኤን ኤ) የሚዳስስ የጥናት መስክ ነው። ከማይክሮባላዊ ማህበረሰብ ጋር በጣም ጠቃሚ ነው. እንዲሁም, ከጂኖሚክስ ጋር ሲነጻጸር የበለጠ የላቀ መስክ ነው. በጂኖሚክስ ውስጥ የአንድ የተወሰነ ፍጥረታት ዲ ኤን ኤ ትንተና ይካሄዳል. ይሁን እንጂ ሜታጂኖሚክስ በአንድ ማህበረሰብ ማህበረሰብ ውስጥ የጄኔቲክ ቁሳቁሶችን መመርመርን ያካትታል. ስለዚህ፣ ይህ የአንድን ሁኔታ ወይም አንድ አካባቢን የሚመለከቱ የኦርጋኒክ ማህበረሰብ ባህሪን ለማጥናት ያስችላል።
ምስል 01፡ ሜታጅኖሚክስ
በሜታጂኖሚክስ ጥናቶች ውስጥ የሚካተተው ዋናው ቴክኒክ የሚቀጥለው ትውልድ ቅደም ተከተል (ኤንጂኤስ) ማይክሮ አራራይ ቴክኖሎጂን ይጠቀማል። የኤንጂኤስ ዘዴዎች ለተወሰኑ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች መኖር ወይም አለመገኘት በአንድ ምላሽ ውስጥ ብዙ ህዋሳትን መተንተን ይችላሉ።እነዚህ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች ለአንድ በሽታ ሁኔታ ወይም ለአካባቢያዊ ሁኔታ ተጠያቂ ሊሆኑ ይችላሉ. ስለዚህ የሜታጂኖሚክ እውቀትን በመጠቀም ህዋሳትን ማጣራት በቀላሉ እና በትክክል ይከናወናል። በኤንጂኤስ ጊዜ ቅደም ተከተል የሚከናወነው በአጭር ንባቦች ነው እና የኦርጋኒክ ዲ ኤን ኤ መገለጫ ይከናወናል። የ16ኛው ዲኤንኤ ቅደም ተከተል ረቂቅ ተሕዋስያንን በሚመለከት በሜታጂኖሚክስ የተጠና ታዋቂ ቅደም ተከተል ነው።
የሕብረ ህዋሳትን ቅደም ተከተል ተከትሎ የስርዓተ-ፆታ አሰላለፍ መከናወን አለበት። እንደ መሰረታዊ የአካባቢ አሰላለፍ ቅደም ተከተል መሳሪያ (BLAST) ያሉ መሳሪያዎች የማስተካከል ስራን ለመፈፀም ስራ ላይ ናቸው። አሰላለፉን ተከትሎ፣ ፋይሎጄኔቲክ ዛፍ በማህበረሰቡ ውስጥ ያለውን የእያንዳንዱን አካል ግንኙነት እና ባህሪውን በተመለከተ ዝርዝር መረጃ ይሰጣል።
Metatranscriptomics ምንድን ነው?
