የቁልፍ ልዩነት - አግድም vs አቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ
Gel electrophoresis በጄኔቲክስ ውስጥ ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ እና ሌሎች ፕሮቲኖችን የያዙ ድብልቆችን እንደየ ክፍላቸው እና ሞለኪውላዊ መጠናቸው ለመለየት የሚያገለግል የላብራቶሪ ዘዴ ነው። በዚህ ዘዴ መለያየት ያለባቸው ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ ወይም ፕሮቲኖች ትንንሽ ቀዳዳዎችን በያዘ ጄል ውስጥ ይካሄዳሉ። ሞለኪውሎቹ በጄል ውስጥ በኤሌክትሪክ መስክ ይንቀሳቀሳሉ. ሞለኪውሎቹ በጄል ቀዳዳዎች ውስጥ ያልፋሉ, እና የእንቅስቃሴው ፍጥነት ከየራሳቸው ርዝመት ጋር ተመጣጣኝ ነው. ስለዚህ ዝቅተኛ ሞለኪውላዊ መጠን ያላቸው ሞለኪውሎች ከፍ ያለ ሞለኪውላዊ ክብደት ካላቸው ሞለኪውሎች በበለጠ ፍጥነት ይጓዛሉ።የኤሌክትሪክ መስክ የተፈጠረው በጄል ሁለት ጫፎች ላይ ባለው የሃላፊነት ልዩነት ነው. አንደኛው ጫፍ አዎንታዊ ክፍያን ይይዛል, ሌላኛው ጫፍ ደግሞ አሉታዊ ክፍያ ይይዛል. የዲ ኤን ኤ እና አር ኤን ኤ ሞለኪውሎች በአሉታዊ መልኩ ስለሚሞሉ፣ አዎንታዊ ወደ ሞላው የጄል መጨረሻ ይሳባሉ። Gel electrophoresis ሁለት የተለያዩ ዘዴዎች ሊሆን ይችላል: አግድም ጄል electrophoresis እና vertical gel electrophoresis. በአግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ውስጥ ፣ ጄል በአግድም አቀማመጥ ውስጥ ይገኛል እና በጄል ሳጥኑ ውስጥ ባለው ቀጣይነት ባለው የሩጫ ቋት ውስጥ ጠልቋል። በ vertical gel electrophoresis ውስጥ ፣ የቋት ስርዓቱ በአቀባዊ ያተኮረ ሲሆን ከላይ እና ከታች በካቶድ እና በአኖድ ላይ ከሚገኙት ሁለት ክፍሎች ጋር ይቋረጣል። ይህ በአግድም እና በአቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ መካከል ያለው ቁልፍ ልዩነት ነው።
አግድም ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ምንድን ነው?
አግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ ወይም ፕሮቲን ሞለኪውሎችን እንደየየሞለኪውላዊ መጠናቸው እና ክፍያ ለመለያየት መሰረታዊ ንድፈ ሃሳብን ይጠቀማል።በዚህ ዘዴ, ጄል በአግድም አቀማመጥ ውስጥ ይገኛል እና ቀጣይነት ባለው ቋት ውስጥ ጠልቋል. Agarose gel የጄል ሳጥኑን በሁለት ክፍሎች ለመለየት ይጠቅማል. የጄል ሳጥኑ አንድ ጫፍ አንኖይድ ሲይዝ ሌላኛው ጫፍ ደግሞ ካቶድ ይዟል. አንድ ጅረት ሲተገበር በዚህ ቴክኒክ ውስጥ ጥቅም ላይ የሚውለው ቋት የኃይል መሙያ ቅልጥፍናን ለመፍጠር ያስችላል። ክፍያው በሚተገበርበት ጊዜ ጄል ይሞቃል. ቋት እንዲሁ እንደ ማቀዝቀዣ ይሠራል፣ ይህም የሙቀት መጠኑን በጥሩ ደረጃ ይጠብቃል። የሩጫውን ቋት እንደገና ማዞር የፒኤች ግሬዲየንት እንዳይፈጠር ይከላከላል። የጄል ሲስተም ሁለቱ ክፍሎች ከሩጫ ቋት ጋር ስለሚገናኙ የተቋረጠ ቋት ሲስተም በአግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ ውስጥ መጠቀም አይቻልም። አሲሪላሚድ የፕሮቲን ድብልቆችን ለመለየት በጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ ጊዜ ጥቅም ላይ ይውላል።
ሥዕል 01፡ አግድም ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ
በአግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ፣ የጄል ሳጥኑ ለኦክስጅን የተጋለጠ በመሆኑ አሲሪላሚድ መጠቀም አይቻልም። ኦክሲጅን በመኖሩ ምክንያት የ acrylamide ፖሊመርዜሽን ታግዷል, እና ይህ በጄል መፈጠር ውስጥ ጣልቃ ይገባል. አግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ዲ ኤን ኤ እና አር ኤን በመለየት ጥቅም ላይ የሚውል ልፋት የሌለበት ዘዴ ነው።
አቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ምንድን ነው?
Vertical gel electrophoresis ቴክኒክ የሚሰራው እንደ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ዋና ፅንሰ-ሀሳብ ነው፣ነገር ግን ከአግድም ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ዘዴ የበለጠ ውስብስብ እንደሆነ ይታሰባል። ይህ ዘዴ የማይቋረጥ ቋት ይጠቀማል። አንድ ካቶድ ከላይኛው ክፍል ውስጥ ይገኛል, እና አኖዶው ከታች ባለው ክፍል ውስጥ ይገኛል. በእያንዳንዱ ክፍል ውስጥ የሚገኙት ኤሌክትሮዶች አስፈላጊውን የኤሌክትሪክ መስክ ይሰጣሉ. በሁለቱ የተገጠሙ የብርጭቆ ሳህኖች መካከል አንድ ቀጭን ጄል ይፈስሳል። ስለዚህ, የጄል የላይኛው ክፍል ከላይኛው ክፍል ውስጥ ይጣበቃል, እና የታችኛው ክፍል ከታች ባለው ክፍል ውስጥ ይጣበቃል.አንዴ አሁኑኑ ከተተገበረ በኋላ, የመጠባበቂያው ትንሽ ክፍል ከላይኛው ክፍል በጄል በኩል ወደ ታችኛው ክፍል ይንቀሳቀሳል. አሁን በዚህ ቴክኒክ ውስጥ የተተገበረው ደቂቃ ክፍሎች ነው።
ምስል 02፡ አቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ
በአቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ፣ ቋት የሚፈሰው በጄል ብቻ ነው። ይህ በመለያየት ደረጃ ላይ ያለውን የቮልቴጅ ቀስ በቀስ በትክክል መቆጣጠር ያስችላል. ክፍሎቹ ለከባቢ አየር ኦክስጅን ስለማይጋለጡ Acrylamide gel መጠቀም ይቻላል. በትንሽ የአክሪላሚድ ጄል ቀዳዳ መጠን ምክንያት ትክክለኛ መለያየት በከፍተኛ ጥራት ሊገኝ ይችላል።
በአግድም እና ቀጥ ያለ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ መካከል ያለው ተመሳሳይነት ምንድን ነው?
- ሁለቱም ስርዓቶች የሚሠሩት በመሠረታዊ የጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ንድፈ ሐሳብ መሠረት ነው።
- አኖድ እና ካቶድ በሁለቱም ሲስተሞች አስፈላጊውን የኤሌክትሪክ መስክ ለማቅረብ ያገለግላሉ።
በአግድም እና ቀጥ ያለ ጄል ኤሌክትሮፊዮርስሲስ መካከል ያለው ልዩነት ምንድነው?
አግድም vs አቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ |
|
| አግድም Gel Electrophoresis ጄል ኤሌክትሮፊሸርስ ቴክኒክ ሲሆን ጄል በአግድም አቅጣጫ ይገኛል። | Vertical Gel Electrophoresis ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ ቴክኒክ ሲሆን ጄል በአቀባዊ አቅጣጫ የሚያተኩርበት ነው። |
| Buffer | |
| አግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ ቀጣይነት ያለው መያዣን ያካትታል። | የሩጫ ቋት በአቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ላይ ይቋረጣል። |
| የአክሪላሚድ አጠቃቀም | |
| አክሪላሚድ ለአግድም ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ ጥቅም ላይ ሊውል አይችልም ምክንያቱም ጄል ሳጥኑ ለከባቢ አየር ኦክስጅን የተጋለጠ ነው። | ጄል በሁለት የተለያዩ ክፍሎች ምክንያት ለከባቢ አየር ኦክሲጅን ያልተጋለጠ በመሆኑ አሲሪላሚድ ለአቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ሊያገለግል ይችላል። |
| ተግባር | |
| አግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ ዲኤንኤ እና አር ኤን ኤ ድብልቆችን ለመለየት ብዙ ጊዜ ጥቅም ላይ ይውላል ግን ፕሮቲኖችን አይጠቀምም። | Vertical gel electrophoresis የፕሮቲን ድብልቆችን ለመለየት ጥቅም ላይ ይውላል። |
ማጠቃለያ - አግድም vs አቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ
Gel electrophoresis የዲ ኤን ኤ፣ አር ኤን ኤ እና ፕሮቲን ሞለኪውሎችን የያዙ ድብልቆችን ለመለየት በስፋት ጥቅም ላይ የሚውል የላብራቶሪ ቴክኒክ ነው። ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ሁለት ዘዴዎች አሉ-አግድም እና ቀጥ ያለ ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ።በአግድም ጄል ኤሌክትሮፊዮራይዝስ ውስጥ ፣ የሩጫ ቋት ቀጣይነት ያለው ሲሆን በአቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ ውስጥ ግን ይቋረጣል። ይህ በአግድም እና በአቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ መካከል ያለው ልዩነት ነው. ሁለቱም ስርዓቶች የሚሠሩት በተለመደው የጄል ኤሌክትሮፊዮርስስ መርህ መሰረት ነው።
የፒዲኤፍ ስሪት አውርድ አግድም vs አቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፎረሲስ
የዚህን ጽሁፍ ፒዲኤፍ ስሪት አውርደው እንደ ጥቅስ ማስታወሻ ከመስመር ውጭ ዓላማ መጠቀም ይችላሉ። እባኮትን የፒዲኤፍ እትም እዚህ ያውርዱ በአግድም እና በአቀባዊ ጄል ኤሌክትሮፊዮሬሲስ መካከል ያለው ልዩነት።