Metatranscriptomics የሰውነት ግልባጭን የሚመለከት የጥናት መስክ ነው። ትራንስክሪፕቱ በዲኤንኤ ግልባጭ ወቅት የተገለበጡትን ሁሉንም የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን ያካትታል።በትራንስክሪፕት ውስጥ የሚገኙት mRNA ቅደም ተከተሎች ስለ ጄኔቲክ አገላለጽ መረጃ ይሰጣሉ. Metatranscriptomics በሕዝብ ወይም በማህበረሰቦች ውስጥ ያሉ የበርካታ ግልባጮች ትንተና ነው።
ሥዕል 02፡ ግልባጭ ትንተና
የሜታራንስክሪፕቶሚክስ ጥናቶች የአጭር ንባብ ቅደም ተከተሎችን ለማግኘት ማይክሮ አራራይ ቴክኖሎጂዎችንም ይጠቀማሉ። በተጨማሪም ሜታራንስክሪፕቶሚክስ አሰላለፍ መሳሪያዎችን እና የዛፍ ዲዛይን ዘዴዎችን በመጠቀም የተሟላ የባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔን ያካትታል። ሆኖም፣ የሜታራንስክሪፕቶሚክስ መስክ ከሜታጂኖሚክስ ጋር ሲወዳደር በጣም ከባድ ነው። ኤምአርኤን ወይም አር ኤን ኤ በአጠቃላይ ማውጣት እንደሚመስለው ቀላል አይደለም. አር ኤን ኤ ለመጥፋት በጣም የተጋለጠ እና በጣም አጭር የህይወት ጊዜ ስላለው የእነዚህን ጥገና እና ማከማቻነት መጠይቅ ሊሆን ይችላል።
በMetagenomics እና Metatranscriptomics መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- Metagenomics እና ሜታ ትራንስክሪፕቶሚክስ የአካል ህዋሳትን ማህበረሰቦች በዋናነት የማይክሮቢያዊ ማህበረሰቦችን ለመተንተን ከፍተኛ የፍተሻ ቴክኒኮች ናቸው።
- ሁለቱም ቴክኒኮች ግኝቶቹን ለማወቅ ማይክሮ አራራይ ቴክኖሎጂን ይጠቀማሉ።
- የተገኘው ውጤት ብዙ ጊዜ BLAST alignment እና Phylogenetic ዛፎችን በመጠቀም ነው የሚተነተነው።
- ከዚህም በላይ ሁለቱም ቴክኒኮች የሚያተኩሩት በአንድ አካል ላይ ሳይሆን በቡድን ወይም በማህበረሰብ አካላት ላይ ነው።
- ከዚህም በተጨማሪ ሁለቱም ጽንሰ-ሀሳቦች በአብዛኛው የሚጠናው ከማይክሮቦች ጋር በተያያዘ ነው - ዋናው ምክንያት የሚጫወቱት የተለያየ ሚና ነው።
በMetagenomics እና Metatranscriptomics መካከል ያለው ልዩነት ምንድን ነው?
Metagenomics እና Metatranscriptomics በአንድ ፍጥረታት ማህበረሰብ ውስጥ የጄኔቲክ ቁስ ትንተናን ያካትታሉ። ስለዚህም ሜታጂኖሚክስ የዲኤንኤ ንድፎችን እና ቅደም ተከተሎችን ይመለከታል፣ ሜታትራንስክሪፕት ግን የኤምአርኤን ወይም የተገለበጠውን ዲኤንኤ ትንታኔን ይመለከታል።ስለዚህ፣ በሜታጂኖሚክስ እና በሜታትራንስክሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ይህ ነው።
ከተጨማሪም የማውጣት ሂደቱ በሁለቱም ቴክኒኮች ይለያያል። ሜታጂኖሚክስ የዲኤንኤ ማውጣት ሂደቶችን ያካትታል እና ሜታራንስክሪፕቶሚክስ አር ኤን ኤ ማውጣት ሂደቶችን ያካትታል። ስለዚህ፣ ይህ በሜታጂኖሚክስ እና በሜታራንስክሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ጉልህ ልዩነት ነው።
ከታች ያለው ኢንፎግራፊክ በሜታጂኖሚክስ እና በሜታትራንስክሪፕት መካከል ያለውን ልዩነት ያጠቃልላል፡
ማጠቃለያ – Metagenomics vs Metatranscriptomics
Metagenomics እና metatranscriptomics የአንድን ፍጡራን ማህበረሰብ ለተወሰነ ሁኔታ የሚተነትኑ ልብ ወለድ የጥናት መስኮች ናቸው። ስለዚህ, ሜታጂኖሚክስ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎችን ትንተና ያመለክታል. በአንጻሩ፣ ሜታራንስክሪፕቶሚክስ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተሎችን ወይም የተገለበጡ የዲኤንኤ ምርቶችን ትንተና ያመለክታል።በዚህ ረገድ ሜታራንስክሪፕቶሚክስ ለተወሰነ ጉዳይ የጂን መግለጫን መለየት ያስችላል። ሁለቱም ሚውቴሽን እና ውጤቶቻቸውን ለመተንተን አስፈላጊ ናቸው። እነዚህ በቅድመ ምርመራ ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውሉ ፈጣን እና አስተማማኝ ቴክኒኮች ናቸው. ስለዚህ፣ ይህ በሜታጂኖሚክስ እና በሜታራንስክሪፕቶሚክስ መካከል ያለው ልዩነት ማጠቃለያ ነው።
